Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  273  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90601719--90601883
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0
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29
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0
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2.0
17
88
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50
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6
36
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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20
0
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20
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19
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2.5
24
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2.2
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89
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50
75
6
15
3
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
25
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2.1
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2.1
15
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73
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17
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1.16
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2.0
22
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69
4
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1.29
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0
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0
62
40
0
25
35
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90713148--90713181
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16
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1
0
51
1.12
90745843--90745889
21
2.1
22
84
7
60
46
0
0
53
1.00
90750635--90750675
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
90753194--90753218
12
2.1
12
100
0
50
16
8
8
68
1.38
90756415--90756441
11
2.5
11
100
0
54
22
18
18
40
1.91
90760792--90760957
87
1.9
87
98
0
323
35
12
16
35
1.86
90761565--90761594
16
1.9
15
93
6
51
16
0
10
73
1.09
90769133--90769204
33
2.3
33
83
7
96
22
27
22
27
1.99
90777905--90777938
14
2.4
14
95
0
59
26
5
29
38
1.80
90779414--90779451
6
6.3
6
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8
60
81
2
0
15
0.80
90782952--90782999
25
1.9
25
83
8
62
75
4
2
18
1.07
90785454--90785553
51
2.0
51
81
0
119
33
28
17
22
1.96
90785523--90785638
43
2.8
41
84
4
133
31
29
18
20
1.97
90805939--90805985
23
2.0
23
100
0
94
21
17
21
40
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90806585--90806636
27
1.9
27
84
7
70
59
0
7
32
1.26
90807178--90807245
16
4.2
16
94
0
118
27
0
36
35
1.58
90807226--90807316
45
2.0
44
85
2
119
30
5
28
35
1.80
90807461--90807502
15
2.7
16
82
14
52
52
2
0
45
1.13
90807470--90807511
15
2.9
15
82
10
52
52
0
0
47
1.00
90807496--90807682
61
3.1
60
71
14
195
48
6
2
42
1.42
90807580--90807631
15
3.6
15
80
12
56
53
1
0
44
1.11
90807464--90807682
120
1.8
120
97
0
420
48
6
1
42
1.39
90807499--90807683
59
3.1
59
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20
175
48
7
2
42
1.42
90811943--90812007
30
2.1
31
88
5
96
46
1
4
47
1.32
90812209--90812239
2
16.0
2
93
6
55
51
0
0
48
1.00
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6.0
5
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0
51
3
20
0
76
0.92
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18
2.9
17
80
16
59
74
0
1
23
0.92
90829542--90829591
26
2.0
25
84
11
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76
0
2
22
0.89
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21
2.9
22
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9
74
37
1
1
59
1.17
90830175--90830218
10
4.5
10
78
16
56
40
0
0
59
0.98
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40
2.1
39
84
8
107
39
21
7
32
1.80
90832206--90832273
21
3.3
21
68
15
61
38
20
8
32
1.84
90832345--90832430
42
2.0
42
100
0
172
40
23
0
36
1.55
90832668--90832710
22
2.0
22
85
0
59
25
13
4
55
1.58
90833438--90833494
20
2.8
20
79
15
62
52
1
3
42
1.28
90833618--90833692
27
3.0
25
73
21
68
46
0
1
52
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90833645--90833703
21
2.8
21
84
10
59
49
1
0
49
1.11
90835172--90835416
49
4.9
49
83
3
310
27
27
18
26
1.98
90835185--90835416
100
2.3
98
85
2
320
28
27
18
25
1.98
90842287--90842399
45
2.5
45
91
2
174
40
19
18
21
1.91
90842377--90842401
12
2.1
12
100
0
50
40
20
24
16
1.91
90843473--90843519
13
3.5
14
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53
12
8
2
76
1.09
90843795--90843840
3
15.7
3
81
4
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58
2
2
36
1.22
90844035--90844078
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2.0
23
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2
0
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1.13
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0
57
63
0
12
24
1.28
90854063--90854124
10
6.1
10
83
12
74
66
3
8
22
1.33

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316