Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  33  of  316  ( 37835 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Period
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Percent
Indels
Score
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20
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1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9547865--9547894
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34
19
24
21
1.96
9583184--9583327
44
3.3
44
69
9
132
34
18
24
22
1.97
9583051--9583425
88
4.3
88
82
6
415
34
19
24
22
1.96
9583051--9583425
175
2.2
172
86
4
504
34
19
24
22
1.96
9583184--9583415
44
5.3
43
65
18
129
34
19
24
21
1.97
9583668--9583713
24
1.9
24
95
0
83
26
50
2
21
1.60
9584075--9584135
24
2.7
22
78
12
61
29
9
1
59
1.39
9584970--9585271
125
2.4
125
86
1
417
27
14
19
39
1.90
9584970--9585313
125
2.7
124
81
6
399
27
15
18
38
1.91
9593278--9593391
56
2.0
58
84
3
151
46
5
20
28
1.72
9598160--9598199
3
13.3
3
84
10
55
65
0
32
2
1.06
9603394--9603452
29
2.0
29
100
0
118
47
10
13
28
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9603614--9603664
22
2.2
23
89
10
77
19
3
5
70
1.24
9605073--9605104
5
6.6
5
92
7
57
18
0
0
81
0.70
9605073--9605103
9
3.3
9
91
8
53
19
0
0
80
0.71
9609576--9609623
17
2.7
19
81
15
59
68
4
0
27
1.07
9617221--9617264
20
2.4
18
88
11
63
0
34
0
65
0.93
9617314--9617355
16
2.6
16
82
17
52
35
9
0
54
1.33
9617345--9617388
21
2.1
21
87
8
63
38
2
0
59
1.10
9624495--9624561
34
2.0
34
96
0
125
44
5
11
37
1.66
9632444--9632507
30
2.1
30
85
8
85
46
4
6
42
1.49
9633893--9633935
3
14.3
3
85
0
50
34
30
0
34
1.58
9634695--9634780
42
2.0
42
100
0
172
31
6
38
23
1.81
9639394--9639441
24
2.0
24
95
0
87
33
10
33
22
1.88
9645045--9645142
50
2.0
50
100
0
196
34
10
28
26
1.89
9649311--9649384
27
2.7
29
81
14
93
31
8
1
59
1.35
9649448--9649500
27
1.9
28
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3
72
30
5
3
60
1.37
9651314--9651368
29
1.9
28
96
3
101
20
21
25
32
1.97
9653551--9653678
47
2.7
46
87
2
175
25
25
16
32
1.96
9657487--9657530
18
2.4
19
80
3
54
56
0
36
6
1.26
9658740--9658782
21
2.0
21
100
0
86
32
9
39
18
1.83
9664254--9664294
5
8.2
5
84
10
57
19
2
58
19
1.50
9673513--9673663
3
49.0
3
68
15
60
62
1
6
28
1.31
9673717--9673834
3
40.7
3
68
14
52
66
3
4
26
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9673717--9673801
9
8.9
10
72
18
65
67
3
4
24
1.26
9673734--9673814
23
3.5
22
79
12
83
69
1
6
23
1.19
9673714--9673813
45
2.2
44
76
16
107
68
3
6
23
1.26
9675268--9675387
37
3.1
37
65
9
96
29
22
18
30
1.97
9675214--9675428
78
2.8
78
93
0
351
30
21
18
30
1.97
9675229--9675430
41
5.2
40
65
10
130
30
20
17
30
1.96
9676247--9676312
20
3.2
20
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12
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6
22
0
71
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9677262--9677322
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2.4
25
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8
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72
3
11
13
1.24
9678970--9679009
17
2.4
17
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4
55
72
7
2
17
1.19
9685839--9685893
29
1.9
28
85
10
76
67
5
1
25
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316