Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  21  of  316  ( 37835 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6271168--6271501
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1
13
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6332810--6332913
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20
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20
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2.7
172
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19
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6363329--6364278
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218
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1112
31
16
18
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1.93
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294
3.3
288
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6
1130
31
16
18
33
1.93
6364211--6364382
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1.8
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4
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27
19
19
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1.96
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1.8
166
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18
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2.6
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2.9
20
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7
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16
3
76
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.2
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21
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3.8
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3.3
20
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10
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2.0
25
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22
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1.96
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0
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12
2
2
82
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6395334--6395371
16
2.3
17
82
17
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5
5
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1.06
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15
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0
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17
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1.84
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22
2.2
22
85
7
62
81
2
14
2
0.88
6430768--6430834
21
3.2
20
82
14
73
83
0
8
7
0.81
6430802--6430834
7
4.7
7
100
0
66
87
0
0
12
0.53
6431791--6432016
43
5.3
43
67
19
141
33
22
19
24
1.97
6431781--6432070
83
3.4
84
84
5
397
33
22
21
23
1.98
6432072--6433072
207
4.8
207
92
0
1565
30
17
22
29
1.97
6433433--6433592
18
8.9
18
75
19
104
37
10
15
36
1.81
6433440--6433592
35
4.3
35
93
2
252
37
10
15
36
1.81
6433432--6433592
17
8.9
19
85
11
232
37
9
15
36
1.81
6434809--6434917
43
2.5
42
85
2
128
37
26
12
22
1.91
6436489--6436525
15
2.4
16
82
13
51
48
43
8
0
1.32
6437561--6437640
27
3.0
26
83
10
83
37
3
5
53
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6437776--6437817
21
2.0
21
85
0
57
38
9
7
45
1.64
6438200--6438251
21
2.5
21
80
0
59
28
3
5
61
1.37
6453526--6453561
14
2.6
14
90
0
54
22
22
5
50
1.70
6453472--6453684
89
2.4
88
86
1
275
30
17
18
32
1.94
6453650--6453902
54
4.6
54
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1
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30
15
17
37
1.90
6454138--6454249
44
2.5
44
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0
188
20
22
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25
1.98
6455975--6456022
23
2.0
23
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8
60
37
6
4
52
1.46
6456191--6456233
21
2.0
21
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0
59
37
9
6
46
1.63
6456871--6456914
19
2.4
18
85
11
54
31
4
11
52
1.57
6459139--6459200
20
3.0
20
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7
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4
11
0
83
0.78
6459140--6459201
13
4.7
13
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9
63
3
12
0
83
0.75
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19
1.9
19
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0
56
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0
0
37
0.96
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6
7.0
6
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5
50
23
2
0
74
0.93
6465912--6465952
3
13.7
3
94
0
73
34
2
0
63
1.08
6466610--6466651
4
10.5
4
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0
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23
2
2
71
1.10
6472916--6472950
12
2.9
12
100
0
70
51
8
0
40
1.33
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10
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10
88
7
57
55
6
0
38
1.27
6472916--6472964
12
4.2
12
84
10
57
51
10
0
38
1.36
6478058--6478174
62
1.9
62
96
0
216
42
20
4
32
1.71
6480820--6481478
88
7.4
89
78
4
629
28
16
26
29
1.97
6480820--6481433
132
4.7
132
94
0
1025
28
16
26
29
1.96
6481399--6482066
134
5.0
134
95
0
1133
26
20
23
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6482134--6482237
43
2.4
43
75
3
100
28
23
22
25
1.99
6482074--6482291
44
4.9
45
75
8
196
29
18
23
27
1.98
6486614--6486683
19
3.6
19
75
3
77
34
37
12
15
1.86
6486612--6486697
39
2.2
39
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2
147
32
38
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18
1.85
6486633--6486697
19
3.3
20
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6
62
32
40
9
18
1.82
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20
5.8
20
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25
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33
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1
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1.32
6488711--6488777
23
3.0
23
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12
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5
0
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21
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6
0
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11
3.9
11
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0
50
67
0
32
0
0.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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