Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  84  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25381178--25381403
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46
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0
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23
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0
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2.0
90
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2
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17
26
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
16
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37
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27
28
1.99
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1.8
93
92
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292
22
21
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27
1.99
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13
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2.1
36
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17
17
21
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
20
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35
1.54
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2.0
66
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26
12
24
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1.90
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1.9
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0
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1.73
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2.1
12
100
0
50
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0
0
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1.26
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29
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20
1.98
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1.64
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1.8
93
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29
82
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21
28
28
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92
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28
1.86
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7.0
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79
2
55
44
34
0
22
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25653052--25653098
14
3.3
15
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11
62
44
31
0
23
1.54
25653049--25653121
21
3.4
21
75
11
67
45
31
0
23
1.53
25653564--25653602
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25
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30
1.55
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3.4
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12
56
43
41
0
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1.47
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32
2
17
1.59
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4.3
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47
34
1
15
1.56
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21
2.1
21
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0
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1.59
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35
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1
27
1.59
25654664--25655393
122
6.0
121
84
5
849
23
25
22
28
1.99
25654664--25655393
41
17.9
41
88
3
884
23
25
22
28
1.99
25663051--25663081
2
15.5
2
93
0
53
54
0
45
0
0.99
25663047--25663081
12
2.9
12
95
0
61
57
0
42
0
0.99
25668063--25668123
27
2.3
26
82
5
77
32
11
3
52
1.54
25668064--25668127
29
2.2
29
78
18
71
31
10
3
54
1.51
25669539--25669669
46
2.8
46
90
0
199
22
22
26
29
1.99
25674739--25674776
14
2.6
14
87
4
58
42
5
13
39
1.66
25674760--25674823
20
3.2
20
82
2
85
32
7
9
50
1.64
25674900--25674945
20
2.4
19
82
10
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43
4
0
52
1.21
25674906--25674945
20
2.0
20
95
0
71
47
2
0
50
1.14
25681888--25681966
39
2.0
39
92
0
131
39
18
10
31
1.84
25683300--25683351
24
2.2
23
86
6
77
30
13
26
28
1.94
25697609--25697662
19
2.9
18
79
17
65
27
1
1
68
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25697613--25697662
9
5.3
9
79
15
57
24
2
2
72
1.06
25697615--25697691
28
2.7
27
84
6
82
28
5
1
64
1.22
25697728--25697755
13
2.2
13
100
0
56
21
7
0
71
1.09
25697741--25697835
10
9.8
9
75
12
64
34
1
0
64
1.01
25697741--25697814
29
2.5
29
84
6
87
39
1
0
59
1.06
25697769--25697835
29
2.3
29
82
5
82
31
0
0
68
0.90
25698297--25698500
83
2.5
83
81
7
238
35
8
16
39
1.79
25700464--25700512
25
2.0
25
84
8
64
36
20
6
36
1.78
25715234--25715311
39
2.0
40
87
2
113
19
14
33
33
1.91
25717611--25717699
41
2.2
41
91
0
142
35
16
28
19
1.93
25717624--25717721
41
2.4
41
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1
126
41
19
25
13
1.87
25719322--25719511
40
4.8
40
90
3
260
26
27
21
23
1.99
25719296--25719511
80
2.7
79
86
6
269
26
27
21
24
1.99
25727329--25727582
40
6.4
39
89
6
313
27
27
21
24
1.99
25727329--25727582
79
3.2
78
87
7
329
27
27
21
24
1.99
25727355--25727582
40
5.8
40
91
4
329
27
27
21
23
1.99
25731673--25731738
34
1.9
35
87
9
100
39
1
1
57
1.17
25732170--25732236
35
1.9
35
90
0
107
44
10
7
37
1.67
25732380--25732483
43
2.7
37
76
16
102
23
14
29
32
1.94
25732405--25732503
43
2.3
43
87
0
135
23
16
28
32
1.96
25732444--25732550
43
2.5
45
83
8
125
26
12
26
35
1.91
25733204--25733240
11
3.2
11
85
14
56
45
16
0
37
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25738484--25738508
11
2.3
11
100
0
50
16
0
0
84
0.63
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11
2.7
11
89
0
51
43
16
13
26
1.85
25744838--25744999
81
2.0
81
100
0
324
45
17
13
23
1.84
25749384--25749477
3
31.7
3
73
16
54
64
5
3
26
1.30
25749431--25749478
18
2.7
19
87
9
66
68
4
0
27
1.07
25749524--25749565
18
2.3
18
80
8
50
71
4
2
21
1.16
25752603--25752681
28
2.8
28
82
0
104
30
27
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32
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1.9
20
88
0
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71
2
0
26
1.00
25756437--25756484
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2.4
20
82
6
53
68
2
2
27
1.11
25758526--25758573
23
2.1
23
100
0
96
37
20
16
25
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316