Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  32  of  316  ( 37835 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9124383--9124440
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2.6
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2
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9124722--9124760
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0
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0
0
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11
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2.0
22
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17
2.4
18
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37
1.81
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2.0
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13
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17
2.9
18
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11
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1.76
9125928--9125982
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3.1
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10
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28
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0
100
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0
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1.9
20
88
5
58
24
2
5
67
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9146950--9147117
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1.9
90
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2
230
38
21
8
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1.83
9147208--9147260
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1.9
28
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3
99
60
0
0
39
0.97
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2.2
56
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2
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1.26
9147509--9147563
19
2.8
20
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29
3
3
63
1.28
9147508--9147577
19
3.8
18
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11
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25
4
2
67
1.23
9147480--9147578
18
5.3
18
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6
72
26
5
2
66
1.23
9147517--9147589
10
7.6
10
75
9
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30
2
1
65
1.15
9147571--9147624
27
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29
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42
0
1
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1.10
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9
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9153141--9153214
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2.4
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2
121
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2
6
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9153257--9153323
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3.0
21
80
10
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59
0
1
38
1.06
9153256--9153320
33
2.0
31
82
11
78
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0
1
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1.05
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2.3
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55
2
4
37
1.35
9156100--9156548
44
10.0
44
70
9
251
30
18
16
34
1.93
9156279--9156376
51
1.9
51
87
0
142
29
19
16
34
1.94
9156246--9156548
88
3.4
88
78
6
306
31
19
16
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13
2.0
13
100
0
52
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0
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169
1.9
169
92
0
546
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32
12
22
1.91
9170354--9170392
4
9.8
4
88
0
60
51
23
0
25
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
24
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0
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4
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2
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2
92
0
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0
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21
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2.0
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29
1
3
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1.20
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1.9
81
98
0
297
52
5
9
32
1.56
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23
2.0
22
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43
0
2
54
1.12
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24
2.2
24
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55
9
1
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1.43
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24
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0
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1
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1.9
16
100
0
62
32
16
25
25
1.96
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2.1
15
100
0
64
18
18
0
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1.33
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2.3
18
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14
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36
0
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2.3
25
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15
70
30
3
0
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1.08
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27
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46
0
7
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1.31
9229252--9229319
27
2.7
24
77
16
66
60
0
2
36
1.12
9229268--9229313
19
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19
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10
60
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0
2
39
1.10
9229275--9229336
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0
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16
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32
5
5
57
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2.3
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35
10
0
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17
2.2
18
85
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51
34
10
0
55
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9235941--9236050
55
2.0
55
100
0
220
32
9
16
41
1.80
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9
4.1
9
92
0
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13
10
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2.1
25
92
0
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15
15
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5.0
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1
323
21
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14
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2.0
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18
31
18
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2.0
21
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0
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3
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1.72
9282783--9282843
26
2.4
25
78
13
70
31
3
26
39
1.72
9292376--9292412
14
2.7
14
91
4
58
51
2
2
43
1.30
9292524--9292563
20
2.0
20
100
0
80
50
0
0
50
1.00
9292519--9292563
20
2.4
18
85
7
54
48
0
0
51
1.00
9293403--9293454
15
3.2
15
73
19
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44
0
1
53
1.11
9293483--9293528
13
3.5
13
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14
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2
0
45
1.13
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20
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0
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0
0
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0.99
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29
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33
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24
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53
0
0
46
1.05
9293543--9293592
16
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15
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16
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0
2
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1.12
9295589--9295618
14
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13
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23
0
26
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1.50
9296604--9296637
15
2.3
15
90
10
52
52
17
5
23
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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9
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56
2
2
38
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13
3.1
13
85
3
55
70
0
0
29
0.87
9300831--9300871
7
6.1
7
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8
50
70
0
0
29
0.87
9302443--9302519
21
3.7
21
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3
75
28
29
27
14
1.95
9305327--9305381
25
2.2
26
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7
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1.52
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0
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1.58
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0
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9
10
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2.0
23
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0
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0
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2.6
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0
4
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1.23
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2.2
17
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0
2
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1.15
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2.0
18
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0
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22
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2.0
50
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0
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31
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1.90
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2.0
25
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1.60
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46
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22
23
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1.91
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38
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1.97
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2.0
43
100
0
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44
13
6
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1.72
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11
5.3
11
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10
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52
7
5
34
1.52
9334089--9334141
20
2.5
21
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9
72
52
7
5
33
1.53
9334103--9334225
31
4.1
29
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19
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56
8
1
34
1.39
9334057--9334237
70
2.7
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14
172
56
7
2
33
1.41
9334270--9334319
26
1.9
26
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8
66
58
4
4
34
1.36
9334314--9334365
15
3.5
15
75
17
54
63
1
0
34
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9334762--9334925
3
55.0
3
69
20
64
62
4
2
31
1.28
9334837--9334913
29
2.6
29
74
13
68
57
7
1
33
1.36
9334659--9335053
141
2.8
139
82
7
411
58
5
3
31
1.39
9335058--9335173
3
38.0
3
73
10
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64
2
3
29
1.23
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2.3
15
100
0
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0
0
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1.00
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0
0
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1.00
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16
100
0
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1.63
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50
2
0
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14
2.0
14
100
0
56
21
7
7
64
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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