Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  217  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71126929--71127469
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25
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100
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0
0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
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10
10.7
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2
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19
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19
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1.23
71167092--71167170
39
2.1
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115
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3
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1.25
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2.0
29
100
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22
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62
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1.13
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0
0
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0
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1.9
21
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1.95
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2
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2.3
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2.7
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0
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46
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2.1
17
90
5
56
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13
2
40
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.9
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0
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30
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28
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1.97
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21
1.9
22
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5
57
31
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39
1.76
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28
2.5
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27
26
11
34
1.91
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25
13
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1.91
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3.8
60
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217
22
25
12
39
1.90
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89
2.9
89
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6
267
22
25
14
38
1.91
71235169--71235423
119
2.1
119
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402
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25
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1.91
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1
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1.13
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20
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2
2
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2.1
31
100
0
128
25
18
9
46
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71252808--71252898
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2.0
45
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0
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14
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38
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1
0
22
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20
23
27
1.99
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0
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17
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327
99
0
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20
26
1.97
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24
2.4
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2.3
21
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10
55
68
4
0
27
1.07
71274863--71274999
27
5.1
27
81
10
181
33
21
24
20
1.97
71274859--71274999
54
2.6
54
87
5
221
34
20
24
20
1.97
71277103--71277314
40
5.3
41
92
2
333
32
18
25
24
1.97
71277096--71277314
81
2.7
81
90
3
336
32
18
25
23
1.97
71277103--71277343
40
6.0
38
84
10
261
32
17
24
25
1.97
71277096--71277314
121
1.8
120
90
3
350
32
18
25
23
1.97
71278080--71278166
22
4.0
21
69
15
70
45
28
1
24
1.60
71278067--71278213
65
2.3
65
81
0
177
44
34
2
19
1.62
71278167--71278215
14
3.4
14
82
2
62
44
40
0
14
1.45
71278464--71278512
8
6.2
8
85
4
64
69
2
0
28
1.00
71278465--71278512
15
3.1
15
88
5
69
68
2
0
29
1.01
71278466--71278519
15
3.6
15
87
0
63
64
1
0
33
1.04
71280527--71280605
37
2.1
37
88
4
115
25
30
18
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71280724--71281009
47
6.1
47
93
0
437
27
30
10
32
1.89
71283109--71283416
154
2.0
154
96
0
571
25
13
15
44
1.83
71287468--71287506
19
2.1
19
85
4
53
25
0
2
71
0.98
71289134--71289175
11
3.7
11
79
17
50
28
0
2
69
1.01
71294628--71295056
83
5.1
83
95
1
759
27
20
19
33
1.96
71294980--71295573
119
5.0
119
95
0
1017
29
18
17
33
1.94
71295565--71295744
44
4.1
44
76
8
186
27
25
17
30
1.97
71296589--71296649
21
3.0
20
76
9
61
3
21
0
75
0.94
71296596--71296649
20
2.7
20
85
2
72
1
16
0
81
0.78
71296598--71296650
14
3.8
13
79
20
54
1
16
0
81
0.79
71305068--71305133
25
2.6
26
79
11
66
53
3
9
34
1.48
71305143--71305286
20
6.8
20
81
7
117
84
0
2
13
0.74
71305167--71305248
1
82.0
1
87
0
119
93
0
2
3
0.39
71305168--71305270
43
2.4
44
82
9
117
89
0
2
7
0.58
71305300--71305340
17
2.5
17
84
11
50
58
4
12
24
1.53
71305303--71305341
16
2.4
17
82
4
53
58
5
12
23
1.54
71307459--71307587
49
2.6
50
86
3
181
30
24
18
26
1.98
71307824--71307877
25
2.1
27
82
6
67
38
14
7
38
1.75
71309344--71309439
25
3.8
25
86
9
131
39
19
26
14
1.90
71309344--71309448
52
2.1
50
87
7
149
38
21
25
14
1.92
71309365--71309448
25
3.2
24
81
11
96
35
25
25
14
1.93
71326744--71326777
17
2.1
16
88
5
50
55
0
5
38
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71330466--71330595
40
3.3
39
86
5
181
28
27
20
23
1.99
71330464--71330648
79
2.3
79
83
10
218
28
27
20
23
1.99
71338340--71338507
40
4.2
40
82
8
148
27
27
20
24
1.99
71338375--71338560
80
2.3
80
83
9
229
27
27
20
23
1.99
71338377--71338560
40
4.6
40
83
7
205
27
27
21
23
1.99
71341798--71341838
21
1.9
22
85
5
57
53
9
2
34
1.47
71345055--71345102
14
3.4
14
83
13
55
29
4
0
66
1.10
71346782--71347091
48
6.5
48
86
3
360
28
29
16
25
1.97
71347086--71347120
18
1.9
18
94
0
61
20
14
11
54
1.70
71360667--71360703
19
1.9
19
89
10
58
64
0
8
27
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316