Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  27  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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2.1
22
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4
4
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1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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16
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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2.8
12
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0
50
35
8
0
55
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7775001--7775048
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14
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16
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33
6
0
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2.3
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22
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20
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1
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0
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27
2.4
27
80
7
73
62
1
1
34
1.13
7801207--7801287
36
2.2
36
86
0
117
62
2
2
32
1.21
7801470--7801587
28
4.3
28
75
18
95
38
4
1
55
1.30
7801458--7801571
54
2.1
56
83
9
146
35
5
2
57
1.35
7801525--7801587
27
2.3
27
94
2
108
42
3
1
52
1.27
7801578--7801700
9
13.3
9
68
13
54
31
3
0
64
1.15
7803783--7803826
22
2.0
22
90
0
70
18
13
22
45
1.84
7806067--7806225
27
5.9
27
82
11
184
34
22
24
18
1.96
7806085--7806228
54
2.7
54
94
2
245
34
23
24
17
1.96
7810866--7810896
16
1.9
16
93
0
53
51
0
9
38
1.35
7810862--7810926
28
2.3
27
76
10
67
40
0
10
49
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7811852--7811884
12
2.8
12
95
0
57
24
12
0
63
1.28
7813972--7814000
11
2.5
12
94
5
51
20
6
0
72
1.07
7825779--7825840
30
2.1
30
100
0
124
38
6
9
45
1.63
7826974--7827023
18
2.7
18
87
6
64
58
0
0
42
0.98
7826975--7827026
15
3.1
17
81
15
56
59
0
0
40
0.97
7830563--7830612
24
2.1
24
100
0
100
44
8
12
36
1.71
7835770--7835808
19
2.1
19
100
0
78
30
0
35
33
1.58
7836051--7836122
38
1.9
37
85
2
99
45
6
0
47
1.29
7836070--7836149
39
2.1
38
81
6
90
51
5
1
42
1.31
7838514--7838542
12
2.4
12
100
0
58
34
0
17
48
1.47
7841416--7841465
21
2.4
21
74
19
50
36
4
0
60
1.16
7841521--7841744
89
2.5
88
85
2
286
58
12
4
23
1.53
7846160--7846304
74
2.0
74
91
0
236
48
6
5
39
1.51
7852119--7852156
14
2.7
15
80
12
53
39
0
0
60
0.97
7852783--7852903
56
2.1
56
84
1
152
34
4
9
51
1.55
7858678--7858837
41
3.9
41
85
2
178
29
16
25
29
1.96
7858679--7858857
41
4.3
41
84
2
160
30
16
24
29
1.96
7864831--7864864
17
1.9
18
88
5
52
47
5
14
32
1.69
7881416--7881492
6
12.8
6
100
0
154
50
16
0
32
1.46
7882474--7882529
29
1.9
29
85
0
76
35
5
10
48
1.61
7882696--7882735
11
3.7
11
90
9
57
30
27
0
42
1.56
7882771--7882800
14
2.1
14
93
0
51
36
0
3
60
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7882896--7882999
47
2.2
48
94
1
183
31
7
0
59
1.32
7882900--7882975
22
3.3
22
67
22
66
31
9
0
59
1.29
7883876--7883929
7
7.7
7
97
0
99
27
1
14
55
1.50
7884544--7884605
18
3.4
18
93
0
97
20
29
9
40
1.84
7885115--7885145
9
3.6
9
91
8
55
35
0
0
64
0.94
7887462--7887504
21
2.0
22
82
13
54
51
6
0
41
1.29
7892330--7892383
25
2.1
26
93
3
92
31
5
25
37
1.79
7892347--7892419
37
2.0
37
94
2
130
30
9
23
36
1.87
7899177--7899525
127
2.8
125
88
2
511
28
9
14
46
1.76
7901961--7902008
20
2.3
20
89
3
69
50
4
8
37
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316