Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  42  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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53
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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3.0
13
83
16
50
39
0
0
60
0.97
12293887--12293938
25
2.1
25
100
0
104
25
15
32
26
1.95
12297914--12297964
22
2.4
21
77
6
57
9
3
9
76
1.14
12297946--12297974
11
2.5
12
94
5
51
20
6
0
72
1.07
12298147--12298184
18
2.1
18
90
0
58
55
0
0
44
0.99
12302887--12302963
38
2.0
38
100
0
154
24
15
18
41
1.89
12303063--12303124
30
2.1
30
87
6
90
41
9
1
46
1.46
12308027--12308977
120
7.9
120
83
1
1008
28
28
14
28
1.95
12310019--12310057
7
5.6
7
100
0
78
0
28
0
71
0.86
12312079--12312129
23
2.4
21
83
9
59
29
3
0
66
1.09
12313693--12313735
18
2.4
18
88
7
61
53
0
0
46
1.00
12320091--12320145
24
2.4
23
81
6
58
21
5
1
70
1.16
12321947--12321987
8
5.1
8
83
16
50
63
0
2
34
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12324321--12324349
9
3.3
9
95
4
51
93
0
6
0
0.36
12324321--12324350
15
2.0
15
93
0
51
90
0
10
0
0.47
12328734--12328775
22
2.0
21
86
9
59
54
0
16
28
1.42
12331449--12331475
13
2.1
13
100
0
54
51
0
7
40
1.30
12332431--12332465
18
1.9
18
88
0
52
60
0
0
40
0.97
12335462--12335528
34
2.0
33
97
2
125
40
11
5
41
1.66
12337272--12337342
28
2.8
25
72
23
67
45
2
4
47
1.36
12337293--12337342
24
2.1
26
82
14
63
46
2
4
48
1.32
12340554--12340582
13
2.1
14
93
6
51
51
0
3
44
1.18
12340952--12341015
31
2.0
32
85
8
87
45
0
7
46
1.32
12341938--12341984
15
3.1
15
87
0
67
34
2
12
51
1.52
12342492--12342532
19
2.2
19
87
12
59
46
0
24
29
1.53
12344824--12344872
23
2.1
23
92
0
80
46
4
6
42
1.47
12349279--12349311
16
2.1
16
94
0
57
48
6
6
39
1.53
12349374--12349405
10
3.4
10
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16
50
28
0
0
71
0.86
12349374--12349406
9
3.7
9
84
15
50
30
0
0
69
0.88
12352142--12352180
3
13.0
3
100
0
78
33
0
0
66
0.92
12355564--12355612
18
2.7
17
76
14
53
63
12
2
22
1.39
12358682--12358746
9
6.9
9
78
11
60
63
1
3
32
1.19
12360960--12360999
20
1.9
20
85
10
53
75
0
20
5
0.99
12361282--12361528
137
1.8
134
85
5
345
37
10
8
42
1.71
12368551--12368586
16
2.3
16
90
4
56
44
5
2
47
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12370916--12370966
25
2.0
25
100
0
102
52
0
7
39
1.30
12371778--12371817
17
2.4
17
95
0
71
80
0
2
17
0.83
12371778--12371817
6
7.0
6
83
11
57
80
0
2
17
0.83
12377821--12377879
29
2.0
29
100
0
118
30
13
20
35
1.91
12383516--12383548
8
4.1
8
85
14
50
87
0
0
12
0.53
12383519--12383550
16
2.0
16
100
0
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87
0
0
12
0.54
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28
2.8
28
78
7
93
25
22
22
29
1.99
12388514--12388615
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2.5
40
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134
41
16
17
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1.90
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21
2.0
21
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0
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24
2
29
43
1.67
12389341--12389381
21
1.9
22
85
14
59
24
0
31
43
1.54

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316