Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  17  of  316  ( 37835 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5212416--5212599
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1.39
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0
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1.9
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0
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2
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27
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5246863--5247226
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2.5
144
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7
362
27
28
18
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5252553--5252660
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3
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2.0
34
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15
79
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1
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5254689--5254768
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106
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19
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2.6
24
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2.1
60
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2
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1.13
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0
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4.7
50
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263
27
23
29
19
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5312737--5312986
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20
1.99
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0
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0
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1.26
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12
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0
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21
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28
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1.8
93
92
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22
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2.0
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18
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21
2.3
19
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7
54
24
2
4
68
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5374356--5374419
18
3.4
18
73
12
65
28
1
4
65
1.21
5374436--5374467
16
1.9
17
93
6
57
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0
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1.9
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0
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22
18
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2.1
31
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11
1
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18
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2.3
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20
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0
0
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14
22
29
1.94
5392308--5392377
36
1.9
36
88
5
106
32
12
22
31
1.92
5396002--5396031
15
1.9
16
93
6
53
76
6
3
13
1.11
5399599--5399670
35
2.1
35
94
0
126
36
19
8
36
1.82
5402039--5402090
18
2.9
17
75
16
52
32
3
0
63
1.12
5402874--5402995
40
3.0
41
77
3
124
31
17
22
27
1.96
5403195--5403291
41
2.4
41
79
8
108
26
23
19
29
1.98
5402903--5403422
156
3.4
149
78
5
491
30
21
20
27
1.98
5404056--5404102
14
3.5
13
77
11
58
21
0
29
48
1.50
5404259--5404288
14
2.1
14
93
0
51
16
0
26
56
1.40
5404313--5404374
7
8.4
7
76
15
54
27
0
33
38
1.57
5404313--5404405
14
6.4
14
73
10
62
25
0
32
41
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5404313--5404374
22
2.8
22
80
4
72
27
0
33
38
1.57
5404459--5404514
7
8.0
7
79
0
58
16
1
39
42
1.58
5404719--5404784
14
4.7
14
74
7
53
12
3
37
46
1.56
5404711--5404757
21
2.2
22
84
3
60
14
0
34
51
1.43
5404975--5405061
42
2.1
41
82
6
104
45
17
14
21
1.84
5405712--5405757
24
1.9
24
100
0
92
17
15
8
58
1.61
5406471--5406540
24
2.9
24
72
18
72
40
4
10
45
1.57
5409341--5409380
21
1.9
21
89
0
62
25
22
52
0
1.47
5409678--5409883
44
4.7
44
74
12
167
30
19
19
30
1.96
5409782--5409883
43
2.3
44
84
1
134
32
20
17
29
1.96
5413360--5413468
39
2.7
39
83
5
121
37
17
21
23
1.94
5414424--5414490
28
2.4
28
80
5
82
16
0
31
52
1.44
5414450--5414503
21
2.6
21
82
5
65
11
0
35
53
1.36
5414466--5414505
14
2.8
14
96
3
71
15
0
35
50
1.44
5414465--5414505
7
5.9
7
78
21
50
14
0
36
48
1.44
5414530--5414561
15
2.1
15
94
0
55
65
0
6
28
1.16
5414536--5414616
37
2.2
37
97
0
153
56
0
2
40
1.12
5416546--5416624
39
2.0
39
97
0
149
22
11
15
50
1.75
5416552--5416615
20
3.2
20
65
20
53
21
9
15
53
1.70
5418098--5418205
54
2.0
54
98
0
207
33
8
13
44
1.74
5418544--5419083
106
5.2
105
87
4
774
34
6
4
54
1.46
5420418--5420460
15
2.9
15
78
21
54
30
4
0
65
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5420425--5420475
21
2.4
21
87
12
70
29
7
0
62
1.23
5421567--5421600
14
2.4
14
95
0
59
47
11
17
23
1.81
5426506--5426553
21
2.3
21
81
0
60
31
14
50
4
1.62
5426927--5427028
43
2.3
43
91
1
159
21
30
17
30
1.96
5440118--5440168
23
2.2
24
86
10
70
62
7
9
19
1.50
5441375--5441475
49
2.1
49
92
0
166
36
19
12
30
1.90
5442758--5442793
18
2.1
18
89
5
56
19
25
38
16
1.92
5445233--5445294
13
4.7
14
73
18
53
38
0
3
58
1.15
5445370--5445404
17
2.1
17
89
10
54
48
0
2
48
1.16
5449572--5449621
6
8.3
6
100
0
100
16
0
66
18
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316