Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  247  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.2
20
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0
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1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
27
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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80
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1.99
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29
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21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81741091--81741159
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22
3.9
23
78
10
101
35
17
22
25
1.95
81766035--81766080
22
2.1
22
100
0
92
45
8
13
32
1.73
81766715--81766842
64
2.0
63
88
7
188
20
20
24
35
1.96
81769528--81769620
48
1.9
48
86
0
132
32
21
18
27
1.97
81771462--81771535
26
2.8
26
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4
96
35
16
6
41
1.74
81771646--81771680
6
5.8
6
86
0
52
17
20
0
62
1.32
81774309--81774341
17
1.9
17
93
0
57
36
0
12
51
1.39
81779603--81779663
30
2.0
30
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0
77
31
22
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37
1.84
81782860--81782946
43
2.0
43
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12
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22
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1.93
81787570--81787643
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2.6
29
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4
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25
32
16
25
1.96
81791959--81791999
18
2.3
18
100
0
82
46
9
19
24
1.80
81791959--81792006
18
2.7
18
93
0
69
43
8
25
22
1.81
81792126--81792207
26
3.2
26
96
0
146
31
7
24
36
1.83
81793387--81793416
8
3.8
8
90
0
51
43
26
26
3
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81793809--81793881
27
2.8
27
84
12
98
19
24
21
34
1.96
81797851--81797883
12
2.6
13
85
9
50
9
45
0
45
1.35
81798941--81799005
28
2.3
28
89
0
94
32
26
9
32
1.88
81799111--81799200
27
3.2
27
81
7
101
20
24
23
32
1.98
81806074--81806138
28
2.3
28
91
0
103
32
27
9
30
1.88
81806244--81806323
27
2.9
27
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7
99
20
26
22
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1.98
81808154--81808331
27
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27
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3
205
26
15
28
29
1.96
81808155--81808310
82
1.9
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88
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233
26
15
28
29
1.96
81808151--81808331
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
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3.8
46
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21
20
28
28
1.98
81812862--81813032
93
1.8
93
94
0
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21
21
29
28
1.98
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26
2.0
26
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7
72
37
22
15
24
1.92
81828032--81828081
15
3.4
14
78
10
55
54
6
2
38
1.37
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21
2.0
19
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9
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7
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22
1.38
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40
5.7
40
85
5
287
24
21
28
25
1.99
81842196--81842453
80
3.2
80
82
7
233
25
21
27
25
1.99
81842196--81842453
119
2.2
119
80
6
274
25
21
27
25
1.99
81850213--81850437
40
5.7
40
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5
278
24
21
28
26
1.99
81850252--81850460
80
2.6
79
83
7
212
26
20
27
25
1.99
81863401--81863537
47
2.9
47
81
6
170
24
18
33
22
1.97
81863359--81863537
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1.9
94
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245
25
18
31
24
1.98
81878041--81878070
15
2.0
15
93
0
51
26
3
26
43
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81880592--81880662
30
2.4
30
95
0
124
14
39
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18
1.89
81890443--81890490
18
2.7
17
74
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22
47
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10
1.79
81891652--81891685
6
5.7
6
100
0
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0
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2.1
22
100
0
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36
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81897134--81897166
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12
0
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1.23
81904582--81904770
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1
15
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79
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21
27
25
1.99
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5.6
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209
25
21
27
25
1.99
81909212--81909389
79
2.2
80
80
3
191
25
21
28
24
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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