Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  8  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2350583--2351111
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44
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1.98
2350671--2351171
232
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18
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4
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19
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29
76
13
97
45
11
8
35
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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56
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1.70
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24
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0
1
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1.09
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0
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0
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12
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14
2.1
14
100
0
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1.85
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34
2.1
34
89
0
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43
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11
37
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66
2.0
66
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0
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1.9
18
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52
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20
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0
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19
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3
62
35
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1.60
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30
2.0
30
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20
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29
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47
3.8
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213
29
27
20
22
1.98
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94
1.8
93
91
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281
28
27
21
22
1.99
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2.0
30
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42
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14
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20
1.9
20
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5
51
61
0
2
35
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
0
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2.0
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85
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25
11
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2.0
32
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17
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2.0
103
100
0
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15
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19
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0
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2.6
202
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12
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0
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17
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17
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0
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0
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0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2579645--2579691
21
2.2
21
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21
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36
0
0
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0
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0
0
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15
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59
30
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0
62
1.21
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16
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3
79
8
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34
2
0
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1.05
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2.3
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0
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0
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17
2.1
18
90
5
58
48
0
2
48
1.15
2590725--2590815
39
2.3
41
88
3
132
41
1
4
52
1.28
2594101--2594153
25
2.2
23
87
12
72
33
0
0
66
0.92
2594224--2594325
30
3.4
30
72
11
93
45
7
14
32
1.74
2595511--2595586
37
2.0
38
90
7
120
42
1
15
40
1.56
2606093--2606137
17
2.6
17
92
3
72
60
0
6
33
1.23
2625303--2625349
24
2.0
24
100
0
94
29
8
29
31
1.87
2627944--2628003
29
2.1
29
87
6
86
35
1
1
61
1.16
2627941--2628003
30
2.1
30
82
11
85
36
1
1
60
1.16
2637396--2637452
14
3.7
14
80
15
60
24
1
0
73
0.92
2637397--2637452
23
2.4
23
85
8
69
25
1
0
73
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2637447--2637613
23
7.4
22
68
15
90
41
0
4
53
1.20
2637454--2637613
57
2.8
56
80
10
164
41
0
4
53
1.20
2637538--2637574
13
2.7
14
88
12
51
35
0
5
59
1.20
2637552--2637613
21
3.0
20
84
13
72
37
0
4
58
1.20
2637494--2637594
35
2.9
35
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1
150
39
0
3
56
1.18
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23
2.2
23
85
7
66
48
0
0
51
1.00
2637578--2637626
22
2.2
21
80
16
55
48
0
0
51
1.00
2637676--2637734
22
2.7
23
75
19
72
33
0
3
62
1.12
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9
4.9
9
76
18
51
60
2
0
37
1.09
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20
3.1
20
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56
51
0
0
48
1.00
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13
2.9
13
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7
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61
2
0
35
1.10
2638187--2638225
14
2.9
14
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3
62
61
2
0
35
1.10
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20
4.2
20
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25
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55
2
1
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1.21
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21
4.5
20
70
11
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58
2
0
39
1.10
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1.9
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56
2
0
40
1.18
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23
3.6
23
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12
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51
3
1
43
1.26
2638261--2638354
44
2.1
46
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11
124
54
3
1
41
1.23
2638260--2638358
46
2.2
46
82
10
123
55
3
1
40
1.22
2638338--2638378
10
3.7
11
81
18
50
73
0
2
24
0.96
2642141--2642300
83
1.9
82
80
8
182
46
4
4
45
1.43
2653380--2653409
15
2.0
15
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0
51
0
50
0
50
1.00
2654887--2654927
5
8.2
5
84
10
57
39
0
0
60
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2654887--2654929
14
2.9
14
81
18
52
37
0
0
62
0.95
2654890--2654938
21
2.3
22
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3
82
38
0
0
61
0.96
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16
3.3
15
82
12
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40
0
0
59
0.97
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16
2.1
16
94
0
57
78
0
3
18
0.87
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14
2.7
14
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7
53
37
15
0
47
1.45
2657054--2657094
8
5.4
8
80
11
50
36
14
0
48
1.44
2658991--2659098
3
35.3
3
73
17
80
32
3
2
61
1.28
2658990--2659098
50
2.2
47
75
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114
33
3
2
60
1.28
2661114--2661166
24
2.1
26
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30
7
3
58
1.43
2661116--2661171
25
2.3
25
84
3
69
32
8
3
55
1.48

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316