Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  35  of  316  ( 37835 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9991431--9991536
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22
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1.97
9993026--9993181
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1.83
9998439--9998544
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20.6
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2
28
1.24
10010844--10010914
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10
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2
2
70
1.11
10012861--10012932
29
2.5
28
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99
26
2
1
69
1.10
10012861--10012950
9
9.7
9
78
9
92
25
2
2
70
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10027887--10027964
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2.9
26
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1
1
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1.06
10027911--10028044
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19
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10035636--10035885
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29
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78
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26
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
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(0-2)
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0
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2.0
24
91
0
78
37
4
0
58
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10121125--10121201
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19
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15
31
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2.1
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27
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22
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2
32
1.37
10149006--10149039
17
2.0
17
94
0
59
58
5
2
32
1.37
10151943--10151987
6
7.5
6
87
0
63
80
0
6
13
0.91
10157346--10157372
13
2.1
13
100
0
54
55
7
0
37
1.28
10157357--10157390
9
3.9
9
88
7
52
58
5
2
32
1.37
10157357--10157390
17
2.0
17
94
0
59
58
5
2
32
1.37
10169067--10169248
46
4.0
46
87
1
231
20
22
14
42
1.88
10171313--10171344
11
2.9
11
100
0
64
65
0
0
34
0.93
10172926--10172983
30
1.9
30
85
0
80
15
29
34
20
1.94
10175030--10175068
12
3.4
11
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10
51
82
2
12
2
0.89
10175036--10175062
6
4.5
6
100
0
54
85
0
14
0
0.61
10175030--10175068
11
3.5
11
86
6
51
82
2
12
2
0.89
10176309--10176363
28
2.0
27
82
3
65
45
16
7
30
1.74
10176325--10176520
18
10.3
18
68
11
106
41
14
9
33
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10186148--10186210
26
2.5
26
75
17
69
47
20
0
31
1.51
10186361--10186413
27
1.9
28
84
3
72
0
32
3
64
1.12
10186725--10186793
35
2.1
31
84
10
84
47
4
0
47
1.21
10189749--10189782
16
2.1
17
88
5
52
17
20
14
47
1.83
10192173--10192200
7
4.0
7
100
0
56
71
0
0
28
0.86
10207434--10207502
17
4.1
16
74
23
54
47
1
2
47
1.25
10210073--10210115
20
2.2
20
86
0
59
9
16
23
51
1.73
10211152--10211197
22
2.1
22
100
0
92
41
21
6
30
1.78
10212474--10212517
23
2.0
22
86
4
61
36
9
0
54
1.32
10213876--10213927
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
10215844--10215895
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
10217907--10217958
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
10219877--10219928
24
2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
10232315--10232359
23
2.0
23
82
8
56
37
8
13
40
1.76
10233980--10234013
11
2.9
12
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8
52
61
11
2
23
1.43
10234461--10234511
20
2.5
20
78
15
59
66
1
3
27
1.20
10236939--10237050
56
2.0
56
100
0
224
33
16
35
14
1.88
10247235--10247286
9
5.8
9
95
0
95
36
30
9
23
1.87
10256323--10256361
16
2.4
17
86
4
53
38
0
0
61
0.96
10256936--10256993
23
2.6
23
80
2
64
48
0
1
50
1.11
10264047--10264097
23
2.2
23
100
0
102
35
11
17
35
1.87
10266582--10266786
69
3.0
68
78
4
216
39
7
20
32
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10266876--10266985
51
2.2
51
81
6
125
46
7
17
29
1.74
10267122--10267194
36
2.0
36
100
0
146
41
0
10
47
1.39
10276518--10276573
18
3.3
18
68
25
50
58
1
0
39
1.08
10282359--10282392
12
2.8
12
90
0
50
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0
0
32
0.91
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2.0
22
85
0
59
67
2
2
27
1.15
10290348--10290391
20
2.3
19
81
14
54
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4
6
13
1.17
10300642--10300667
7
3.7
7
100
0
52
15
11
0
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0
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0
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1.9
108
92
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344
32
12
24
30
1.92
10310136--10310365
108
2.1
108
88
3
338
33
13
24
28
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316