Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  75  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22361656--22361728
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2.0
37
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2
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39
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3.0
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7
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1.56
22365918--22365958
22
1.9
21
85
5
55
41
4
0
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1.22
22368170--22368247
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1
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10
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1.98
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28
19
27
1.98
22420912--22421181
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2.9
91
77
10
289
24
28
18
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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0
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2.0
20
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30
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0
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2.5
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1
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1
41
1.28
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37
2.1
37
92
2
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20
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12
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0
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28
12
46
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
19
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1.98
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22
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16
20
17
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18
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1.84
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54
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1
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11
15
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2.1
54
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29
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16
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7
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14
25
31
1.95
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6.6
9
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11
66
18
1
0
79
0.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22574537--22574624
6
14.3
6
73
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74
17
3
1
78
0.95
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21
3.8
20
78
10
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17
3
1
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0.97
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5
1
76
1.03
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17
3
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2
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25
15
27
32
1.95
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171
26
16
25
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1.97
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15
17
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57
0
0
42
0.98
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34
2.4
34
86
7
116
37
8
4
49
1.55
22596414--22596444
15
2.1
15
100
0
62
16
32
0
51
1.44
22608971--22609068
20
4.9
20
74
9
76
38
22
25
13
1.90
22616495--22616572
19
4.3
18
72
16
54
66
2
3
26
1.22
22619454--22619497
22
2.0
22
100
0
88
31
18
27
22
1.97
22623906--22623982
38
2.0
38
97
0
145
27
14
18
40
1.89
22631694--22631801
15
7.2
15
67
12
78
44
7
22
25
1.79
22631688--22631811
30
4.1
30
93
1
203
43
6
24
25
1.78
22636386--22636463
15
5.2
15
67
11
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44
7
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25
1.79
22636382--22636463
30
2.7
30
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0
137
46
7
21
24
1.77
22641048--22641100
20
2.7
20
79
5
63
66
3
1
28
1.20
22641150--22641190
19
2.2
19
86
0
55
60
0
9
29
1.28
22645057--22645097
18
2.3
18
87
8
57
26
4
0
68
1.10
22647209--22647239
11
2.8
11
90
0
53
32
0
0
67
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22650196--22651060
44
19.1
44
72
10
386
28
20
17
33
1.95
22650484--22650837
140
2.5
140
78
7
403
29
18
16
35
1.93
22650207--22651060
229
3.7
226
76
7
708
28
20
17
33
1.95
22650815--22651055
134
1.8
133
84
0
329
29
21
18
30
1.97
22650207--22651061
89
9.4
90
73
9
486
28
20
17
33
1.95
22651362--22651430
34
2.0
34
94
0
120
40
23
15
20
1.91
22659350--22659402
3
17.7
3
92
0
70
60
1
5
32
1.31
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15
2.5
15
100
0
76
7
0
44
47
1.32
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44
4.4
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10
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28
20
21
28
1.98
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44
4.6
43
74
7
168
27
22
19
30
1.98
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129
2.5
129
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4
403
26
22
21
29
1.99
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87
3.4
85
78
7
237
26
22
20
30
1.98
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44
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70
13
209
26
22
20
30
1.98
22673577--22673859
42
6.7
42
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14
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25
21
21
31
1.98
22673616--22673776
87
1.9
87
81
7
202
25
22
21
31
1.98
22686562--22686614
3
17.7
3
92
0
70
60
1
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1.31
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15
2.5
15
100
0
76
7
0
44
47
1.32
22687782--22687833
22
2.3
23
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9
72
71
1
7
19
1.20
22687881--22687919
12
3.2
12
88
0
51
74
0
2
23
0.94
22692688--22692742
17
3.3
17
67
23
53
43
3
0
52
1.18
22692684--22692787
31
3.3
32
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153
40
4
0
54
1.21
22692684--22692787
30
3.4
31
90
5
149
40
4
0
54
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22692792--22692851
27
2.2
29
80
17
83
53
1
0
45
1.10
22694228--22694258
3
10.3
3
100
0
62
32
0
35
32
1.58
22694442--22694492
9
5.4
9
79
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80
1
1
15
0.89
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20
2.2
21
85
14
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28
2
0
69
1.00
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3.2
26
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0
150
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25
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1.80
22702266--22702318
26
2.0
26
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7
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37
22
15
24
1.92
22703179--22703231
26
2.0
26
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22
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913
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0
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2.0
26
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72
37
22
15
24
1.92
22704392--22704677
136
2.1
137
97
0
538
24
18
25
31
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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