Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  123  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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30
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39175789--39175960
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2.1
19
85
9
53
12
15
0
71
1.14
39204285--39204366
42
2.0
42
87
4
121
19
30
30
19
1.96
39205469--39205508
6
6.7
6
83
11
55
50
2
17
30
1.59
39218464--39218886
43
9.8
44
72
10
180
30
26
21
21
1.98
39218723--39218885
87
1.9
86
81
8
197
28
29
20
20
1.98
39218718--39218899
87
2.1
86
79
10
192
29
30
19
19
1.97
39218609--39218913
129
2.4
129
77
5
301
29
27
20
21
1.99
39224613--39224745
9
14.6
9
68
14
76
31
2
21
45
1.64
39226313--39226483
92
1.8
93
88
3
265
21
22
29
26
1.99
39229343--39229411
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
39229334--39229421
30
3.0
30
80
11
92
11
17
14
56
1.66
39231794--39231969
46
3.8
46
80
10
205
19
21
30
28
1.98
39231790--39231961
93
1.8
93
92
0
290
20
22
30
27
1.98
39234552--39234681
46
2.8
48
76
17
148
27
29
21
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39234557--39234700
46
3.1
45
73
19
127
27
29
21
22
1.99
39239287--39239311
12
2.1
12
100
0
50
44
0
0
56
0.99
39239297--39239452
72
2.2
73
92
1
260
42
1
4
51
1.33
39239342--39239423
19
4.0
21
70
16
64
41
1
3
53
1.26
39247282--39247335
3
18.0
3
80
0
63
27
40
1
29
1.67
39251604--39251668
33
2.0
33
90
0
103
32
36
9
21
1.85
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2
16.5
2
100
0
66
51
0
48
0
1.00
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2
21.0
2
100
0
84
50
0
50
0
1.00
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19
2.1
19
85
9
53
12
15
0
71
1.14
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2.0
42
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4
121
19
30
30
19
1.96
39261737--39261776
6
6.7
6
83
11
55
50
2
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30
1.59
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2.2
13
100
0
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60
0
0
39
0.97
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42
2.2
43
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9
104
28
13
24
32
1.94
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4
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4
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18
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70
0
4
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1.05
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10
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81
0
0
18
0.70
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40
5.5
40
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2
291
23
23
28
23
2.00
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46
3.6
45
76
13
162
28
19
27
24
1.99
39307580--39307609
14
2.1
15
93
6
53
0
40
0
60
0.97
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21
2.6
21
87
0
72
25
35
5
33
1.80
39313781--39313811
15
2.1
15
93
0
53
54
25
0
19
1.44
39317082--39317200
27
4.4
27
82
2
139
36
16
21
24
1.94
39317093--39317197
55
1.9
53
88
3
156
36
17
22
23
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39317194--39317255
27
2.3
26
88
2
88
25
19
17
37
1.94
39317832--39317980
67
2.1
70
90
6
232
18
27
22
31
1.97
39324534--39324652
27
4.4
26
82
6
139
34
19
21
24
1.96
39324538--39324653
54
2.1
55
85
4
164
35
19
20
24
1.96
39325283--39325334
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
39325365--39325390
2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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4.6
40
83
0
231
25
26
23
24
2.00
39341225--39341422
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3.7
52
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10
202
35
17
25
21
1.95
39341232--39341432
108
1.8
110
87
4
300
34
17
25
22
1.96
39341665--39341702
20
1.9
20
88
0
58
42
0
18
39
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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