Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  277  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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22
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31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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0
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0
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2
36
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.71
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3.1
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3
36
1.74
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20
20
34
1.96
91883224--91883322
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20
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107
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19
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38
0
4
58
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91927648--91927698
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37
0
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0
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2.1
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50
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15
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15
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57
17
14
10
1.63
91948722--91948790
30
2.3
30
82
7
88
57
17
14
10
1.63
91951719--91951894
46
3.8
46
72
12
162
29
27
19
23
1.98
91960135--91960759
46
13.6
46
92
1
923
40
14
23
21
1.90
91962167--91962217
16
3.3
15
73
13
50
76
0
21
1
0.88
91963644--91963738
25
3.7
25
74
19
79
55
1
1
42
1.13
91964617--91964670
19
2.8
20
77
8
67
46
0
1
51
1.11
91967199--91967236
20
1.9
20
94
0
67
42
13
2
42
1.57
91968413--91968469
24
2.5
22
77
11
60
42
3
3
50
1.36
91969717--91969750
12
2.7
13
86
9
52
17
0
0
82
0.67
91969727--91969757
15
2.1
15
93
0
53
12
0
3
83
0.75
91977560--91977690
46
2.8
46
86
5
167
21
21
25
32
1.98
91985598--91985761
46
3.6
45
79
9
147
24
29
18
26
1.98
91986480--91986622
60
2.3
62
78
14
163
27
26
19
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91989543--91989683
60
2.3
60
80
10
153
26
24
19
28
1.99
91998170--91998209
21
2.0
21
95
5
73
22
27
40
10
1.86
92001226--92001277
26
2.0
26
96
0
95
36
11
23
28
1.90
92001474--92001612
69
2.0
69
92
0
233
47
5
12
34
1.65
92002024--92002110
42
2.0
43
95
4
158
52
0
12
34
1.39
92021241--92021279
16
2.4
17
91
8
64
51
0
0
48
1.00
92028157--92028200
16
2.8
15
80
10
52
52
0
4
43
1.22
92029549--92029594
18
2.6
18
92
0
74
39
13
13
34
1.83
92029584--92029625
18
2.3
18
91
0
66
35
9
11
42
1.74
92029666--92029714
18
2.8
17
81
9
62
32
10
20
36
1.86
92031937--92031975
16
2.4
17
91
8
64
51
0
0
48
1.00
92034785--92034960
37
4.8
37
94
2
291
39
14
21
25
1.91
92034923--92035046
46
2.8
46
91
3
200
33
16
22
27
1.96
92041947--92042122
37
4.8
37
92
2
282
38
14
21
25
1.91
92042085--92042208
46
2.8
46
91
3
200
33
16
22
27
1.96
92044931--92045539
132
4.6
132
78
3
562
33
15
15
36
1.88
92044931--92045469
264
2.0
264
82
2
654
32
15
14
36
1.88
92060105--92060179
39
1.9
39
91
0
123
45
4
25
25
1.71
92064083--92064324
50
4.7
50
83
4
270
26
24
28
19
1.99
92064083--92064332
100
2.4
103
86
6
337
26
24
28
20
1.99
92070432--92070467
18
2.0
18
88
0
54
72
0
2
25
0.98
92070986--92071010
12
2.1
12
100
0
50
84
0
0
16
0.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92084898--92084962
32
2.0
32
96
0
121
32
6
4
56
1.44
92086154--92086219
29
2.2
29
83
2
78
46
22
3
27
1.66
92087009--92087056
23
2.0
24
92
4
80
31
14
22
31
1.94
92098104--92098251
46
3.2
46
79
10
158
24
27
16
31
1.97
92098175--92098302
46
2.7
46
81
4
123
24
30
17
27
1.97
92098583--92098674
45
2.0
45
95
0
166
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8
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29
1.55
92103464--92103495
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2.5
13
100
0
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0
9
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27
18
29
1.98
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27
3.0
27
66
16
78
39
15
4
40
1.69
92111480--92111591
55
2.0
55
100
0
224
38
16
5
40
1.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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