Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  316  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103908989--103909035
21
2.2
22
92
3
78
21
38
19
21
1.94
103912764--103912807
22
2.0
22
90
0
70
22
11
29
36
1.89
103918904--103918947
20
2.2
20
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11
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4
2
40
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7
6.4
7
97
0
81
40
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0
2
1.11
103931158--103931254
46
2.1
46
98
0
185
15
25
11
47
1.79
103937139--103937232
45
2.1
46
90
6
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26
3
9
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118
2.0
118
100
0
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19
12
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1.87
103952985--103953028
10
4.4
10
81
18
56
47
11
0
40
1.39
103952978--103953020
19
2.2
20
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4
70
48
6
0
44
1.29
103955731--103955771
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2.0
21
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0
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36
17
4
41
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25
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14
61
17
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50
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10
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1.9
87
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0
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19
20
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40
2.0
40
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0
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20
1.9
20
94
0
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28
21
26
23
1.99
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16
2.4
16
87
12
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5
0
28
1.12
103990981--103991020
11
3.6
11
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0
53
55
0
17
27
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104004092--104004157
31
2.1
31
86
5
89
45
7
10
36
1.67
104004731--104004768
19
2.0
19
100
0
76
26
26
21
26
1.99
104005014--104005089
34
2.2
34
92
0
125
26
6
31
35
1.82
104010131--104010194
32
2.0
33
84
3
85
25
20
1
53
1.55
104010152--104010201
18
2.6
19
87
6
66
22
22
2
54
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104016967--104016993
6
4.5
6
100
0
54
33
33
14
18
1.92
104021187--104021233
21
2.2
21
78
17
53
10
21
23
44
1.83
104023005--104023056
24
2.2
24
100
0
104
42
11
13
32
1.80
104031794--104031877
39
2.2
39
88
0
123
23
36
19
20
1.95
104035960--104036020
21
2.9
21
75
18
63
8
13
27
50
1.69
104036048--104036146
31
3.2
31
75
15
96
19
26
28
26
1.99
104038217--104038274
30
2.0
29
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0
1
56
1.09
104041118--104041641
229
2.3
228
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3
714
23
15
13
47
1.81
104044022--104044105
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2.1
40
95
0
150
10
11
38
39
1.77
104044195--104044219
12
2.1
12
100
0
50
40
16
8
36
1.77
104047061--104047094
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2.4
14
90
0
50
47
2
0
50
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0
0
100
0.00
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25.0
1
100
0
50
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0
0
100
0.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316

The End!