Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  225  of  316  ( 37835 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.84
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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51
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1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
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(0-2)
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61
1.19
73952283--73952409
20
6.5
19
75
12
80
29
4
1
64
1.23
73956102--73956243
40
3.6
40
78
6
146
31
23
17
26
1.97
73958464--73958575
34
3.3
33
79
4
134
41
0
15
42
1.52
73958631--73959146
125
4.1
126
83
1
619
38
16
15
28
1.90
73964924--73964956
17
1.9
17
88
11
50
48
3
6
42
1.43
73966215--73966260
15
2.9
16
72
15
51
47
0
26
26
1.52
73966785--73966827
20
2.1
21
86
4
61
25
2
9
62
1.37
73966977--73967021
23
2.0
23
82
8
56
60
13
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17
1.58
73967955--73967998
21
2.2
20
84
12
54
59
2
2
36
1.23
73967954--73968014
25
2.5
24
78
5
68
57
1
1
39
1.18
73972245--73972271
14
1.9
14
100
0
54
70
0
0
29
0.88
73973898--73973989
45
2.0
45
93
0
157
20
21
19
38
1.94
73977553--73977667
29
4.0
29
83
5
144
25
29
15
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73977891--73977925
8
4.4
8
92
0
61
8
25
22
42
1.82
73977898--73977932
16
2.2
16
94
0
61
8
22
20
48
1.76
73979270--73979315
19
2.4
19
92
0
74
36
26
15
21
1.93
73982130--73982244
29
4.0
30
83
7
134
26
31
13
28
1.94
73982132--73982244
58
2.0
57
84
8
149
25
30
14
29
1.95
73982459--73982493
16
2.2
16
94
0
61
14
22
14
48
1.79
73987659--73987702
15
3.1
15
83
6
56
6
15
0
77
0.97
73987670--73987708
14
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10
0
76
1.01
73988793--73988850
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2.1
28
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0
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2.0
21
100
0
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24
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2.0
13
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0
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0
0
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1.00
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3.6
40
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4
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27
22
25
24
2.00
74013273--74013410
40
3.5
40
88
4
206
18
30
18
32
1.95
74013331--74013392
20
3.1
20
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17
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16
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16
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12
3.5
12
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6
68
23
26
42
7
1.80
74022069--74022118
25
2.0
25
100
0
100
32
16
16
36
1.90
74036172--74036223
24
2.1
25
86
10
72
55
1
34
7
1.39
74037974--74038088
43
2.7
42
80
6
133
26
17
23
32
1.97
74044734--74044908
49
3.5
48
85
4
251
26
17
26
29
1.98
74044729--74044912
100
1.8
100
97
2
352
25
18
26
29
1.98
74060583--74060751
47
3.6
46
84
10
177
27
17
28
26
1.97
74060678--74060899
48
4.7
46
77
9
159
26
18
29
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74065536--74065596
30
2.0
30
83
0
77
42
4
22
29
1.75
74075785--74075823
21
1.9
20
89
5
60
30
0
17
51
1.46
74076779--74076804
5
5.2
5
100
0
52
38
0
0
61
0.96
74077185--74077285
48
2.1
48
90
0
166
19
16
28
34
1.94
74092592--74092712
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2.9
42
82
2
152
28
23
15
32
1.95
74094388--74094506
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5
107
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20
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27
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3
94
0
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2
0
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54
0
0
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0.99
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18
69
56
0
1
41
1.17
74102287--74102330
11
4.2
11
80
11
56
75
0
4
20
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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