Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  104050246

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   

This is table  20  of  316  ( 37835 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5984424--5984494
14
5.4
14
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11
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1
0
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1.05
5984424--5984488
27
2.5
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5
107
35
0
0
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0.94
5984581--5984648
35
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2
82
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1
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1.42
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3.1
19
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0
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0
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5992763--5992790
13
2.2
13
100
0
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0
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1.41
5993210--5993276
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1.9
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91
49
10
5
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1.62
5994259--5994293
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1.9
18
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14
2
2
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0.95
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2.0
30
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3
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2.4
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138
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1.62
6002919--6002965
25
1.9
23
83
12
58
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8
10
19
1.53
6002896--6003003
56
1.9
56
83
7
139
56
12
8
23
1.62
6005116--6005173
17
3.5
17
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50
53
0
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19
2.1
19
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0
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10
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10
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1.63
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2.4
14
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0
50
55
0
0
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0.99
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3.7
33
82
8
140
47
4
7
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1.53
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16
3.2
16
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5
97
24
0
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37
1.56
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45
2.0
45
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2
121
27
6
28
37
1.82
6021470--6021506
19
2.0
19
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15
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54
0
0
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1.00
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3.1
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68
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143
48
5
2
43
1.41
6021548--6021733
59
3.1
58
70
19
166
51
3
2
43
1.32
6021450--6021739
120
2.4
120
88
3
447
49
4
2
44
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6028096--6028173
31
2.6
30
83
6
86
50
12
3
33
1.59
6029837--6029872
16
2.3
16
95
4
65
72
5
2
19
1.17
6030637--6030737
50
2.0
50
98
0
193
52
5
0
40
1.32
6030855--6030934
28
2.9
27
80
12
90
56
2
16
25
1.53
6030872--6030934
14
4.5
14
77
0
54
55
3
15
25
1.55
6034830--6034867
19
1.9
19
89
5
58
50
2
2
44
1.30
6034830--6034874
19
2.3
19
84
7
54
48
2
4
44
1.35
6041722--6041771
26
2.0
24
88
7
73
30
0
6
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1.18
6042302--6042347
15
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12
58
69
0
0
30
0.89
6042269--6042339
27
2.5
29
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19
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63
1
0
35
1.03
6045254--6045315
27
2.3
26
76
13
63
48
11
1
38
1.49
6047237--6047409
93
1.9
93
91
0
283
27
29
20
21
1.98
6047230--6047405
46
3.8
46
76
12
180
28
28
20
21
1.98
6049863--6050114
130
1.9
130
89
3
391
35
16
19
28
1.93
6055818--6055890
36
2.0
36
97
0
137
36
17
8
36
1.80
6061344--6061437
26
3.4
26
69
18
82
54
2
5
38
1.35
6061343--6061441
34
3.2
34
60
28
85
53
2
5
39
1.34
6061344--6061458
57
2.0
57
98
0
221
53
1
7
36
1.40
6068703--6068745
22
2.0
22
95
0
77
27
25
20
25
1.99
6072811--6072856
17
2.5
19
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13
60
84
6
6
2
0.84
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17
2.1
17
94
0
61
54
2
5
37
1.39
6076109--6076180
37
2.0
36
83
8
92
54
1
9
34
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6076311--6076383
3
24.3
3
97
0
137
65
1
0
32
1.01
6079551--6079608
25
2.2
24
80
14
62
58
1
1
37
1.18
6083728--6083787
31
2.0
30
90
3
93
66
0
5
28
1.12
6084035--6084096
24
2.5
24
79
7
72
22
0
3
74
0.96
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20
2.4
20
83
13
55
41
6
0
52
1.27
6084200--6084249
20
2.4
21
83
3
66
36
6
2
56
1.36
6091320--6091357
17
2.2
17
90
0
58
34
2
2
60
1.24
6101541--6101572
16
2.0
16
100
0
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31
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12
50
1.65
6103639--6103709
31
2.3
31
87
2
97
30
5
5
57
1.45
6104124--6104202
24
3.0
25
80
10
88
55
8
8
26
1.60
6105474--6105618
72
2.0
72
100
0
290
38
17
11
32
1.85
6111501--6111566
19
3.2
21
87
6
64
36
19
9
34
1.84
6111518--6111579
19
3.2
19
95
4
106
35
17
9
37
1.83
6111936--6112158
45
5.1
45
73
8
154
23
28
16
31
1.96
6112197--6112750
89
6.3
89
81
9
652
28
20
17
33
1.95
6112197--6112750
176
3.1
174
86
6
703
28
20
17
33
1.95
6112914--6113448
84
6.4
84
88
5
821
25
21
22
30
1.99
6112914--6113448
167
3.2
168
89
4
830
25
21
22
30
1.99
6114399--6114448
6
7.8
6
82
12
64
12
4
0
84
0.76
6114405--6114470
20
3.2
21
83
10
84
7
9
0
83
0.82
6114399--6114462
33
2.0
32
90
9
103
9
6
0
84
0.78
6114398--6114473
13
5.8
12
76
15
62
7
7
0
84
0.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6114398--6114455
27
2.1
27
96
0
107
10
5
0
84
0.77
6114398--6114473
27
2.9
27
88
5
93
7
7
0
84
0.79
6120114--6120179
19
3.2
21
85
6
64
36
19
7
36
1.81
6120131--6120192
19
3.2
19
93
4
97
35
17
8
38
1.80
6120536--6120623
44
2.0
44
88
0
131
50
14
11
23
1.76
6123407--6123452
13
3.5
13
82
14
58
26
0
2
71
0.97
6124240--6124290
18
2.8
18
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14
50
54
0
5
39
1.24
6131559--6131609
18
2.8
18
77
14
50
54
0
5
39
1.24
6137612--6137759
3
50.3
3
71
7
81
29
8
2
58
1.42
6137750--6137812
25
2.5
24
80
10
63
36
7
1
53
1.40
6138148--6138204
22
2.5
23
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11
73
22
12
1
63
1.38
6139719--6139826
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
6140763--6140796
9
3.9
9
84
7
52
2
17
0
79
0.86
6140763--6140796
17
2.0
17
94
0
59
2
17
0
79
0.86
6140805--6140877
5
14.6
5
76
20
64
54
4
1
39
1.28
6140806--6140848
19
2.3
19
92
8
70
55
0
2
41
1.12
6140812--6140876
24
2.7
24
80
9
69
56
4
1
36
1.29
6145073--6145117
9
4.8
9
83
5
54
71
11
0
17
1.14
6145114--6145159
24
1.9
24
86
8
67
41
4
6
47
1.49
6145181--6145214
17
2.0
17
88
11
52
70
8
0
20
1.13
6158745--6158983
41
5.8
41
88
6
292
28
24
20
26
1.99
6179102--6179340
41
5.8
41
89
5
292
26
20
24
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6192860--6192893
17
2.0
17
88
11
52
20
0
8
70
1.13
6192915--6192960
24
1.9
24
86
8
67
47
6
4
41
1.49
6192957--6193001
9
4.8
9
78
10
54
17
0
11
71
1.14
6207109--6207151
21
2.0
21
82
8
52
25
16
32
25
1.96
6207720--6207788
33
2.1
34
82
10
92
39
10
11
39
1.75
6208257--6208315
16
3.5
16
74
23
50
35
1
0
62
1.05
6208250--6208324
30
2.6
29
76
17
75
36
1
0
62
1.04
6208292--6208341
26
1.9
26
83
0
64
36
4
0
60
1.16
6212434--6212474
18
2.2
18
82
4
55
53
2
0
43
1.13
6213426--6213459
14
2.5
13
86
9
50
47
0
0
52
1.00
6213434--6213460
7
3.9
7
100
0
54
44
0
0
55
0.99
6218724--6218766
9
4.8
9
100
0
86
9
23
46
20
1.79
6219419--6219493
17
4.4
17
75
18
66
30
6
2
60
1.37
6221631--6221701
36
2.0
37
89
10
112
32
28
15
23
1.95
6222080--6222113
17
2.0
17
88
0
50
47
0
2
50
1.16
6223108--6223151
22
2.0
22
82
8
54
27
31
4
36
1.77
6227055--6227105
18
2.8
19
85
14
72
35
23
13
27
1.93
6241908--6241979
37
1.9
37
83
10
94
58
6
5
29
1.47
6243325--6243481
40
3.8
42
85
8
225
22
20
24
31
1.98
6243309--6243481
82
2.1
83
94
1
303
22
18
24
34
1.96
6243464--6244663
44
27.5
44
72
11
900
31
25
15
27
1.96
6243656--6244077
224
1.9
229
94
3
755
29
26
14
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6243498--6244659
258
4.4
263
83
8
1372
31
25
15
27
1.96
6243886--6244659
132
6.0
132
95
3
1361
31
25
15
26
1.96
6252594--6252665
37
1.9
37
83
10
94
58
6
5
29
1.47
6259919--6259996
38
2.1
38
97
0
147
38
8
8
43
1.68
6262424--6262490
32
2.1
32
94
0
116
43
14
13
28
1.84
6262320--6262605
147
2.0
144
88
3
423
40
17
13
29
1.87
6263828--6263924
32
3.1
32
96
1
178
25
12
17
44
1.84
6267765--6267883
51
2.4
51
86
1
168
20
30
23
26
1.98
6269760--6269840
3
27.0
3
78
9
76
61
2
6
29
1.33
6271185--6271550
44
8.3
44
73
11
218
26
21
21
30
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316