Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  16  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5014935--5015013
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118
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0
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0
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10
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0
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1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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1.43
5057130--5057230
3
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1.41
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2.0
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18
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1.95
5119724--5120211
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18
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2.0
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4.7
46
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1
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23
21
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.92
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26
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25
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26
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0
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0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5207342--5207373
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1
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13
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60
1
0
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2
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0
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22
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5229470--5229643
46
3.8
46
76
7
163
22
21
27
29
1.99
5229466--5229638
93
1.9
93
90
2
276
22
21
28
27
1.99
5241581--5241649
15
4.6
15
79
0
75
13
17
11
57
1.64
5241572--5241659
30
3.0
30
78
8
90
11
17
14
56
1.66
5241581--5241660
15
5.4
14
77
4
61
11
17
12
58
1.62
5243976--5244028
26
2.0
26
82
7
63
37
20
15
26
1.92
5247153--5247328
46
3.8
45
80
10
203
21
20
29
28
1.98
5247149--5247320
93
1.8
93
93
0
299
20
20
30
27
1.98
5249389--5249431
21
2.0
22
90
4
70
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5249690--5249742
21
2.6
21
94
5
92
58
0
0
41
0.98
5249748--5249797
25
2.0
26
88
11
79
74
4
4
18
1.14
5250461--5250785
152
2.2
150
91
2
526
57
6
7
29
1.50
5251191--5251251
25
2.4
25
94
0
104
3
29
18
49
1.63
5251331--5251375
17
2.6
18
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3
56
17
8
0
73
1.08
5256339--5256428
44
2.0
44
100
0
180
36
27
11
24
1.89
5257427--5257464
20
1.9
20
88
0
58
36
15
10
36
1.82
5275843--5275911
34
2.1
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2
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59
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11
14
1.61
5277237--5277268
14
2.2
15
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5
57
43
0
6
50
1.27
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24
2.0
24
96
0
89
46
4
24
24
1.69
5291790--5291829
19
2.1
19
95
0
71
20
22
10
47
1.79
5302035--5302106
28
2.5
29
72
12
69
40
6
4
48
1.49
5302224--5302265
20
2.0
22
86
9
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26
30
0
42
1.55
5303438--5303470
7
4.7
7
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0
57
30
0
12
57
1.35
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3.3
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13
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3
6
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1.40
5304560--5304774
107
2.0
108
93
1
369
33
3
5
56
1.40
5304603--5304768
54
3.1
54
73
17
182
33
3
5
57
1.39
5304602--5304774
53
3.2
52
75
14
181
32
3
5
58
1.37
5304846--5304930
39
2.2
38
79
6
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42
5
5
45
1.52
5304669--5304910
128
1.9
126
86
5
317
37
3
4
54
1.40
5304872--5305162
149
2.0
143
93
5
498
41
7
8
42
1.63
5306685--5306716
15
2.1
15
94
0
55
0
15
0
84
0.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5311115--5311191
38
2.0
38
100
0
154
25
20
23
29
1.99
5311441--5311466
12
2.2
12
100
0
52
19
15
15
50
1.79
5315188--5315254
29
2.2
30
86
5
91
55
7
10
26
1.60
5316131--5316167
17
2.2
17
95
0
65
45
16
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27
1.80
5317106--5317302
104
1.9
106
81
2
245
37
13
11
37
1.81
5319391--5319451
29
2.1
30
87
3
88
54
4
3
37
1.39
5323584--5323623
20
2.0
21
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2
0
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2.1
20
95
0
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0
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2
2
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1.29
5329220--5329305
34
2.4
36
79
11
97
66
6
0
26
1.17

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295