Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  57  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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1.16
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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2.7
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18
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18
18
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22
3
44
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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63
0
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0
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3.5
54
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17
160
27
14
21
36
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16930716--16931033
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123
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14
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1.93
16931017--16931050
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2.1
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52
17
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18
36
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2.9
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10
309
26
17
18
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15
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10
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16931206--16931234
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1.9
15
100
0
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1.26
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16
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0
53
77
0
22
0
0.77
16932186--16932215
16
1.9
16
93
6
53
6
36
46
10
1.64
16932258--16932305
3
16.0
3
82
8
62
66
0
33
0
0.92
16932258--16932305
14
3.2
15
85
8
62
66
0
33
0
0.92
16932258--16932315
23
2.6
23
86
2
73
70
0
29
0
0.87
16932614--16932677
11
5.6
11
78
14
76
82
0
17
0
0.66
16932622--16932677
7
7.4
7
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18
60
83
0
16
0
0.64
16932616--16932671
16
3.2
19
80
17
75
83
0
16
0
0.64
16932614--16932671
18
3.4
17
88
9
82
82
0
17
0
0.66
16932616--16932677
23
2.7
23
85
7
81
83
0
16
0
0.64
16932616--16932677
14
4.1
14
77
22
72
83
0
16
0
0.64
16933031--16933073
22
2.0
22
86
8
63
34
13
9
41
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16933210--16933356
18
8.2
19
69
15
89
31
13
8
46
1.72
16933177--16933244
36
1.9
35
85
8
93
27
13
13
45
1.80
16933177--16933526
17
19.9
17
68
15
176
30
14
11
44
1.80
16934374--16934450
21
3.2
24
66
20
70
49
9
7
33
1.63
16934359--16934450
48
1.9
48
95
0
166
50
10
6
32
1.63
16934388--16934512
62
2.0
62
93
0
214
47
8
7
37
1.61
16938157--16938257
52
1.9
52
91
0
166
36
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15
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1.86
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16
2.0
16
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0
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9
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53
1.68
16948774--16948935
45
3.6
45
94
0
261
38
15
19
26
1.91
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16
2.0
16
100
0
64
12
12
25
50
1.75
16952414--16952575
45
3.6
45
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0
270
38
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19
25
1.91
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25
1.9
25
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0
78
37
16
27
18
1.92
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5
5.4
5
100
0
54
18
0
0
81
0.69
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8
4.9
8
84
9
53
58
28
0
12
1.34
16975719--16975757
15
2.4
16
83
12
53
58
28
0
12
1.34
16975719--16975763
16
2.9
15
83
6
54
57
26
2
13
1.48
16982517--16982557
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
16989228--16989262
15
2.4
15
95
4
63
37
0
5
57
1.23
16990173--16990216
22
2.0
22
86
8
63
54
0
0
45
0.99
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17
2.0
17
88
0
50
50
8
0
41
1.34
16991765--16991790
3
8.7
3
100
0
52
30
0
0
69
0.89
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11
3.1
11
91
4
50
6
0
21
72
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17014805--17014853
25
2.0
24
84
15
64
36
0
2
61
1.08
17014806--17014861
25
2.2
25
81
12
62
39
0
1
58
1.08
17015157--17015208
25
2.2
24
86
13
72
67
3
5
23
1.29
17017535--17017651
40
2.9
40
93
0
189
33
15
30
20
1.94
17017599--17018302
112
6.3
112
94
1
1178
25
19
29
26
1.98
17017599--17018302
225
3.1
224
94
1
1187
25
19
29
26
1.98
17018915--17018940
12
2.2
12
100
0
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38
7
34
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1.80
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2
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32
19
17
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1.95
17020503--17020542
11
3.7
11
90
3
64
35
10
27
27
1.89
17021902--17022066
40
3.7
40
73
24
150
44
10
1
43
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295