Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  3  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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43
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2.5
170
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0
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19
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20
2.1
19
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9
53
38
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5
48
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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1.9
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0
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0
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19
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5
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2.3
18
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52
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2
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5
58
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821073--821132
19
3.1
19
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17
61
35
1
5
58
1.30
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2.5
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6
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11
52
52
4
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4
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3.0
132
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1
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19
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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11
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0
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24
27
1.99
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2.5
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1.99
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132
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17
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0
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2.0
20
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4
55
31
0
4
63
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
887109--887147
20
2.0
20
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56
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2
33
1.41
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0
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0
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13
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56
3
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6
69
1.24
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3.1
15
84
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60
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19
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73
1.10
909328--909372
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20
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2.3
19
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55
0
2
41
1.12
915592--915656
24
2.7
24
80
9
69
56
4
1
36
1.29
919588--919634
22
2.1
22
100
0
94
25
10
17
46
1.79
920796--921002
98
2.1
98
93
1
353
31
22
11
34
1.89
925505--925558
26
2.1
26
100
0
108
44
18
7
29
1.77
927794--927848
27
2.0
27
100
0
110
43
0
25
30
1.55
928944--929033
45
2.0
45
95
0
162
33
22
8
35
1.85
944381--944564
62
3.0
62
91
3
307
41
20
4
33
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
945803--945855
11
4.6
11
80
15
54
79
13
3
3
1.01
946643--946833
103
1.8
103
85
5
265
23
17
11
47
1.80
947216--947711
44
11.3
44
77
5
470
27
16
25
31
1.96
947211--947711
132
3.8
132
95
0
876
26
16
25
31
1.96
947677--947957
134
2.1
134
96
0
517
27
20
23
28
1.99
947859--948529
95
7.0
95
98
0
1270
29
20
22
27
1.98
948600--948759
45
3.4
45
65
17
117
29
18
23
28
1.98
948565--948761
97
2.0
97
94
2
344
30
19
22
27
1.98
948731--949058
46
7.3
46
65
17
152
27
18
22
31
1.97
948661--949173
134
3.8
134
94
0
900
28
19
21
30
1.98
949144--949336
44
4.4
44
68
2
120
30
18
24
25
1.98
949230--949421
43
4.4
43
66
7
111
28
19
26
26
1.99
949080--949422
130
2.6
130
92
0
542
28
20
23
27
1.99
953732--953782
26
1.9
27
84
11
70
60
1
7
29
1.36
963720--963988
134
2.0
134
98
0
520
29
22
13
35
1.92
965466--965490
13
1.9
13
100
0
50
76
0
0
24
0.80
965550--965577
3
9.3
3
100
0
56
67
0
0
32
0.91
965803--965897
3
32.0
3
83
6
104
60
2
6
31
1.34
965803--965943
36
3.8
37
74
15
94
58
2
7
31
1.36
966056--966095
3
13.7
3
84
5
55
62
2
2
32
1.22
966056--966093
20
1.9
20
94
0
67
63
2
2
31
1.22
970321--970359
15
2.7
14
88
4
60
64
0
0
35
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
970321--970367
15
3.2
14
77
17
51
63
0
2
34
1.06
978872--978908
14
2.4
17
86
13
53
48
0
0
51
1.00
979058--979108
14
3.6
14
74
7
50
68
0
13
17
1.21
979097--979130
16
2.1
16
88
5
50
76
5
14
2
1.09
987297--987343
18
2.6
19
83
10
62
74
0
6
19
1.03
989859--989911
21
2.5
21
82
14
65
47
1
1
49
1.23
993652--993680
12
2.5
12
94
5
51
0
0
13
86
0.58
999895--1000028
63
2.1
63
97
1
252
29
14
19
37
1.91
1002211--1002240
16
1.9
15
93
6
51
46
30
10
13
1.75
1008844--1008894
19
2.7
20
81
9
61
50
0
0
49
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295