Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  268  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85587813--85587925
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22
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85587813--85587925
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135
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22
22
38
1.93
85589267--85589408
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191
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85609931--85610195
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400
23
22
28
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1.99
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22
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1.9
119
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1.99
85618021--85618274
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36
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
2.8
13
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54
25
8
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31
1.86
85657849--85657884
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2
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1.15
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2.0
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29
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17
0
0
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18
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30
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6.4
41
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348
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22
20
1.97
85717563--85717854
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82
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90
0
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0
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3.7
7
100
0
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15
0
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1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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43
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22
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1.99
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2.0
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19
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0
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1.17
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38
3.2
36
82
8
123
63
2
1
32
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85749446--85749533
37
2.3
38
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3
124
65
2
2
29
1.16
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20.0
9
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4
1
63
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18
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1.24
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27
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9
12
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34
20
1.87
85779778--85779829
22
2.6
19
75
16
50
26
3
3
65
1.27
85784830--85784860
16
2.0
15
93
6
53
32
3
25
38
1.72
85798081--85798269
49
3.9
48
74
7
143
34
16
22
26
1.95
85798139--85798456
51
6.5
48
79
8
137
37
18
16
27
1.93
85798305--85798459
51
3.0
51
99
0
301
34
18
15
30
1.92
85804789--85804853
22
3.0
22
93
0
103
20
9
18
52
1.72
85808691--85808730
20
2.0
20
100
0
80
50
0
0
50
1.00
85821536--85821567
16
2.0
16
93
0
55
53
25
0
21
1.46
85821536--85821620
23
3.7
23
76
7
75
51
28
0
20
1.47
85821567--85821620
22
2.4
23
81
3
65
50
31
0
18
1.48
85828002--85828038
16
2.3
16
86
13
58
40
0
0
59
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85828055--85828105
13
3.7
13
75
14
57
56
0
0
43
0.99
85828053--85828136
16
5.7
15
69
17
59
54
1
1
42
1.15
85828058--85828127
29
2.4
29
97
0
131
54
1
0
44
1.09
85828033--85828147
29
3.9
28
83
13
117
55
0
1
41
1.16
85832570--85832618
22
2.2
23
88
3
73
32
4
4
59
1.35
85847545--85847626
33
2.5
33
82
7
96
29
0
6
64
1.17
85850609--85850782
60
2.9
60
78
6
167
39
25
11
23
1.88
85856331--85856381
26
2.0
25
81
14
59
60
3
0
35
1.15
85857841--85857886
22
2.1
21
84
4
56
47
8
4
39
1.54
85867250--85867302
21
2.5
21
75
0
52
18
28
32
20
1.97
85873797--85873850
24
2.2
24
96
0
99
31
22
12
33
1.92
85878979--85879061
41
2.0
41
100
0
166
28
14
26
30
1.95
85879607--85879640
17
2.0
17
100
0
68
58
11
5
23
1.55
85879740--85879784
5
9.0
5
92
0
63
53
4
0
42
1.21
85880069--85880510
232
1.9
229
80
7
518
37
19
7
35
1.81
85904219--85904261
21
2.1
21
83
8
54
48
2
0
48
1.14
85914989--85915049
26
2.3
26
85
0
95
29
27
11
31
1.92
85922373--85922428
23
2.5
22
74
8
58
60
16
0
23
1.35
85927954--85928032
40
2.0
40
92
0
131
13
13
35
36
1.85
85930378--85930494
58
2.0
58
100
0
234
44
5
12
37
1.65
85931749--85931782
17
2.0
17
88
0
50
47
0
8
44
1.34
85936673--85936782
56
1.9
57
92
1
186
32
25
15
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85945404--85945528
62
2.0
62
100
0
250
27
22
14
36
1.93
85947563--85947600
20
1.9
20
84
10
51
60
0
0
39
0.97
85950181--85950249
20
3.3
20
72
20
70
47
0
0
52
1.00
85950861--85950914
20
2.7
20
94
5
92
11
31
37
20
1.88
85953007--85953051
23
1.9
24
95
4
83
35
33
4
26
1.77
85953069--85953130
3
21.0
3
90
9
101
66
0
1
32
1.02
85954821--85954889
21
3.4
21
73
15
72
37
1
5
55
1.33
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3
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13
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31
5
3
59
1.38
85957565--85957657
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3.7
24
77
20
84
29
5
3
62
1.33
85957932--85957990
27
2.2
27
81
6
66
25
5
6
62
1.41

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295