Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  63  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18203955--18204007
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2.2
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10
3.3
10
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4
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62
0
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24
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2.5
22
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24
16
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
52
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0
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16
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2.0
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20
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10
39
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2
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2
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1.33
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13
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1.29
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25
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28
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1.61
18365731--18365802
23
3.0
23
68
7
63
19
4
31
44
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18365895--18365919
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0
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0
0.80
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16
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52
0
0
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1.00
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1.9
14
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0
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0
0
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23
1.9
23
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0
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29
13
29
27
1.94
18412202--18412328
43
2.9
43
83
8
159
25
18
30
25
1.98
18412250--18412342
43
2.2
43
86
3
125
26
17
31
24
1.97
18424262--18424304
19
2.2
20
91
4
70
32
11
6
48
1.66
18424887--18424968
40
2.1
39
88
6
121
29
10
10
48
1.72
18429240--18429272
16
2.1
16
88
11
50
75
0
12
12
1.04
18429460--18429499
16
2.5
16
100
0
80
55
0
12
32
1.38
18433506--18434032
265
2.0
264
94
0
919
35
15
17
32
1.91
18435968--18436014
24
2.0
23
87
4
67
51
21
12
14
1.76
18436158--18436202
23
2.0
23
81
0
54
48
17
15
17
1.81
18438062--18438233
43
4.0
43
70
17
135
25
18
26
30
1.98
18443978--18444007
12
2.5
12
94
0
51
6
20
43
30
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18447687--18447720
16
2.1
16
89
10
52
55
0
8
35
1.31
18447836--18447957
53
2.3
53
88
2
174
19
19
18
42
1.89
18448088--18448139
18
2.8
19
76
5
61
30
7
11
50
1.67
18448086--18448155
18
3.8
18
74
9
52
34
11
10
44
1.74
18448175--18448235
18
3.4
18
76
0
68
40
8
11
39
1.71
18448162--18448244
36
2.3
36
87
0
112
39
7
12
40
1.70
18454281--18454323
4
10.8
4
84
0
59
48
23
2
25
1.62
18454384--18454431
4
12.0
4
77
0
51
47
20
2
29
1.61
18465598--18465830
122
1.9
122
99
0
457
29
10
18
41
1.84
18465956--18466022
34
2.0
34
100
0
134
16
35
5
41
1.73
18468037--18468110
29
2.6
28
79
10
69
28
6
0
64
1.18
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15
3.9
16
81
14
65
29
8
0
62
1.24
18468051--18468119
32
2.2
32
82
10
79
30
8
0
60
1.26
18468077--18468122
15
2.9
15
93
6
74
26
8
0
65
1.21
18468262--18468416
3
50.7
3
75
16
124
30
3
1
63
1.23
18476188--18476278
19
4.9
19
86
8
134
35
12
17
35
1.87
18476188--18476285
35
2.7
37
81
12
123
35
11
18
34
1.86
18476239--18476301
23
3.0
22
84
11
71
36
7
17
38
1.79
18481915--18481992
1
78.0
1
74
0
57
85
0
14
0
0.59
18481915--18481990
11
6.9
11
77
10
84
85
0
14
0
0.60
18481929--18481992
7
8.9
7
80
13
76
85
0
14
0
0.59
18481915--18481992
22
3.5
22
87
1
111
85
0
14
0
0.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18481917--18481978
9
6.7
9
85
12
65
85
0
14
0
0.60
18482902--18483223
44
7.3
44
90
2
477
27
13
29
28
1.94
18483313--18483967
78
8.4
78
93
0
1060
32
18
24
24
1.97
18484000--18484199
45
4.5
45
81
2
224
34
14
27
24
1.94
18484019--18484185
89
1.9
89
86
2
237
31
13
28
26
1.94
18484551--18484632
19
4.5
19
87
9
134
35
10
17
36
1.85
18484572--18484627
18
3.5
15
81
18
60
37
10
16
35
1.83
18484559--18484629
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2.0
36
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2
126
36
11
15
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1.83
18485239--18485280
21
2.0
21
95
0
75
30
9
7
52
1.61
18486631--18486762
46
2.8
46
75
7
115
33
18
22
25
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295