Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  50  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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0
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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1.8
88
86
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236
35
19
17
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15103236--15103422
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19
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25
1.96
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4.2
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70
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243
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20
19
27
1.97
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14
2.5
14
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17
17
1.55
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86
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19
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0
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19
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16
28
1.96
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151
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1
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23
16
28
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1
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44
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44
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8
125
37
23
4
34
1.75
15121603--15121658
28
2.0
28
100
0
112
42
14
14
28
1.84
15132631--15132662
7
4.4
7
96
4
55
0
40
0
59
0.97
15133146--15133205
30
2.0
30
100
0
120
40
10
13
36
1.78
15150122--15150147
3
8.7
3
100
0
52
69
0
0
30
0.89
15152701--15152745
23
2.0
23
82
8
56
2
42
0
55
1.12
15152715--15152747
8
4.2
8
96
3
59
0
39
0
60
0.97
15153236--15153299
32
2.0
32
100
0
128
43
9
12
34
1.75
15156122--15156167
13
3.3
14
82
17
60
15
0
2
82
0.76
15156122--15156166
21
2.1
22
91
4
74
13
0
2
84
0.72
15156349--15156386
20
1.9
20
89
10
60
52
5
2
39
1.38
15157455--15157479
11
2.3
11
100
0
50
64
0
0
36
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15158396--15158497
39
2.8
36
75
11
107
28
46
6
18
1.75
15158422--15158498
39
2.0
39
89
0
118
31
44
6
18
1.75
15164167--15164215
24
2.0
24
100
0
98
46
8
12
32
1.71
15164111--15164265
80
1.9
80
98
0
301
38
12
10
39
1.77
15166340--15166384
22
2.0
22
91
0
72
33
2
15
48
1.57
15170940--15170984
22
2.0
22
91
0
72
33
2
15
48
1.57
15173909--15173976
8
8.1
8
72
18
50
57
2
0
39
1.14
15173903--15173984
43
2.0
39
83
9
101
58
2
0
39
1.11
15177740--15177796
30
1.9
30
82
13
73
47
5
0
47
1.24
15178257--15178311
28
2.0
28
96
0
101
27
18
34
20
1.95
15180826--15180860
14
2.5
14
90
0
52
37
20
5
37
1.76
15181640--15181671
8
4.0
8
91
0
55
50
21
0
28
1.49
15181687--15181811
62
2.0
62
92
0
205
48
8
6
36
1.60
15185441--15185527
43
2.0
43
100
0
174
55
20
0
24
1.44
15185769--15185828
27
2.2
27
90
0
93
21
23
33
21
1.97
15186058--15186095
18
2.1
19
90
9
62
36
0
7
55
1.29
15186474--15186511
17
2.2
17
90
9
60
47
5
7
39
1.55
15186647--15186686
21
1.9
21
90
10
64
27
0
0
72
0.85
15186647--15186703
15
3.9
14
80
15
62
28
1
0
70
0.98
15189935--15189982
14
3.4
14
76
2
51
72
4
2
20
1.11
15191382--15191424
23
1.9
22
86
13
61
20
11
6
60
1.54
15191590--15191633
14
3.3
14
75
12
56
47
4
9
38
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15191583--15191641
26
2.6
21
72
23
55
47
5
10
37
1.59
15191589--15191641
26
2.0
26
100
0
106
45
3
11
39
1.58
15191596--15191640
14
3.4
14
75
12
58
46
4
13
35
1.63
15192178--15192240
29
2.3
27
83
10
74
47
1
0
50
1.10
15192188--15192244
8
6.5
8
79
15
51
49
1
0
49
1.11
15192178--15192292
18
6.0
18
68
16
61
46
1
0
52
1.11
15192341--15192366
13
2.0
13
100
0
52
53
0
0
46
1.00
15192406--15192516
17
6.4
17
67
14
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43
0
1
54
1.17
15192471--15192540
9
7.8
9
72
12
54
40
0
1
58
1.07
15192347--15192498
71
2.1
74
86
9
233
46
1
3
49
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295