Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  9  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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0
0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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0
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0
1
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
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21
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7
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1.47
2984834--2984921
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2.7
32
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13
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32
23
10
32
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2986717--2986774
3
19.3
3
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62
1
5
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1.51
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6.7
44
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8
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26
21
21
30
1.98
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6.8
45
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10
221
26
21
21
31
1.98
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3
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79
62
1
4
31
1.26
3005571--3005639
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2.3
29
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9
75
4
7
46
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1.51
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19
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0
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21
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0
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2
0
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1.15
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17
2.5
17
85
14
52
54
0
0
45
0.99
3008475--3008509
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
3008251--3008521
143
1.9
147
93
4
478
46
3
2
46
1.34
3008675--3008721
17
2.9
16
78
18
53
46
2
6
44
1.40
3008694--3008727
17
2.0
17
94
0
59
50
0
5
44
1.26
3008760--3008953
92
2.1
91
88
5
284
46
4
4
44
1.41
3010353--3010379
11
2.5
11
100
0
54
51
18
7
22
1.70
3019349--3019533
61
2.9
62
77
16
189
51
4
3
40
1.38
3019422--3019473
20
2.8
18
78
21
63
51
0
3
44
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3021338--3021367
12
2.5
12
94
0
51
46
0
6
46
1.29
3021452--3021494
17
2.6
17
85
10
54
62
4
0
32
1.15
3021449--3021499
18
2.8
19
80
14
63
60
7
0
31
1.25
3021713--3021797
3
28.3
3
73
17
63
65
1
3
29
1.16
3021713--3021797
11
7.4
11
71
19
66
65
1
3
29
1.16
3021713--3021794
24
3.4
23
74
14
76
65
1
3
29
1.17
3021713--3021797
35
2.3
36
78
8
91
65
1
3
29
1.16
3022127--3022194
22
3.0
22
82
6
66
58
29
1
10
1.40
3022287--3022386
38
2.6
38
96
0
182
21
10
49
20
1.77
3027833--3028199
46
7.6
49
85
10
431
34
13
22
29
1.93
3027833--3028199
98
3.7
97
84
9
501
34
13
22
29
1.93
3027847--3028199
196
1.8
196
92
0
607
34
13
22
29
1.93
3028163--3028272
37
3.0
37
94
1
195
37
16
21
24
1.93
3036506--3036759
126
2.0
126
100
0
508
21
16
19
42
1.89
3037385--3037460
35
2.2
35
90
2
118
17
5
18
59
1.56
3037895--3037974
38
2.1
38
97
2
153
37
10
23
28
1.87
3043007--3043036
15
1.9
16
93
6
53
0
33
3
63
1.11
3045135--3045190
22
2.7
20
76
15
60
26
7
5
60
1.44
3045198--3045231
17
2.0
17
94
0
59
44
0
0
55
0.99
3049498--3049554
29
1.9
30
89
10
91
40
12
7
40
1.70
3049976--3050034
29
2.0
29
96
0
109
27
37
3
32
1.73
3053660--3053721
31
2.0
31
84
6
81
40
14
8
37
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3057757--3057795
15
2.7
14
84
7
51
51
0
0
48
1.00
3063531--3063579
26
1.9
26
87
4
73
8
26
0
65
1.20
3063790--3063840
24
2.1
24
82
13
61
74
1
3
19
1.07
3064893--3064936
22
2.0
22
90
0
70
54
0
0
45
0.99
3064961--3064991
15
2.0
16
93
6
55
61
0
0
38
0.96
3065031--3065087
15
3.5
15
71
17
51
49
1
1
47
1.22
3065555--3065582
14
2.0
14
100
0
56
35
14
0
50
1.43
3068269--3068299
3
10.3
3
100
0
62
64
0
35
0
0.94
3070945--3071000
28
2.0
28
100
0
112
10
25
17
46
1.80
3070946--3071008
28
2.2
28
94
0
108
12
25
17
44
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295