Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  266  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
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Number
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Score
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292
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16
26
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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20
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25
27
21
24
1.99
85089173--85089353
79
2.3
80
83
7
226
25
28
21
24
1.99
85091412--85091471
27
2.3
26
82
8
68
31
26
16
25
1.96
85092244--85092311
27
2.5
27
95
0
118
32
17
11
38
1.86
85092244--85092327
27
3.1
26
80
10
89
30
15
13
40
1.85
85092937--85093145
27
7.8
26
78
5
152
32
9
16
41
1.80
85092937--85093106
54
3.1
54
77
9
186
31
8
17
41
1.80
85092964--85093166
81
2.5
80
85
4
248
31
8
18
41
1.81
85098500--85098553
27
2.0
27
100
0
108
33
14
18
33
1.92
85105805--85106208
46
8.7
47
74
13
202
26
20
30
22
1.98
85108628--85108710
42
2.0
42
83
9
107
16
28
30
24
1.97
85126672--85126818
47
3.1
47
91
0
231
29
12
12
45
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85127621--85127839
45
5.0
45
85
4
288
23
21
27
26
1.99
85127621--85127826
89
2.3
89
90
3
326
22
22
27
27
1.99
85128366--85128398
16
1.9
18
88
11
52
24
15
12
48
1.78
85129484--85129516
17
2.0
16
94
5
57
6
30
0
63
1.18
85131749--85132013
46
5.7
46
76
15
258
21
20
28
29
1.98
85131745--85132009
93
2.8
93
94
0
458
21
20
29
28
1.98
85133230--85133313
15
5.6
15
84
4
89
14
20
10
54
1.69
85133228--85133322
15
6.4
14
81
3
55
12
18
11
56
1.66
85135641--85135864
47
4.8
48
81
8
198
23
19
27
29
1.98
85135692--85135810
47
2.5
47
94
0
211
24
18
27
29
1.98
85137311--85137425
27
4.3
26
89
5
149
19
21
22
36
1.95
85159400--85159442
17
2.4
18
73
7
52
53
2
4
39
1.34
85159430--85159466
18
2.1
17
90
5
56
51
0
0
48
1.00
85164760--85164787
13
2.2
13
100
0
56
57
25
0
17
1.41
85165024--85165116
16
5.7
16
68
13
55
4
19
3
73
1.14
85165028--85165109
15
5.9
14
71
22
50
3
19
3
73
1.14
85165273--85165297
3
8.3
3
100
0
50
68
0
0
32
0.90
85167816--85167869
28
2.0
27
82
7
65
48
3
3
44
1.38
85167852--85167895
22
2.0
22
86
0
61
36
0
4
59
1.18
85178826--85178892
20
3.3
20
91
0
107
32
11
22
32
1.90
85178943--85179038
23
4.1
23
93
2
156
29
20
18
31
1.97
85179253--85179316
31
2.1
31
87
0
92
37
15
21
25
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85189682--85189849
40
4.2
40
82
8
148
27
27
20
24
1.99
85189717--85189902
80
2.3
80
83
9
229
27
27
20
23
1.99
85189719--85189902
40
4.6
40
83
7
205
27
27
21
23
1.99
85191972--85192192
45
5.0
45
88
2
315
23
21
29
25
1.99
85192126--85192232
41
2.6
41
82
8
110
27
20
30
21
1.98
85192720--85192752
16
1.9
18
88
11
52
24
15
12
48
1.78
85193663--85193709
17
2.6
18
83
6
51
34
23
17
25
1.96
85197842--85197884
17
2.4
18
73
7
52
53
2
4
39
1.34
85197872--85197908
18
2.1
17
90
5
56
51
0
0
48
1.00
85203201--85203228
13
2.2
13
100
0
56
57
25
0
17
1.41

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          289   290   291   292   293   294   295