Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  7  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2234949--2234991
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0
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62
0
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1.18
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18
3.6
18
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58
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1.24
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1
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2.1
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0
0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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51
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0
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0
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51
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0
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12
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2.0
33
100
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2.0
75
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8
20
34
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
45
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10
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30
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3
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33
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0
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2.1
26
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5
0
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60
0
0
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19
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26
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16
2.0
15
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53
12
19
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1.41
2387663--2387785
42
2.9
42
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2
149
30
6
17
46
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2387933--2388015
42
2.0
42
92
0
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6
21
45
1.75
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2.7
96
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10
13
50
1.73
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96
2.0
96
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283
22
13
11
52
1.72
2394422--2394472
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3.1
16
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18
52
35
1
0
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17
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17
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33
2
0
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1.05
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2.1
20
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0
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0
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52
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0
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0
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0
69
8
0
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68
1.16
2413120--2413163
15
2.7
17
82
13
65
61
31
0
6
1.22
2413120--2413162
16
2.7
16
85
10
61
60
32
0
6
1.23
2414272--2414314
11
3.9
11
81
0
50
34
0
4
60
1.17
2415668--2415719
8
6.5
8
78
8
52
63
1
3
30
1.23
2415672--2415719
16
3.1
15
87
6
60
62
2
4
31
1.26
2415738--2415790
21
2.7
20
82
8
63
69
0
3
26
1.05
2415860--2416008
25
5.9
24
69
16
79
57
4
6
30
1.45
2415943--2416073
25
5.5
24
73
13
85
56
3
5
35
1.38
2416001--2416073
23
3.2
22
74
14
60
57
2
4
35
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2416462--2416512
15
3.5
14
78
7
57
58
23
0
17
1.38
2418227--2418299
33
2.2
33
83
11
89
49
19
6
24
1.72
2420789--2420817
4
7.2
4
100
0
58
24
0
24
51
1.48
2424913--2424937
11
2.3
11
100
0
50
44
20
0
36
1.52
2425691--2425743
27
1.9
28
92
3
90
28
5
5
60
1.42
2425693--2425755
27
2.4
27
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7
76
26
7
9
55
1.59
2444297--2444340
21
2.1
21
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31
0
0
68
0.90
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7
4.9
7
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7
50
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0
0
60
0.97
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13
2.6
14
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4
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41
0
0
58
0.98
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22
2.2
22
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0
62
14
16
4
65
1.42
2451182--2451234
13
4.1
13
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54
32
9
24
33
1.87
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19
3.7
19
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5
70
38
0
1
60
1.06
2452682--2452738
9
6.0
9
78
10
60
38
0
0
61
0.96
2452667--2452738
20
3.8
20
80
7
78
38
0
1
59
1.06
2456180--2456220
21
2.0
21
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0
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19
29
21
29
1.98
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30
2.0
30
90
0
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26
3
13
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1.52
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16
2.6
15
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4
53
22
0
5
72
1.04
2465715--2465754
21
2.0
19
85
9
53
37
2
0
60
1.11
2472625--2472652
5
5.6
5
100
0
56
60
0
0
39
0.97
2473142--2473198
22
2.5
22
80
8
62
61
5
3
29
1.35
2474538--2474595
16
3.6
16
67
4
53
17
0
36
46
1.48
2474532--2474593
33
1.9
32
93
3
106
17
0
33
48
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2475227--2475270
21
2.0
22
82
4
54
43
2
2
52
1.26
2475908--2475960
11
4.7
11
82
13
63
64
1
32
1
1.15
2475890--2475960
3
25.3
3
73
18
55
67
1
29
1
1.07
2478782--2478822
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
2482442--2482481
21
1.9
21
89
0
62
25
25
22
27
2.00
2484788--2484835
24
2.0
24
95
0
87
25
22
29
22
1.99
2487761--2487807
25
2.0
24
87
8
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59
2
0
38
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24
2.1
23
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10
57
58
0
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1.23
2490112--2490155
23
1.9
23
86
9
63
54
0
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38
1.27
2491346--2491393
24
2.0
24
95
0
87
8
27
18
45
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295