Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  75  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21638059--21638148
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2.5
36
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0
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21643644--21643702
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2.0
30
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1.34
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36
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8
25
1.86
21645093--21645128
19
2.0
18
89
10
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2
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11
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14.3
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0
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2
30
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6.4
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196
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20
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1.98
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163
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21
21
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1.98
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87
1.9
87
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2
209
25
24
20
29
1.99
21648579--21649003
218
1.9
219
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1.98
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5.9
88
89
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25
23
22
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1.99
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5.2
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22
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49
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0
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2
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26
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21
2.0
21
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2.0
20
85
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298
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19
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19
2.5
20
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6
71
62
4
2
31
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21720196--21720244
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2.3
21
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2
10
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1.39
21720237--21720472
3
78.0
3
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13
128
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2
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1.36
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130
4.6
130
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2
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20
22
25
1.98
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260
2.4
260
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845
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20
22
25
1.98
21732783--21733030
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11
141
32
18
23
25
1.97
21732826--21733162
44
7.7
43
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13
195
30
19
24
25
1.98
21732780--21733198
88
4.8
88
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0
464
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20
23
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1.98
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0
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0
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2.3
25
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0
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0
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1.08
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3
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13
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51
34
0
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62
1.12
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2.2
24
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1.33
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20
10
10
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2.1
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82
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25
1
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1.39
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2.0
19
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2.0
31
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2.0
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0
38
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1.54
21769923--21769961
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2.3
17
86
8
53
33
2
0
64
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21769923--21769982
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30
1
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70
25
0
0
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0.82
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19
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12
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30
0
0
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30
2.1
30
93
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108
26
4
9
58
1.49
21775594--21775674
6
11.6
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75
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1
1
29
1.06
21775583--21775673
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4.2
22
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1
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68
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0
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1.55
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24
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3
4
35
1.35
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2.0
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1
5
33
1.29
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4.4
30
95
0
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19
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1.86
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0
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18
1.9
18
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5
52
52
5
0
41
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21818062--21818117
27
2.0
27
86
10
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50
1
3
44
1.29
21818121--21818168
24
2.1
22
88
7
69
22
6
4
66
1.32
21818122--21818168
23
2.1
21
84
11
58
23
6
4
65
1.33
21818158--21818234
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3.8
19
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20
59
32
3
1
62
1.22
21818210--21818257
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0
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18
0
0
81
0.70
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15
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23
0
0
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118
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0
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29
29
16
24
1.97
21832442--21832485
8
5.2
8
80
20
54
75
0
0
25
0.81
21832439--21832485
20
2.4
19
89
3
67
74
0
0
25
0.82
21832438--21832496
13
4.5
13
79
8
57
69
0
0
30
0.89
21835061--21835130
34
2.1
34
100
0
140
28
8
5
57
1.52
21835329--21835364
15
2.4
15
85
0
54
36
0
8
55
1.30
21835620--21835665
20
2.3
20
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2
8
56
1.42
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16
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16
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0
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0
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0
39
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15
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15
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0
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0
8
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1.30
21838647--21838691
20
2.3
19
82
14
56
35
4
6
53
1.47
21844865--21844894
15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
21851012--21851049
18
2.1
18
90
0
58
23
2
5
68
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21854462--21854486
12
2.1
12
100
0
50
60
0
0
40
0.97
21854468--21854510
23
1.9
22
85
4
59
48
4
4
41
1.44
21857600--21857675
5
14.8
5
75
15
57
23
27
11
36
1.90
21857610--21857677
26
2.6
26
92
0
118
26
27
10
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19
2.1
19
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42
0
0
57
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1.9
19
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5
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1.78
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21
2.0
21
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0
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29
21
29
1.98
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21
2.0
21
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24
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1.74
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8
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8
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0
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0
10
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3
4
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1.36
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4.6
9
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0
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0
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18
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18
0
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1.11
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2.3
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26
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1
0
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1.11
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22
1.9
22
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1.25
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12
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1.14
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59
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3
3
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1.35
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119
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120
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2
492
43
2
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50
1.34
21909074--21909129
15
3.5
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42
0
0
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146
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2
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18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21909182--21909456
147
1.9
149
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1
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47
2
3
46
1.35
21909341--21909375
18
2.0
17
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5
52
45
0
0
54
0.99
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47
2.0
47
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0
130
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2.1
22
87
0
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28
0
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12
100
0
50
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0
0
16
0.63
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86
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47
8
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1.70
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1.9
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4
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62
0
2
34
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0
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1.54
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13
4.9
13
81
7
85
29
7
26
35
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295