Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  287  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91118554--91118613
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2.3
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0
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0
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0
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0
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10
0
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3.0
22
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20
69
33
46
0
19
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.64
91163310--91163357
14
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14
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2
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2
25
1.62
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25
20
32
1.98
91163769--91164133
81
4.5
81
86
2
444
21
25
20
32
1.98
91163769--91164133
41
8.9
40
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424
21
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20
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1.98
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2.0
50
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186
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1.32
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2
32
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32
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1
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1.28
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20
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20
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22
20
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91182428--91182482
14
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52
1
1
43
1.22
91182737--91182836
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72
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60
62
3
5
30
1.32
91182876--91182936
26
2.3
26
83
10
79
52
0
3
44
1.17
91182877--91182957
26
3.2
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51
0
4
43
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2.8
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47
0
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30
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3.7
46
76
13
190
29
29
20
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
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93
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20
20
1.97
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2.9
26
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11
11
28
1.75
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2.1
25
100
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25
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38
1.74
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38
4.3
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80
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154
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20
25
33
1.97
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1.98
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5
157
19
20
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3
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18
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1.91
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3.1
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18
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1.93
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154
2.6
153
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5
364
39
16
18
25
1.91
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12
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17
25
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23
2.1
23
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20
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20
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2.1
47
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19
20
29
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25
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22
16
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1.95
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9
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15
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5
22
36
1.77
91288055--91288113
20
3.0
20
92
0
100
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22
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1.80
91288170--91288267
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2.1
47
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5
171
30
20
20
28
1.98
91288169--91288288
24
5.0
24
88
10
174
30
20
21
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91291820--91291851
17
1.9
17
93
6
57
65
0
6
28
1.16
91294047--91294177
57
2.2
59
85
4
167
19
19
17
42
1.89
91294153--91294191
6
6.5
6
90
0
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23
17
10
48
1.78
91294153--91294197
12
3.8
12
90
0
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24
20
8
46
1.78
91294153--91294197
18
2.5
18
85
0
63
24
20
8
46
1.78
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17
2.2
17
86
4
51
33
17
12
35
1.88
91294359--91294393
18
1.9
18
94
0
61
40
5
8
45
1.58
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12
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12
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12
20
2
64
1.40
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477
22
24
28
24
2.00
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24
2.5
24
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5
86
18
16
11
54
1.71
91297631--91298180
275
2.0
275
100
0
1100
27
14
14
43
1.85
91300909--91300950
5
8.6
5
86
5
59
78
2
2
16
0.96
91303216--91303278
10
6.8
9
70
25
51
65
0
3
31
1.09
91303216--91303278
21
3.4
17
80
14
56
65
0
3
31
1.09
91303857--91304007
30
4.9
30
72
17
98
35
6
2
55
1.40
91303989--91304025
18
2.1
18
89
0
56
29
8
0
62
1.24
91304356--91304398
15
2.9
14
80
10
50
46
0
4
48
1.22
91305702--91305751
17
2.7
20
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18
70
10
0
44
46
1.37
91310341--91310390
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
91312177--91312210
14
2.5
14
95
4
61
26
8
5
58
1.51
91315530--91315572
20
2.2
20
82
0
50
37
0
2
60
1.10
91316184--91316223
19
2.1
19
90
0
62
32
15
15
37
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91320403--91320468
11
7.1
9
73
23
57
63
1
0
34
1.04
91320427--91320456
15
2.0
15
100
0
60
66
0
0
33
0.92
91320416--91320469
26
2.1
26
89
6
83
66
1
0
31
1.02
91323670--91323714
19
2.3
20
85
14
67
64
0
0
35
0.94
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22
1.9
22
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0
75
54
7
11
26
1.62
91324911--91324950
11
3.6
11
79
0
53
57
7
15
20
1.61
91325241--91325273
6
5.8
6
86
13
52
63
0
0
36
0.95
91325240--91325301
12
5.5
11
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17
56
56
1
0
41
1.09
91325249--91325320
29
2.5
30
78
17
80
52
1
0
45
1.09
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2.1
15
94
0
55
59
0
3
37
1.13
91331382--91331418
16
2.3
17
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13
51
35
0
2
62
1.10
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10
4.9
10
82
9
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18
8
4
69
1.30
91341927--91342057
3
44.0
3
71
10
72
29
8
3
58
1.46
91341930--91342040
41
2.7
41
79
10
104
29
9
4
56
1.50
91342026--91342063
18
2.1
18
90
0
58
28
10
0
60
1.30
91342119--91342178
7
8.3
7
76
12
59
28
0
3
68
1.05
91342378--91342424
3
15.7
3
100
0
94
34
0
0
65
0.93
91342930--91342996
33
2.0
33
97
0
125
31
19
19
29
1.96
91343756--91343797
20
2.0
21
90
4
68
45
9
16
28
1.79
91346800--91346844
23
1.9
24
82
13
58
17
11
6
64
1.46
91349527--91349599
30
2.4
32
75
11
82
60
5
5
28
1.42
91350106--91350134
7
4.3
7
95
4
51
89
0
0
10
0.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91350767--91350805
19
2.1
19
85
0
51
69
5
20
5
1.28
91351509--91351591
44
1.9
44
85
7
116
27
26
19
26
1.99
91351643--91352154
86
5.9
86
75
7
412
24
22
22
30
1.99
91351786--91352314
130
4.1
130
92
0
860
25
24
20
29
1.99
91351657--91352114
216
2.1
215
80
4
510
25
22
22
29
1.99
91351867--91352288
86
4.9
85
73
8
325
25
23
20
30
1.99
91351657--91352314
44
15.2
43
72
8
375
25
23
20
29
1.99
91353837--91354306
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10.7
44
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25
24
21
28
1.99
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132
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2
758
25
23
22
29
1.99
91353812--91354308
262
1.9
262
95
0
906
25
23
22
28
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295