Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  6  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1833226--1833279
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22
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1
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0
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0
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0
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0
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2.2
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1931260--1931359
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2.2
46
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1
191
38
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18
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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0
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1973121--1973230
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2.3
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1975941--1975989
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2
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1977019--1977103
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0
0
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0
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2.0
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0
110
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3.2
13
77
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42
2
0
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1.13
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18
3.1
16
73
18
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2
2
40
1.22
1999095--1999145
23
2.2
23
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58
1
3
35
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1999597--1999675
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2.7
30
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5
99
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10
32
1.68
1999582--1999692
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10
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2.0
22
100
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22
4
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72
1.02
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2.2
17
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63
5
0
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1.17
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31
2.4
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14
13
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2013269--2013297
12
2.3
13
94
5
51
17
0
0
82
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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89
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9
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10
2.7
10
100
0
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30
13
10
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2.1
16
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5
57
46
0
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46
1.27
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0
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0
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22
2.0
22
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0
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17
24
26
1.97
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23
2.0
23
95
0
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48
20
6
24
1.73
2047107--2047817
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16
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0
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1
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2.0
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0
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0
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132
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1
557
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21
19
28
1.98
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21
19
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2.5
268
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1
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21
21
29
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2062182--2062862
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132
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21
21
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15
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2071527--2071650
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30
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1
176
44
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23
25
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2071564--2071640
15
5.1
15
66
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1.81
2076225--2076332
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12
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44
7
22
25
1.79
2076219--2076342
30
4.1
30
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1
203
43
6
24
25
1.78
2077533--2077602
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2.2
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100
0
140
31
22
11
34
1.90
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2.8
23
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11
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1
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50
1.32
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24
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23
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1
5
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0
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54
54
0
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42
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52
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0
0
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18
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0
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1.21
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0
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19
2.6
18
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12
51
40
0
4
55
1.19
2136132--2136177
23
2.0
23
100
0
92
21
13
8
56
1.63
2142679--2142723
21
2.1
21
84
8
56
44
4
0
51
1.21
2158177--2158241
20
2.9
23
88
8
91
61
3
3
32
1.27
2163755--2163849
45
2.1
45
100
0
190
42
8
0
49
1.33
2164762--2164812
26
2.0
25
85
11
68
54
0
0
45
0.99
2168567--2168610
22
2.0
22
86
8
63
56
9
2
31
1.43
2171759--2171816
28
2.1
28
90
0
89
50
10
5
34
1.59
2176797--2177084
153
1.9
153
86
1
407
27
25
13
34
1.94
2178053--2178094
12
3.5
12
78
12
50
57
0
7
35
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2178053--2178120
24
2.8
24
88
4
102
52
0
7
39
1.29
2178063--2178120
12
4.8
12
83
8
82
51
0
6
41
1.28
2180386--2180429
17
2.5
18
77
7
54
56
0
0
43
0.99
2188536--2188578
5
8.8
5
80
14
54
76
0
0
23
0.78
2188528--2188578
11
4.5
11
86
13
68
74
1
0
23
0.92
2188527--2188567
13
3.3
13
83
13
59
75
2
0
21
0.92
2188527--2188577
24
2.2
23
92
3
84
76
1
0
21
0.88
2193120--2193144
6
4.2
6
100
0
50
84
0
0
16
0.63
2195001--2195055
30
2.0
27
82
13
67
45
7
3
43
1.49
2202044--2202118
22
3.3
23
75
17
75
53
0
2
44
1.14
2202047--2202088
21
2.0
22
85
4
59
61
0
0
38
0.96
2209508--2209541
12
2.8
12
95
0
59
58
2
0
38
1.13
2217636--2217679
19
2.3
20
80
11
56
65
0
6
27
1.17
2217644--2217723
40
2.0
40
80
9
92
61
0
5
33
1.18
2217644--2217723
18
4.1
20
69
19
60
61
0
5
33
1.18
2217807--2217863
30
1.9
29
85
3
78
36
7
0
56
1.27
2217886--2217941
19
2.8
20
84
13
71
39
7
0
53
1.28
2217984--2218034
20
2.6
20
81
3
59
37
7
11
43
1.71
2218079--2218225
20
7.4
20
73
10
95
38
8
14
38
1.77
2218122--2218259
59
2.3
60
86
2
190
37
8
13
40
1.75
2218218--2218266
20
2.5
20
80
3
55
42
6
6
44
1.54
2219588--2219614
6
4.5
6
100
0
54
33
0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2220720--2220811
44
2.1
44
84
8
116
33
25
20
20
1.97
2221305--2221396
44
2.1
44
84
8
116
34
25
19
20
1.96
2220485--2221654
585
2.0
585
97
0
2232
37
21
11
29
1.89
2221724--2221754
6
5.2
6
100
0
62
83
0
0
16
0.64
2223339--2223465
46
2.8
46
93
0
209
21
21
26
30
1.98
2227713--2227765
13
4.1
13
73
9
54
41
20
1
35
1.64
2231230--2231306
40
2.0
39
85
10
104
38
5
19
36
1.74
2233814--2233876
25
2.6
24
73
14
56
19
25
19
36
1.94
2233830--2233900
25
2.8
25
80
4
63
15
26
21
36
1.93
2234111--2234184
24
3.0
24
72
14
71
22
27
14
35
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295