Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  21  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6381422--6381544
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91
5
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2.4
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1
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6384905--6385061
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3.1
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0
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9
190
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1.92
6385025--6385170
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4.0
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2.2
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10
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4.1
199
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0
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0
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0
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1.12
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0
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36
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2.1
46
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1.82
6421101--6421155
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3.4
16
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0
92
29
29
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3.4
46
80
6
176
21
29
21
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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0
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20
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2.0
21
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4
0
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1.22
6430573--6430619
23
2.0
23
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0
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2
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1.40
6430583--6430636
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1
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6431181--6431205
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0
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0
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146
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178
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2.7
350
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1385
29
19
23
28
1.98
6491210--6491315
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3.2
32
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2.0
255
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2.5
21
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4.1
7
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0
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13
27
13
44
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25
2.9
20
75
20
63
19
12
31
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25
2.2
25
100
0
108
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2.0
49
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31
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10
5.4
10
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4
58
71
7
0
21
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
30
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1
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48
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2.2
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2
54
1.23
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1.20
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1.70
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20
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0
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0
2
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2.0
20
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0
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10
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0
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0
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1.20
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0
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2.1
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10
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41
3
5
49
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6557000--6557047
18
2.7
17
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33
0
2
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1.05
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13
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0
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0
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0
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59
36
15
0
48
1.45
6590439--6590706
46
5.8
46
82
1
288
20
23
14
41
1.89
6590439--6590693
91
2.8
92
82
1
314
19
23
15
41
1.90
6590434--6590696
137
1.9
137
83
3
341
20
23
15
41
1.90
6598552--6598939
151
2.5
152
81
7
419
37
14
18
29
1.91
6606375--6606546
79
2.2
79
84
3
220
25
21
27
25
1.99
6606322--6606544
40
5.6
39
81
8
209
25
21
27
25
1.99
6606402--6606569
79
2.1
80
79
4
180
25
21
27
25
1.99
6608655--6608705
27
1.9
26
84
11
68
47
1
7
43
1.43
6608628--6608710
44
1.9
42
87
4
121
46
2
7
43
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6608987--6609020
17
2.0
17
94
0
59
41
8
5
44
1.60
6609689--6609776
41
2.1
41
95
0
158
36
7
19
36
1.81
6610328--6610766
221
2.0
221
98
0
844
44
7
5
43
1.54
6611792--6611855
29
2.2
31
88
8
98
51
1
0
46
1.10
6618261--6618320
30
2.0
31
90
3
95
38
10
11
40
1.75
6620948--6621064
60
1.9
61
80
1
137
41
21
11
26
1.86
6622215--6622253
20
1.9
21
89
5
62
30
2
7
58
1.39
6626374--6626506
66
2.0
66
98
0
257
31
17
22
28
1.96
6627363--6627409
21
2.2
22
78
17
55
63
4
0
31
1.13
6630330--6630442
31
3.7
29
75
11
84
32
8
4
53
1.52
6635776--6635847
30
2.3
32
79
11
87
52
8
11
27
1.65
6638917--6639011
10
10.3
9
74
15
79
65
2
1
31
1.11
6638917--6639002
19
4.8
17
74
14
66
65
2
1
31
1.13
6638916--6639011
28
3.5
27
78
16
90
65
2
1
31
1.11
6638962--6639023
29
2.1
30
82
8
74
62
1
3
32
1.20
6639248--6639311
29
2.2
29
83
8
76
37
9
1
51
1.44
6639278--6639350
19
3.7
19
74
13
76
27
4
5
63
1.35
6639342--6639410
29
2.5
27
83
6
84
37
1
1
59
1.15
6639381--6639429
19
2.6
19
83
9
64
36
2
0
61
1.08
6639363--6639421
28
2.1
28
87
6
84
42
1
0
55
1.09
6641223--6641340
10
12.4
10
68
16
65
37
2
3
56
1.29
6641220--6641299
36
2.2
37
86
2
108
36
0
5
58
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6641220--6641298
19
4.4
17
75
10
68
36
0
5
58
1.20
6641222--6641340
46
2.5
46
79
6
123
37
2
3
56
1.30
6642180--6642214
12
2.9
12
86
0
52
51
20
5
22
1.68
6650359--6650433
38
1.9
39
97
2
143
26
10
2
60
1.43
6650517--6650562
22
2.1
22
95
0
83
17
6
13
63
1.50
6656076--6656113
18
2.1
19
90
5
60
21
31
2
44
1.66
6658770--6659099
131
2.5
130
85
6
447
52
15
15
16
1.76
6662652--6662680
15
1.9
15
100
0
58
34
0
6
58
1.25
6664187--6664226
19
2.0
20
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13
57
37
0
0
62
0.95
6664185--6664232
25
2.0
24
95
4
87
37
0
0
62
0.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          289   290   291   292   293   294   295