Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  46  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13648742--13648899
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2.7
29
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
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22
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2.0
20
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12
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0
0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.2
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14
25
25
34
1.94
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2.4
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18
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28
7
17
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1.75
13855539--13855600
27
2.3
27
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27
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19
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1.78
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1.69
13875231--13875307
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2.0
39
97
2
147
37
2
15
44
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13879105--13879171
21
3.3
20
78
14
59
38
1
10
49
1.46
13879104--13879187
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3.1
26
71
18
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38
1
11
48
1.48
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100
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31
7
29
30
1.86
13982508--13982545
18
2.1
18
100
0
76
26
0
28
44
1.54
13982460--13982597
65
2.1
65
94
0
249
31
5
28
34
1.81
13982526--13982740
96
2.3
94
90
1
322
32
8
30
29
1.87
13982371--13982688
161
2.0
161
98
0
618
31
7
29
32
1.84
13988102--13988144
20
2.1
21
83
12
54
2
27
16
53
1.55
13990002--13990039
20
1.9
20
84
10
51
63
2
7
26
1.35
13995013--13995237
40
5.6
40
84
6
226
25
20
26
28
1.99
13995013--13995237
81
2.8
80
82
7
226
25
20
26
28
1.99
14002969--14003115
39
3.8
38
78
9
140
23
21
27
27
1.99
14014211--14014268
10
5.7
10
76
11
64
29
27
13
29
1.94
14014211--14014271
20
3.0
20
83
9
79
27
26
13
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14015483--14015520
13
2.8
13
82
17
51
73
0
18
7
1.06
14015484--14015534
21
2.4
21
74
6
50
74
1
17
5
1.11
14015537--14015599
33
1.9
33
84
12
85
55
6
25
12
1.60
14017622--14017679
10
5.7
10
76
11
64
29
27
13
29
1.94
14017622--14017682
20
3.0
20
83
9
79
27
26
13
32
1.93
14023433--14023479
23
2.1
23
84
7
62
51
12
4
31
1.59
14024026--14024064
20
1.9
21
89
5
62
23
28
12
35
1.91
14024454--14024479
13
2.0
13
100
0
52
46
0
7
46
1.31
14026227--14026323
30
3.2
30
75
2
106
28
26
15
28
1.96
14029027--14029097
37
1.9
37
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11
101
77
2
18
1
0.97
14029026--14029097
16
4.5
16
77
10
67
77
2
18
1
0.96
14029037--14029086
6
8.2
6
85
14
59
78
2
20
0
0.86
14029037--14029097
21
2.8
21
80
5
77
78
1
18
1
0.91
14029147--14029176
11
2.6
12
89
10
53
43
13
16
26
1.85
14029151--14029178
11
2.5
11
100
0
56
42
17
17
21
1.89
14031353--14031421
30
2.3
30
90
5
95
30
28
13
27
1.94
14038803--14038843
15
2.5
16
88
11
57
21
12
4
60
1.50
14038803--14038841
16
2.3
16
91
8
60
20
10
5
64
1.44
14038885--14038915
12
2.6
12
100
0
62
12
0
6
80
0.89
14057827--14057879
23
2.4
22
76
20
56
9
18
1
69
1.25
14063814--14063878
20
3.3
19
73
16
51
38
16
21
23
1.93
14066433--14066463
14
2.2
14
100
0
62
41
12
12
32
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14067165--14067227
33
1.9
33
84
12
85
12
25
6
55
1.60
14067225--14067280
21
2.7
21
72
5
51
8
17
1
71
1.21
14067224--14067280
14
4.1
14
75
16
57
8
17
1
71
1.19
14067287--14067345
18
3.3
18
80
0
64
6
11
6
74
1.21
14067319--14067349
11
2.7
12
90
10
55
0
9
6
83
0.79
14067242--14067349
6
17.7
6
67
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58
7
16
3
72
1.22
14068428--14068465
12
3.2
12
84
0
58
15
7
2
73
1.17
14068417--14068463
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2.0
24
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10
10
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1.28
14068384--14068449
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2.1
31
83
10
82
4
15
4
75
1.12
14068451--14068495
17
2.6
17
100
0
90
26
8
0
64
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295