Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  84  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24654711--24654763
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19
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2.1
35
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24
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0
0
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57
0
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9.9
44
89
0
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28
14
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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0
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2.2
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0
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1.19
24745731--24745798
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25
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18
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25
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13
22
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13
5.1
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71
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7
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3
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11
15
8
1.47
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20
27
1.98
24798364--24798628
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288
22
29
20
27
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2.3
17
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12
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7
0
70
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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18
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19
31
1.94
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2.3
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19
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7
65
1.44
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3.2
19
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18
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0
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0
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0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24860338--24860379
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10
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0
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1.9
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2.0
21
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0
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34
1.57
24909653--24909685
16
2.1
16
94
0
57
33
0
36
30
1.58
24909664--24909758
45
2.1
44
88
1
136
34
5
27
32
1.79
24909919--24909953
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
24909876--24909949
27
2.7
27
77
8
78
51
4
0
44
1.20
24909839--24910109
144
1.9
146
94
4
485
46
3
2
47
1.34
24910063--24910097
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
24910083--24910261
55
3.1
54
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22
128
49
7
2
41
1.43
24910078--24910265
61
3.1
61
68
14
190
49
6
2
41
1.41
24910046--24910268
120
1.9
120
97
0
419
49
6
2
42
1.40
24910183--24910217
18
2.0
17
88
5
52
60
0
0
40
0.97
24910258--24910304
17
2.9
16
78
18
53
46
2
6
44
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24910277--24910310
17
2.0
17
94
0
59
50
0
5
44
1.26
24922048--24922103
21
2.8
20
78
7
51
16
3
0
80
0.85
24922207--24922437
118
2.0
118
92
0
381
29
30
17
22
1.97
24923368--24923434
6
11.5
6
79
16
70
82
0
1
16
0.75
24923368--24923434
11
5.8
11
74
22
66
82
0
1
16
0.75
24923369--24923438
24
2.9
25
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18
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0
2
15
0.81
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14
100
0
54
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0
0
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0.92
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49
2.0
49
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7
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1
15
44
1.53
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15
3.3
14
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13
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42
4
0
53
1.20
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2.1
47
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0
162
31
19
12
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1.88
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19
1.9
19
100
0
74
16
21
18
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1.88
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27
1.9
27
84
4
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62
3
1
31
1.24
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46
2.0
46
93
0
161
31
12
2
53
1.51
24960756--24960827
24
3.1
24
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28
64
33
13
1
51
1.50
24961438--24961481
18
2.7
17
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20
58
45
0
2
52
1.13
24962996--24963033
20
1.9
19
94
5
67
44
0
21
34
1.52
24962994--24963039
21
2.3
19
85
7
65
41
0
23
34
1.55
24966991--24967021
15
2.1
15
93
0
53
25
22
19
32
1.97
24967893--24967932
20
2.0
20
100
0
80
20
5
10
65
1.42
24971798--24971850
26
2.0
26
100
0
106
22
22
11
43
1.85
24977453--24977634
68
2.7
68
86
1
249
35
16
21
26
1.94
24985410--24985434
12
2.1
12
100
0
50
24
36
24
16
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24985594--24985672
9
8.8
9
94
0
113
37
26
10
25
1.87
24986136--24986206
35
2.0
35
97
0
133
28
33
23
14
1.94
24994398--24994468
35
2.0
35
91
5
117
28
33
23
14
1.94
24999374--24999414
20
2.0
20
100
0
82
31
9
24
34
1.88
25000387--25000438
28
1.9
26
84
7
68
17
3
13
65
1.41
25016875--25016939
28
2.3
29
78
5
71
9
23
3
64
1.37
25022272--25022349
12
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11
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5
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34
2
0
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1.09
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34
2
0
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1.09
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3.0
10
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4
53
32
0
0
67
0.91
25034636--25035186
206
2.7
206
89
0
834
31
17
21
29
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295