Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  267  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85203464--85203502
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0
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0
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3
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1.14
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0
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2.1
22
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28
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0
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20
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3.0
21
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19
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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48
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19
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42
0
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80
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0
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2.0
40
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25
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2
2
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1.28
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2
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1
2
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2
3
65
1.19
85369047--85369145
9
10.6
9
72
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20
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1.47
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3.2
30
67
13
92
47
16
2
33
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85469052--85469173
61
2.0
61
100
0
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16
1
32
1.56
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2.0
43
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25
20
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1.46
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159
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17
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149
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20
2.0
20
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32
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0
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83
23
26
4
45
1.71
85498111--85498167
30
1.9
30
82
13
73
47
3
0
49
1.18
85509859--85509915
16
3.6
16
95
0
87
29
0
36
33
1.58
85510161--85510195
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
85510295--85510336
15
2.7
16
82
14
52
52
2
0
45
1.13
85510055--85510361
154
2.0
156
96
1
564
45
2
4
47
1.38
85510304--85510345
15
2.9
15
82
10
52
52
0
0
47
1.00
85510298--85510520
120
1.9
120
96
1
412
49
6
2
41
1.40
85510414--85510465
15
3.6
15
80
12
56
53
1
0
44
1.11
85510391--85510481
44
2.1
43
81
6
103
53
3
2
40
1.29
85510333--85510516
59
3.1
59
65
21
148
49
7
2
41
1.42
85510510--85510556
17
2.9
16
78
18
53
46
2
6
44
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85510529--85510562
17
2.0
17
94
0
59
50
0
5
44
1.26
85510595--85510788
93
2.1
91
87
5
275
46
4
4
44
1.41
85518186--85518223
4
9.5
4
94
0
67
73
0
2
23
0.95
85519425--85519496
19
3.7
18
72
18
56
31
5
2
59
1.35
85519425--85519527
20
5.2
19
75
10
82
33
3
3
58
1.35
85519556--85519595
19
2.2
17
86
8
53
45
0
2
52
1.14
85519592--85519704
29
3.9
28
71
14
86
25
5
0
68
1.17
85519442--85519743
10
32.2
9
66
24
76
33
3
2
60
1.29
85519670--85519731
28
2.2
29
82
8
74
24
1
1
72
1.02
85520697--85520747
21
2.4
21
93
0
84
29
19
17
33
1.95
85522470--85522499
15
1.9
16
93
6
53
76
0
23
0
0.78
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17
2.6
17
93
3
74
26
23
15
34
1.94
85529570--85529610
16
2.7
15
85
7
64
82
0
17
0
0.66
85531304--85531448
40
3.6
39
82
6
164
25
23
26
24
2.00
85533148--85533191
21
2.1
21
100
0
88
27
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13
25
1.93
85539346--85539490
40
3.6
40
83
4
175
24
24
26
24
2.00
85541308--85542065
295
2.6
297
82
4
876
40
11
13
34
1.80
85542301--85542336
17
2.1
18
89
5
56
41
0
0
58
0.98
85545145--85545186
17
2.5
17
81
11
50
30
9
0
59
1.29
85558908--85558932
11
2.3
11
100
0
50
0
16
0
84
0.63
85562626--85562712
10
8.9
9
68
24
52
64
1
5
28
1.24
85562605--85562700
30
3.4
27
71
23
72
64
3
5
27
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85562908--85562946
20
2.0
20
85
10
53
25
5
7
61
1.44
85562950--85562994
17
2.6
17
85
3
63
37
2
2
57
1.23
85566060--85566105
21
2.2
21
84
0
56
43
0
4
52
1.21
85566162--85566202
19
2.3
17
91
8
64
70
0
29
0
0.87
85567351--85567394
18
2.4
18
85
7
54
34
9
18
38
1.82
85578642--85578671
9
3.4
9
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46
0
0
53
1.00
85578626--85578682
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4.5
13
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43
0
1
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1.10
85578656--85578690
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2.0
18
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40
0
0
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664
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0
3802
27
12
18
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1.86
85583939--85583969
12
2.6
12
94
0
53
25
0
51
22
1.48

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295