Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  48  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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1.31
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4
117
61
2
1
35
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14643654--14643755
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3.9
26
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4
1
34
1.30
14643659--14643736
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2.8
28
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86
58
6
1
33
1.31
14643786--14643831
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2.0
23
83
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56
4
2
36
1.31
14643895--14643946
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3
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11
63
61
0
1
36
1.07
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10
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20
17
29
1.95
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0
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24
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0
38
1.20
14658468--14658513
23
2.0
23
83
8
58
56
4
2
36
1.31
14658577--14658643
30
2.2
30
100
0
134
59
0
2
37
1.13
14658577--14658661
3
28.7
3
79
11
86
60
0
3
36
1.14
14667222--14667284
22
2.8
22
78
4
63
55
4
3
36
1.37
14670815--14670900
41
2.1
40
82
2
100
65
10
3
20
1.38
14676929--14676984
15
4.1
13
76
14
51
44
0
0
55
0.99
14676933--14676975
15
2.8
16
79
10
54
46
0
0
53
1.00
14676915--14676998
43
1.9
43
83
11
109
44
1
1
53
1.16
14676870--14677088
120
1.8
120
97
0
420
43
1
5
49
1.36
14677053--14677094
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
14677044--14677085
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14677222--14677326
44
2.5
40
76
15
113
31
29
4
34
1.78
14677220--14677329
45
2.6
44
81
8
131
31
29
5
33
1.80
14677308--14677377
16
4.4
16
94
0
104
34
34
1
30
1.67
14689555--14689610
15
4.1
13
76
14
51
44
0
0
55
0.99
14689559--14689601
15
2.8
16
79
10
54
46
0
0
53
1.00
14689541--14689624
43
1.9
43
83
11
109
44
1
1
53
1.16
14689496--14689714
120
1.8
120
97
0
420
43
1
5
49
1.36
14689679--14689720
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
14689670--14689711
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
14689848--14689952
44
2.5
40
76
15
113
31
29
4
34
1.78
14689846--14689955
45
2.6
44
81
8
131
31
29
5
33
1.80
14689934--14690003
16
4.4
16
94
0
104
34
34
1
30
1.67
14695592--14695661
36
1.9
36
91
0
113
37
27
12
22
1.91
14697053--14697121
27
2.6
27
88
4
88
71
5
8
14
1.30
14697064--14697121
27
2.2
27
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3
100
72
3
10
13
1.24
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5
5.6
5
100
0
56
17
0
0
82
0.68
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23
2.1
23
88
0
69
27
8
0
64
1.22
14697972--14698085
4
28.8
4
68
11
56
22
11
1
64
1.36
14698152--14698198
17
2.8
17
84
12
53
27
6
2
63
1.30
14702760--14702788
12
2.4
12
100
0
58
62
0
24
13
1.32
14704483--14704521
9
4.0
9
87
12
51
23
10
2
64
1.37
14712880--14713109
3
77.3
3
67
14
84
57
2
8
31
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14713379--14713414
3
12.0
3
93
0
63
66
0
2
30
1.06
14713509--14713538
3
9.7
3
92
7
51
63
0
0
36
0.95
14714572--14715360
205
3.9
205
90
3
1221
29
22
18
29
1.97
14714572--14715360
409
1.9
409
90
2
1273
29
22
18
29
1.97
14728220--14728447
46
5.0
46
90
1
314
20
24
15
39
1.91
14731565--14731612
21
2.4
21
86
6
64
16
14
6
62
1.51
14731644--14731728
3
29.0
3
70
15
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29
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2
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18
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0
0
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0
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0
7
0
0.38
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3
12.0
3
100
0
72
33
0
0
66
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295