Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  18  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5655445--5656057
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3.2
192
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0
1138
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5656076--5656109
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1.45
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6
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80
0
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0
0.70
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0
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202
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11
11
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3.2
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11
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41
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158
35
12
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2.6
20
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42
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2.6
17
96
0
79
59
4
25
11
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5664504--5664541
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0
2
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1.12
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2.0
24
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8
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0
4
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2.1
15
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2.0
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3
17
29
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579
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4.4
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1.89
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13
3.7
13
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15
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2.0
24
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2.6
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0
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74
2.0
74
98
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32
15
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2.3
30
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4
2
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5687716--5687781
30
2.2
29
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69
46
16
4
31
1.67
5705547--5705579
14
2.3
15
89
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33
0
6
60
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17
27
1.95
5711225--5711719
273
1.8
273
89
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19
17
27
1.95
5711634--5713016
122
11.3
122
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2
1722
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17
17
31
1.94
5711634--5712968
611
2.2
611
86
2
1835
33
17
17
31
1.94
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128
2.0
124
88
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2.0
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2
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17
2.0
17
94
0
59
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5
0
50
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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2
7
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3.1
61
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14
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2
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49
1.41
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0
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120
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6
49
1.40
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2.0
17
88
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52
45
0
0
54
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4
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0
0
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0
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45
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1.47
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2.4
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0
0
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0
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2.4
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126
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17
2.0
19
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33
2
2
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1.25
5738919--5739244
129
2.6
125
79
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354
38
11
13
36
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5739492--5739528
18
2.1
17
90
5
56
32
2
0
64
1.07
5741699--5741739
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2.1
20
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4
57
78
0
17
4
0.93
5742464--5742504
20
2.1
20
86
4
57
58
7
0
34
1.26
5743841--5743902
30
2.0
29
84
9
79
48
8
14
29
1.72
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28
3.0
27
89
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121
19
3
31
45
1.67
5749117--5749184
28
2.7
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76
20
73
17
4
32
45
1.68
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2.4
21
80
0
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15
25
25
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1.95
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2.1
17
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10
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0
17
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0
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0
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1
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0
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31
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30
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98
31
1
12
55
1.47
5766146--5766304
73
2.2
72
94
2
275
44
5
4
45
1.47
5773497--5773561
33
2.0
33
82
11
80
50
0
3
46
1.17
5773723--5773771
21
2.3
22
85
7
73
44
4
8
42
1.53
5776340--5776439
40
2.5
40
88
0
137
33
22
19
26
1.97
5776511--5776635
40
3.1
40
79
4
153
37
20
17
24
1.93
5776344--5776731
195
2.0
195
83
2
485
31
19
20
27
1.97
5777063--5777100
18
2.1
18
100
0
76
50
23
21
5
1.69
5777777--5777835
21
2.8
21
75
10
57
22
0
37
40
1.54
5777802--5777867
7
9.7
7
75
4
64
16
1
39
42
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5777806--5777867
14
4.5
14
79
4
72
16
1
41
40
1.57
5777802--5777867
27
2.4
27
78
9
71
16
1
39
42
1.58
5780188--5780216
14
2.1
14
93
6
51
34
0
10
55
1.34
5780580--5780622
21
2.0
22
90
4
70
39
16
27
16
1.90
5780828--5780918
47
1.9
47
93
0
155
23
6
21
48
1.73
5782812--5782981
51
3.2
51
83
11
214
31
14
24
30
1.94
5782861--5782984
58
2.1
58
95
0
221
33
11
25
30
1.91
5784998--5785069
30
2.4
29
82
11
83
59
4
5
30
1.39
5800670--5800717
19
2.6
18
77
9
51
75
2
8
14
1.13
5800669--5800720
20
2.7
20
82
11
56
73
1
9
15
1.18
5803060--5803092
11
3.2
11
87
12
52
42
0
0
57
0.98
5803051--5803103
18
2.8
19
83
11
65
43
0
0
56
0.99
5803055--5803104
20
2.5
19
78
15
57
44
0
0
56
0.99
5815870--5816000
68
1.9
68
93
0
226
41
12
20
25
1.87
5815872--5816037
68
2.4
68
84
2
208
42
13
18
25
1.87
5822356--5822414
18
2.9
20
73
19
59
42
0
3
54
1.17
5826146--5826186
21
2.0
20
86
9
57
26
7
7
58
1.51
5828929--5828985
25
2.3
25
87
6
80
31
21
28
19
1.97
5833841--5833897
24
2.4
24
96
0
105
45
5
7
42
1.53
5836968--5836992
9
2.8
9
100
0
50
24
0
0
76
0.80
5837245--5837291
24
1.9
25
83
12
62
34
0
10
55
1.35
5838062--5838095
14
2.4
14
86
13
52
44
2
14
38
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5838210--5838251
22
1.9
22
95
0
75
52
0
0
47
1.00
5842249--5842415
77
2.2
78
82
5
196
37
9
20
32
1.85
5848703--5848747
23
2.0
23
86
4
65
44
20
4
31
1.71
5848700--5848757
22
2.6
22
84
7
73
41
20
3
34
1.69
5852464--5852718
55
4.8
53
79
7
234
35
18
25
20
1.95
5852474--5852671
108
1.8
110
86
4
294
34
18
25
22
1.96
5856632--5856676
23
2.0
23
91
4
74
46
17
4
31
1.68
5856658--5856708
19
2.9
17
83
11
66
35
17
9
37
1.83
5856629--5856686
22
2.6
22
86
7
82
43
18
3
34
1.68
5856642--5856699
19
2.8
20
84
10
64
39
17
6
36
1.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295