Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  284  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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2.1
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50
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
Entropy
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Period
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
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2.0
21
90
9
66
56
14
7
21
1.63
90283348--90283380
3
11.0
3
100
0
66
33
0
33
33
1.58
90289726--90289789
32
2.0
32
96
0
119
20
9
14
56
1.65
90294287--90294341
8
6.6
8
81
10
58
80
1
16
1
0.90
90294297--90294350
16
3.5
15
78
11
56
81
1
14
1
0.86
90294287--90294350
18
3.4
18
76
19
60
79
3
15
1
0.93
90300770--90300870
49
2.1
48
81
9
116
29
27
17
24
1.98
90307427--90307474
20
2.4
21
76
13
57
33
2
4
60
1.27
90309812--90309935
61
2.0
62
90
1
196
37
22
8
30
1.85
90311218--90311298
11
7.5
10
70
15
54
77
7
11
3
1.09
90311719--90311770
6
7.8
6
83
12
50
80
0
15
3
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90311719--90311769
13
3.7
14
80
12
61
82
0
13
3
0.81
90311719--90311769
7
7.4
7
78
12
61
82
0
13
3
0.81
90311710--90311770
20
3.0
20
79
15
72
80
1
14
3
0.92
90312747--90312942
97
2.0
95
94
1
338
30
19
22
27
1.98
90312842--90313180
134
2.5
134
91
0
534
27
20
23
28
1.99
90312909--90313105
46
4.4
46
66
10
136
25
20
23
29
1.99
90313189--90313832
132
4.9
132
96
0
1128
27
16
26
29
1.97
90315394--90315441
20
2.4
21
76
13
57
33
2
4
60
1.27
90317960--90317993
17
2.0
17
100
0
68
64
0
17
17
1.29
90318696--90318767
14
4.9
14
71
15
65
44
2
1
51
1.24
90327462--90327501
14
2.9
14
84
0
53
32
7
17
42
1.77
90327485--90327524
20
2.0
20
90
0
62
27
10
12
50
1.72
90327470--90327536
34
1.9
35
90
3
109
31
8
13
46
1.74
90327464--90327540
14
5.0
15
71
20
52
32
9
15
42
1.78
90327848--90327909
26
2.3
26
83
2
79
43
11
9
35
1.73
90327862--90327917
26
2.2
26
93
0
94
41
10
12
35
1.78
90329997--90330095
27
3.6
27
70
20
96
51
21
14
13
1.75
90330506--90330536
14
2.2
14
94
0
53
32
19
9
38
1.84
90335600--90335639
14
2.9
14
88
0
62
72
0
2
25
0.97
90337395--90337866
43
10.7
43
65
17
209
25
25
21
27
1.99
90337262--90337875
133
4.6
133
95
0
1050
26
24
21
27
1.99
90354006--90354053
21
2.2
21
85
7
60
12
27
29
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90354017--90354080
21
3.0
21
86
0
83
14
23
26
35
1.93
90359479--90359523
21
2.1
21
91
0
72
15
24
22
37
1.93
90361553--90361579
14
1.9
14
100
0
54
29
3
0
66
1.09
90363144--90363172
8
3.6
8
100
0
58
37
0
0
62
0.96
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5
10.4
5
95
4
95
41
0
0
58
0.98
90363253--90363291
20
2.0
20
89
0
60
64
7
20
7
1.45
90364635--90364722
31
2.9
31
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3
90
32
11
12
43
1.78
90364750--90364802
27
1.9
28
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72
39
1
5
52
1.36
90365994--90366044
14
3.2
15
78
18
50
47
1
0
50
1.12
90365991--90366044
18
3.2
18
84
7
69
48
1
0
50
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295