Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  34  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10181179--10181251
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2.0
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2.4
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26
28
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1.9
358
86
6
972
26
18
20
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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75
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2.7
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10195878--10195931
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3.5
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19
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3
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10196165--10196212
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10196165--10196216
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4
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58
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2.0
32
100
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17
79
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29
17
19
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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34
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1.96
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20
12
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1.9
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19
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1.88
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1.10
10325167--10325240
29
2.5
29
81
12
89
50
13
12
24
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10325216--10325282
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2.4
28
94
2
116
46
16
17
19
1.85
10325216--10325295
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2.8
28
88
5
108
45
16
16
22
1.85
10326534--10326591
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2.1
21
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58
43
4
0
52
1.21
10358408--10358469
29
2.1
30
93
3
108
64
3
4
27
1.29
10362542--10362667
59
2.1
59
82
2
146
38
9
12
39
1.76
10362591--10362702
60
1.9
59
81
5
136
38
9
11
40
1.75
10375055--10375375
46
7.0
46
90
0
417
20
24
15
39
1.92
10377518--10377566
20
2.5
20
86
6
64
57
6
0
36
1.24
10377518--10377577
21
2.8
21
80
10
68
56
8
0
35
1.29
10388936--10388962
5
5.4
5
100
0
54
18
0
0
81
0.69
10390635--10390669
18
1.9
18
88
11
54
65
2
0
31
1.07
10390635--10390675
18
2.4
17
84
15
50
65
2
0
31
1.05
10391378--10391428
24
2.1
24
81
0
57
52
1
3
41
1.31
10391509--10391578
31
2.3
31
89
0
113
55
1
2
40
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10392293--10392344
25
2.1
25
82
7
61
36
1
3
57
1.28
10392603--10392635
14
2.4
14
90
10
50
51
6
3
39
1.42
10393564--10393614
15
3.3
16
75
5
52
58
0
0
41
0.98
10393819--10393908
20
4.3
20
75
12
67
41
1
1
56
1.14
10393793--10393882
45
2.0
44
80
8
101
40
1
2
56
1.19
10397001--10397047
24
2.0
24
83
8
60
53
2
0
44
1.12
10404098--10404131
12
2.8
12
90
0
50
85
2
0
11
0.71
10404098--10404130
17
1.9
17
93
0
57
87
3
0
9
0.63
10407038--10407157
58
2.1
58
98
0
231
60
4
22
12
1.49
10410291--10410323
17
2.0
17
94
5
59
36
15
0
48
1.45
10415918--10416121
46
4.3
48
88
7
267
36
14
21
27
1.92
10415852--10416121
98
2.7
98
93
0
459
35
14
22
28
1.93
10416084--10416266
37
5.0
37
91
1
298
37
16
21
24
1.94
10416084--10416267
74
2.5
74
95
1
336
37
16
21
24
1.93
10417520--10417687
58
3.0
58
87
10
237
22
13
30
33
1.92
10417539--10417629
28
3.2
28
66
22
80
25
15
31
27
1.95
10417580--10417722
49
2.9
49
93
0
232
23
13
30
32
1.94
10420911--10421114
46
4.3
48
87
7
258
35
14
22
27
1.93
10420845--10421114
98
2.7
98
92
0
450
34
14
22
28
1.93
10421077--10421259
37
5.0
37
91
1
298
37
16
21
24
1.94
10421077--10421260
74
2.5
74
95
1
336
37
16
21
24
1.93
10422567--10422616
6
8.8
6
80
12
52
22
32
10
36
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10422568--10422616
9
5.4
9
82
0
62
22
32
8
36
1.84
10422829--10422930
15
6.6
15
69
7
53
30
25
19
24
1.98
10423108--10423155
24
2.0
24
100
0
96
41
8
4
45
1.53
10423451--10423475
13
1.9
13
100
0
50
16
24
40
20
1.91
10433599--10433640
21
2.0
20
82
13
50
50
16
2
30
1.58
10433446--10433683
120
2.0
120
91
3
390
47
16
3
33
1.63
10436032--10436238
15
13.8
15
81
4
211
29
24
20
25
1.99
10436032--10436238
30
6.9
30
82
2
236
29
24
20
25
1.99
10443387--10443501
43
2.7
43
77
4
117
32
27
16
23
1.96
10444924--10445172
124
2.0
124
96
0
462
32
20
18
28
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295