Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  83  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24217836--24217981
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286
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2
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10
38
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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2.1
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5
0
59
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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2
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22
1.80
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21
26
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0
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26
4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24494169--24494194
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2.0
13
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53
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0
11
2
0.68
24549754--24549798
22
2.0
22
87
8
65
44
0
0
55
0.99
24552956--24552994
18
2.1
19
85
4
53
69
0
10
20
1.17
24554511--24554682
93
1.8
93
93
2
301
29
29
20
20
1.98
24554504--24554677
46
3.8
46
78
14
205
29
29
20
20
1.98
24554507--24554698
46
4.2
46
72
20
143
29
28
19
21
1.98
24563211--24563266
28
2.0
28
83
13
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64
5
1
28
1.26
24564610--24564794
92
2.0
92
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0
361
29
7
16
46
1.75
24566260--24566296
3
12.3
3
94
0
65
64
0
2
32
1.07
24570834--24570929
26
3.5
26
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15
66
41
2
3
53
1.28
24572010--24572064
20
2.7
21
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13
71
54
1
0
43
1.10
24573127--24573152
7
3.7
7
100
0
52
46
0
0
53
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24585360--24585457
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3.4
27
73
20
83
27
26
17
28
1.98
24585353--24585504
60
2.5
60
80
7
157
28
24
18
28
1.98
24586807--24586848
22
1.9
22
90
0
66
71
2
19
7
1.20
24590699--24590822
46
2.8
46
91
3
200
27
22
16
33
1.96
24590699--24590933
37
5.8
45
87
8
207
26
21
15
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1.93
24590784--24590960
37
4.8
37
95
0
300
26
20
13
38
1.90
24598391--24598514
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2.8
46
91
3
200
27
22
16
33
1.96
24598391--24598625
37
5.8
45
87
8
207
26
21
15
36
1.93
24598476--24598652
37
4.8
37
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0
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26
20
13
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1.90
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2.1
29
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0
104
26
11
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1.64
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2.2
27
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55
0
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34
1.33
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1.9
20
89
5
60
33
0
20
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1.51
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17
2.1
17
100
0
72
25
16
27
30
1.97
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14
2.2
14
100
0
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25
25
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1.96
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19
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10
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35
1.84
24616696--24616752
17
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15
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10
15
35
1.82
24616677--24616774
36
2.6
37
88
9
144
36
10
17
35
1.84
24623753--24623795
19
2.3
19
91
0
68
23
2
0
74
0.93
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21
1.9
21
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10
55
22
10
10
57
1.61
24643723--24643757
18
2.0
17
88
5
52
60
8
2
28
1.41
24644880--24644938
23
2.5
22
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44
0
1
54
1.10
24645145--24645192
16
2.9
16
76
14
53
52
0
0
47
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24645928--24645952
13
1.9
13
100
0
50
40
12
16
32
1.84
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20
1.9
20
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5
67
40
2
0
56
1.13
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29
2.6
28
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54
0
2
42
1.14
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2.1
13
100
0
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33
22
7
37
1.82
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2.8
31
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10
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28
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29
1.96
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47
4.7
46
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6
202
28
16
26
28
1.97
24650167--24650420
42
5.6
48
83
8
209
29
15
26
29
1.96
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14
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0
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0
0
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2.4
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66
5
0
28
1.13
24654319--24654357
18
2.2
18
86
4
53
23
23
0
53
1.46

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295