Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  82  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23949921--23949987
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0
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0
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0
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2.0
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99
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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0
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0
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24
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0
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17
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1.8
93
93
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29
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100
0
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0
0
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0.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
52
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31
1.46
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26
78
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1
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1.33
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1.9
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2.0
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63
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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40
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9
2.8
9
100
0
50
88
0
12
0
0.53
24110275--24110321
17
2.8
17
79
20
62
55
4
2
38
1.31
24110919--24110953
18
1.9
18
88
0
52
40
20
8
31
1.82
24121120--24121266
40
3.6
40
77
4
116
23
28
19
27
1.99
24123203--24123232
15
2.1
15
93
6
53
36
26
6
30
1.82
24124893--24124985
48
1.9
48
86
2
132
22
34
17
25
1.96
24124888--24125155
49
5.5
48
77
4
189
21
29
15
32
1.95
24126870--24126919
24
2.1
24
96
3
93
36
18
16
30
1.92
24133071--24133100
14
2.1
15
93
6
53
30
0
3
66
1.07
24137102--24137144
20
2.2
19
84
12
52
32
6
0
60
1.23
24137374--24137400
6
4.5
6
100
0
54
0
29
0
70
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24144825--24144867
18
2.5
17
81
7
50
39
0
6
53
1.28
24144830--24144885
19
2.8
20
81
10
62
41
0
7
51
1.29
24144839--24144885
21
2.4
18
86
10
58
44
0
4
51
1.21
24165065--24165143
24
3.3
24
66
13
72
44
25
0
30
1.54
24165059--24165154
48
2.0
48
100
0
192
41
25
0
33
1.55
24165161--24165207
5
9.4
5
77
9
51
40
19
0
40
1.51
24165861--24165890
16
1.9
15
93
6
51
0
26
0
73
0.84
24165861--24165898
20
1.9
20
84
10
51
2
26
0
71
1.00
24170599--24170655
29
2.0
27
83
6
69
26
14
0
59
1.35
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31
2.4
31
95
4
130
24
13
17
43
1.86
24185018--24185060
8
5.2
8
80
5
50
30
0
0
69
0.88
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5
5.4
5
100
0
54
40
0
0
59
0.98
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15
3.9
15
83
2
80
33
0
14
52
1.41
24186823--24186869
21
2.1
22
92
7
78
12
25
27
34
1.92
24186834--24186883
21
2.4
21
86
0
64
16
30
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28
1.96
24191604--24191637
17
1.9
18
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52
0
0
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1.00
24194351--24194383
16
2.1
16
94
0
57
42
3
0
54
1.15
24196054--24196087
17
2.0
17
100
0
68
23
5
17
52
1.66
24201863--24201892
14
2.2
14
94
5
53
0
13
6
80
0.91
24203687--24203737
18
2.8
19
77
19
63
21
33
1
43
1.64
24205720--24205788
35
1.9
36
88
2
104
15
28
0
55
1.41
24206761--24206805
24
2.0
24
86
8
67
75
11
8
4
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24207483--24207536
5
10.8
5
93
0
81
61
33
0
5
1.19
24207582--24207609
13
2.2
13
100
0
56
46
17
14
21
1.84
24207930--24207994
32
2.0
32
100
0
130
21
6
24
47
1.73
24209462--24209501
15
2.7
15
92
0
62
30
15
12
42
1.83
24210482--24210558
40
1.9
40
91
0
127
37
15
20
25
1.92
24210896--24211099
14
14.3
14
69
11
65
22
1
28
47
1.60
24211036--24211099
21
3.0
21
79
4
74
18
0
26
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1.44
24211060--24211091
7
4.6
7
92
0
55
25
0
12
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1.30
24213297--24213382
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2.0
43
100
0
172
30
30
11
27
1.92
24217837--24217958
42
2.9
43
85
3
167
20
10
32
36
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295