Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  58  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17021876--17022026
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57
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3
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1
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17021897--17022167
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460
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11
1
43
1.50
17022003--17022127
57
2.1
60
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5
211
44
12
1
42
1.51
17022052--17022183
44
3.1
44
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218
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2
46
1.49
17022057--17022200
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3.5
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216
40
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2
46
1.51
17022172--17022242
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5.5
13
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26
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0
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17036051--17036167
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3.0
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2.0
32
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1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.33
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20
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1.67
17045433--17045570
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39
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17046760--17046802
21
1.9
23
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39
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1.64
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1.45
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2.2
21
88
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45
22
25
6
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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0
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20
17
1.87
17094818--17094935
42
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42
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44
17
20
17
1.87
17102124--17102162
18
2.0
20
85
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2.0
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14
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42
12
4
42
1.60
17105189--17105347
28
5.7
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14
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1.61
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46
3
6
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1.45
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0
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25
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1.97
17122969--17123081
25
4.5
25
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6
77
21
25
20
32
1.97
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2.0
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0
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39
2
0
58
1.10
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26
2.7
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12
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0
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1.01
17152329--17152385
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0
1
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1.05
17152339--17152391
22
2.4
22
78
15
63
33
0
1
64
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17152342--17152421
26
3.0
26
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12
65
33
3
2
60
1.28
17152394--17152458
33
2.0
33
81
6
78
38
3
1
56
1.24
17153877--17154172
136
2.2
136
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0
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18
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0
0
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0
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4.2
14
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59
46
0
0
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1.00
17155346--17155403
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0
0
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52
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2
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23
100
0
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21
26
1.99
17170963--17171010
25
1.9
25
83
8
62
45
4
2
47
1.33
17170996--17171047
11
4.9
11
75
17
56
55
0
1
42
1.10
17173313--17173456
51
2.9
49
85
2
198
25
20
25
28
1.99
17175319--17175382
20
3.2
20
64
24
53
37
6
25
31
1.81
17175323--17175402
40
2.0
40
97
0
151
35
6
25
33
1.81
17175328--17175392
20
3.2
20
67
16
53
33
4
24
36
1.76
17179151--17179665
135
3.8
135
87
1
708
27
21
20
29
1.98
17179091--17179665
270
2.1
270
85
0
747
27
22
20
29
1.98
17202370--17202414
21
2.1
21
87
0
63
15
22
22
40
1.91
17208792--17208839
22
2.2
22
100
0
96
45
8
4
41
1.53
17208792--17208849
22
2.6
22
91
5
82
43
8
5
43
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17212033--17212066
17
2.1
16
94
5
59
17
23
14
44
1.86
17212715--17212830
57
2.0
57
100
0
232
36
6
5
51
1.51
17212744--17212830
27
3.1
28
66
21
81
37
8
3
50
1.49
17213744--17213791
24
2.0
24
84
8
62
31
0
4
64
1.12
17213747--17213813
25
2.9
23
77
14
66
32
1
5
59
1.31
17215080--17215111
6
5.5
6
92
7
57
34
31
0
34
1.58
17219267--17219393
50
2.6
49
87
1
164
31
28
16
23
1.96
17219267--17219447
101
1.8
99
82
2
236
29
27
18
24
1.98
17221428--17221471
20
2.4
18
81
11
54
70
0
22
6
1.11
17229835--17229886
23
2.3
22
75
21
54
9
23
1
65
1.32
17229880--17229918
18
2.2
18
85
0
51
12
23
2
61
1.43
17233983--17234047
2
32.5
2
100
0
130
49
0
50
0
1.00
17252043--17252079
5
7.4
5
100
0
74
37
0
21
40
1.54
17253754--17253801
18
2.6
18
86
3
69
64
0
2
33
1.05
17253754--17253808
9
5.9
9
76
6
56
61
1
1
34
1.17
17253761--17253827
28
2.5
27
80
9
66
65
1
4
28
1.21
17257154--17257193
15
2.7
15
100
0
80
25
15
17
42
1.88
17261201--17261282
26
3.2
26
91
0
128
36
24
6
32
1.80
17266423--17266465
22
2.0
22
100
0
86
32
16
18
32
1.93
17266428--17266475
22
2.2
22
88
0
69
35
16
16
31
1.92
17269375--17269456
26
3.2
26
96
0
155
36
26
6
30
1.81
17269922--17270001
32
2.5
31
80
6
90
27
3
18
50
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17278162--17278200
15
2.4
17
87
8
55
71
0
2
25
0.98
17281995--17282191
41
4.8
41
93
3
292
26
19
24
29
1.99
17281995--17282220
82
2.8
80
85
8
294
26
20
24
28
1.99
17282005--17282233
123
1.9
123
83
9
306
27
19
24
28
1.98
17285582--17285606
8
3.1
8
100
0
50
12
52
12
24
1.72
17286091--17286128
11
3.2
12
92
7
60
0
52
0
47
1.00
17287377--17287440
33
2.0
32
87
3
92
39
21
10
28
1.87
17287655--17287851
41
4.8
41
92
5
317
27
22
20
28
1.99
17289385--17289409
13
1.9
13
100
0
50
68
24
0
8
1.16
17294465--17294527
33
1.9
32
87
3
90
39
23
11
25
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295