Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  24  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7188544--7188604
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0
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2.0
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19
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11
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21
2.0
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0
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50
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17
17
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.27
7286214--7286263
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2.0
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2.0
30
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0
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1.63
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21
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23
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2.0
25
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9
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28
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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58
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54
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1.69
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17
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1.90
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696
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14
17
30
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7358501--7358547
14
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14
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0
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18
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24
1.81
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2.8
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0
15
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1.41
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2.5
16
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12
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10
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0
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2.0
65
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0
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26
2.0
26
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0
104
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11
0
34
1.37
7422051--7422077
9
3.0
9
100
0
54
77
0
0
22
0.76
7422179--7422257
41
1.9
41
89
2
122
56
2
11
29
1.47
7422993--7423041
10
5.0
9
83
11
53
71
2
4
22
1.13
7422991--7423041
20
2.5
20
81
6
68
70
1
3
23
1.14
7423647--7423824
96
1.8
97
88
5
272
29
26
15
27
1.96
7425021--7425149
7
15.9
8
78
18
101
70
0
1
27
0.96
7425036--7425138
5
20.2
5
74
18
61
70
0
0
29
0.87
7425028--7425147
3
42.0
3
72
24
100
70
0
0
29
0.94
7425028--7425147
27
4.5
27
80
14
117
70
0
0
29
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7430847--7430885
10
4.0
9
84
15
51
71
2
5
20
1.17
7430899--7430936
13
2.8
13
88
4
58
44
13
0
42
1.43
7434187--7434403
46
4.7
46
88
1
283
40
14
23
21
1.90
7434138--7434403
138
2.0
130
85
7
354
39
15
23
22
1.91
7437397--7437560
81
2.0
81
85
4
224
28
21
10
39
1.87
7442274--7442320
21
2.2
22
92
3
78
21
19
38
21
1.94
7444859--7444898
21
1.9
21
90
10
64
67
0
30
2
1.04
7446474--7446518
14
3.4
14
75
25
53
42
0
0
57
0.98
7446464--7446514
17
2.8
17
74
23
50
37
0
0
62
0.95
7446476--7446521
22
2.1
21
84
4
56
43
0
0
56
0.99
7446570--7446611
19
2.2
19
87
8
59
38
2
2
57
1.25
7449243--7449541
153
2.0
153
91
0
490
34
14
27
24
1.93
7456478--7456512
3
11.7
3
100
0
70
31
0
0
68
0.90
7464191--7464223
4
8.2
4
100
0
66
75
24
0
0
0.80
7465189--7465218
11
2.6
11
94
5
51
86
0
13
0
0.57
7467969--7467993
11
2.3
11
100
0
50
92
0
8
0
0.40
7473571--7473633
16
3.8
16
85
6
72
30
3
3
63
1.25
7473571--7473613
3
15.0
3
80
9
54
32
4
0
62
1.15
7473561--7473642
33
2.4
34
76
13
89
29
3
2
64
1.23
7473743--7473803
3
20.3
3
86
0
59
31
1
8
59
1.37
7473762--7473833
27
2.6
28
80
8
69
37
1
8
52
1.40
7474404--7474442
18
2.1
18
85
9
51
30
2
5
61
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7478586--7478626
19
2.2
18
86
4
55
41
2
9
46
1.50
7482759--7482830
30
2.3
30
88
9
101
61
6
4
27
1.41
7497837--7497877
20
2.0
22
90
9
68
48
0
0
51
1.00
7497828--7497885
30
2.0
28
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12
82
48
0
0
51
1.00
7498000--7498033
11
3.0
11
86
4
50
32
0
2
64
1.08
7498090--7498131
19
2.2
19
87
8
59
73
0
26
0
0.83
7500704--7500765
10
6.1
10
83
12
74
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3
6
22
1.28
7500704--7500765
20
3.1
19
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11
88
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3
6
22
1.28
7501739--7501806
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2.1
32
100
0
118
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14
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32
1.76
7514814--7514985
40
4.3
39
82
7
186
26
21
26
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295