Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  280  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89079033--89079080
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3
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1.36
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23
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262
2.6
261
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25
23
22
29
1.99
89103486--89104158
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174
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3
930
25
23
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3
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7
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1
3
30
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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0
0
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11
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1.76
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3.2
16
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48
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1.77
89118337--89118420
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89118489--89118764
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15.4
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153
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10
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25
2.0
23
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37
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47
1.59
89118710--89118764
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19
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1.81
89118759--89118809
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2.2
26
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1.79
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2.3
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11
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1.31
89119456--89119509
22
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21
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12
12
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1.30
89119465--89119512
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19
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2
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12
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1.08
89120061--89120177
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3.9
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77
11
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22
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89120076--89120177
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134
44
3
22
29
1.71
89120173--89120209
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16
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4
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27
0
2
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16
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3.7
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3
448
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16
30
1.93
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2.0
125
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1
1087
33
18
16
30
1.93
89120933--89121629
289
2.4
288
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2
1091
33
18
16
30
1.93
89121507--89121784
123
2.2
124
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4
355
34
21
14
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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0
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0
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0
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32
44
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1.54
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3
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5
102
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0
29
0
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18
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0
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0
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79
10
82
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17
0
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1.9
21
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0
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20
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11
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29
13
11
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1.79
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15
10
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11
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2.7
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14
19
7
59
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89165449--89165487
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19
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0
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1.08
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1.20
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0
0
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24
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1
0
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5
59
64
0
0
35
0.94
89174086--89174380
121
2.5
114
74
13
303
56
3
2
37
1.27
89174355--89174425
21
3.5
20
77
11
81
53
1
1
43
1.18
89174342--89174421
21
3.9
21
70
9
65
50
1
1
47
1.17
89177456--89177526
28
2.5
29
78
15
76
30
16
8
43
1.78
89182874--89182981
54
2.0
54
100
0
216
51
9
9
29
1.65
89190461--89190529
30
2.3
31
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2
86
52
11
0
36
1.38
89191061--89191117
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29
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54
7
5
33
1.50
89191170--89191213
22
2.1
21
88
12
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59
4
0
36
1.18
89192745--89192774
7
4.1
7
95
4
51
30
0
0
70
0.88
89192865--89192926
29
2.1
30
81
3
72
33
0
3
62
1.11
89194984--89195058
33
2.4
31
79
14
84
36
0
4
60
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89194984--89195071
34
2.7
32
83
13
101
35
0
4
60
1.17
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2
13.5
2
100
0
54
48
0
51
0
1.00
89206614--89206999
192
2.0
192
100
0
772
28
7
17
46
1.74
89209588--89209635
12
3.8
12
79
15
60
22
0
14
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1.32
89209584--89209640
27
2.1
27
100
0
114
28
0
14
57
1.37
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52
4.2
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16
149
28
20
16
34
1.95
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43
2.0
43
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0
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50
2
22
25
1.61
89221493--89221533
14
2.8
15
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48
0
0
51
1.00
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2.3
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0
1
46
1.10
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3.4
15
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50
52
0
4
43
1.20
89221583--89221641
27
2.3
26
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8
102
54
0
3
42
1.17
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27
1.9
27
100
0
104
51
0
3
44
1.19
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13
3.4
13
75
6
54
48
0
4
46
1.22
89221598--89221639
14
3.1
14
72
6
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57
0
2
40
1.12
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3.6
18
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0
110
34
18
17
29
1.94
89222859--89222950
18
5.1
18
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5
105
32
15
16
35
1.90
89222929--89223011
18
4.6
18
71
5
69
34
4
20
39
1.74
89231890--89231983
49
1.9
49
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4
127
44
7
22
25
1.78
89232862--89232925
32
2.0
32
100
0
128
50
15
6
28
1.68
89240582--89240730
10
14.7
10
71
13
81
34
0
4
59
1.23
89240571--89240668
32
3.1
31
75
13
94
34
1
5
59
1.26
89240571--89240678
22
5.3
20
76
18
84
35
0
4
59
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89240652--89240685
16
2.1
17
88
5
52
32
0
5
61
1.20
89240615--89240689
29
2.6
28
75
6
78
33
0
5
61
1.19
89240571--89240737
20
8.6
20
69
20
81
36
0
4
58
1.24
89240696--89240737
21
2.0
20
86
4
57
40
0
2
57
1.12
89245771--89245835
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2.3
29
76
12
71
58
0
1
40
1.07
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22
2.1
22
84
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58
62
0
2
35
1.08
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2.9
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2
0
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1.04
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19
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50
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1.70
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100
2.0
100
93
0
342
23
22
19
35
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295