Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  19  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5857403--5857567
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2.3
18
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2.8
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2
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25
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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50
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28
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2.6
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0
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0
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1
0
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1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
1
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5990705--5990760
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41
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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0
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1.21
6004060--6004122
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0
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1.98
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23
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132
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0
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16
24
27
1.96
6011523--6011902
87
4.4
87
88
1
523
36
20
23
20
1.95
6011531--6012027
130
3.8
131
78
7
485
35
20
23
20
1.96
6011658--6012078
217
1.9
218
91
0
682
35
19
23
20
1.96
6011875--6012083
88
2.4
88
91
2
323
34
20
24
20
1.96
6011614--6011983
174
2.1
174
83
2
447
35
20
23
20
1.96
6013731--6013769
20
2.0
20
85
10
53
28
12
2
56
1.50
6013593--6013774
3
59.7
3
71
11
102
26
8
3
61
1.41
6013913--6014017
21
4.8
21
73
9
84
26
6
0
65
1.23
6013945--6013985
6
6.8
6
100
0
82
17
0
0
82
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6014089--6014119
15
2.1
15
100
0
62
32
6
0
61
1.21
6014059--6014121
9
7.2
9
70
25
55
30
7
1
60
1.35
6014208--6014264
3
19.3
3
76
3
53
31
5
0
63
1.17
6014208--6014248
15
2.7
15
88
0
64
34
4
0
60
1.18
6039873--6039927
17
3.4
17
72
7
60
61
3
0
34
1.13
6044134--6044169
16
2.2
16
100
0
72
36
22
13
27
1.92
6045615--6045656
21
2.0
21
86
9
59
4
42
0
52
1.22
6045632--6045666
18
1.9
18
88
0
52
0
42
0
57
0.99
6045626--6045681
24
2.3
23
80
14
69
0
42
1
55
1.10
6053259--6053308
21
2.3
22
79
3
57
30
6
2
62
1.31
6053516--6053565
21
2.3
23
80
16
63
54
2
10
34
1.45
6062638--6062666
5
5.8
5
100
0
58
0
20
37
41
1.53
6064957--6064986
15
2.1
14
93
6
51
20
0
0
80
0.72
6078427--6078468
11
4.4
10
82
17
54
66
0
7
26
1.17
6078425--6078473
18
2.8
18
82
14
57
65
2
8
24
1.31
6081700--6081724
12
2.1
12
100
0
50
52
0
16
32
1.44
6083479--6083527
20
2.5
19
83
6
62
63
2
2
32
1.17
6085119--6085159
6
6.8
6
100
0
82
14
68
0
17
1.22
6086005--6086038
13
2.9
11
87
12
50
61
2
0
35
1.11
6086412--6086452
21
2.0
21
85
9
57
46
2
0
51
1.14
6086425--6086461
18
2.1
18
100
0
74
45
5
0
48
1.25
6087988--6088023
18
2.0
18
88
0
54
58
5
2
33
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6088680--6088723
22
2.0
22
86
8
63
47
4
6
40
1.50
6091256--6091293
18
2.1
19
90
5
60
63
0
0
36
0.95
6092081--6092125
23
2.0
23
83
8
58
57
2
4
35
1.31
6096588--6096667
14
5.4
14
74
11
70
42
0
0
57
0.98
6096580--6096642
31
2.0
32
96
3
119
31
0
1
66
1.01
6097665--6097706
18
2.4
17
81
18
50
73
7
7
11
1.23
6097708--6097758
14
3.8
14
73
19
54
25
0
17
56
1.41
6097716--6097773
24
2.3
24
85
11
73
24
0
13
62
1.32
6097710--6097773
26
2.5
26
85
9
80
23
0
15
60
1.34
6098475--6098715
133
1.8
133
88
0
374
36
19
18
25
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295