Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  62  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17955703--17955749
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2.1
22
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0
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2.9
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113
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594
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21
19
32
1.97
17957426--17957978
227
2.4
227
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21
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3
2
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17
51
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17969864--17970036
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2.6
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2.5
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17979624--17979678
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2.7
20
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56
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17979615--17979702
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26
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1.9
29
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23
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16
16
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19
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0
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18
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60
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2
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4.2
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59
1.37
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1.9
46
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2
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61
1.31
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2.6
24
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25
2.5
25
80
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76
33
7
6
52
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
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17992502--17992572
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1
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2
62
1.23
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1
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1.23
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1
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0
52
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0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18025152--18025177
12
2.2
12
100
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15
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1.95
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0
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140
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29
21
20
1.98
18088257--18088303
22
2.1
22
88
0
67
17
31
27
23
1.96
18089230--18089277
22
2.1
23
84
7
62
37
16
8
37
1.79
18089420--18089461
6
7.0
6
88
0
66
52
14
14
19
1.75
18089421--18089475
18
3.0
18
81
2
65
52
16
12
18
1.74
18089420--18089470
24
2.1
24
92
0
84
50
13
15
19
1.77
18089420--18089475
12
4.6
12
84
2
67
51
16
14
17
1.76
18089689--18089734
23
1.9
25
82
8
60
30
8
4
56
1.49
18090503--18090554
18
2.9
17
83
13
52
5
13
5
75
1.18
18096767--18096827
29
2.0
31
84
12
83
24
1
3
70
1.11
18098395--18098434
6
6.7
6
88
0
53
15
5
2
77
1.04
18098395--18098446
18
2.9
18
80
2
61
15
7
1
75
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18100439--18100547
54
2.0
54
100
0
218
42
18
9
30
1.81
18102255--18102438
67
2.8
64
77
8
194
28
15
30
24
1.96
18106688--18106870
63
2.8
63
77
9
199
28
16
31
23
1.96
18108549--18108749
103
1.9
104
91
1
332
19
17
24
37
1.93
18112520--18112685
82
2.0
82
100
0
332
44
18
8
28
1.78
18113256--18113566
47
6.7
45
74
13
222
22
27
20
29
1.98
18113205--18113521
94
3.4
93
79
11
353
21
28
20
29
1.98
18113205--18113563
94
3.8
93
77
10
349
22
27
19
29
1.98
18120011--18120098
40
2.2
40
81
4
97
32
27
17
22
1.96
18124902--18124946
22
2.0
22
100
0
90
33
17
4
44
1.69
18134280--18134355
23
3.3
23
85
7
109
34
15
21
28
1.94
18134384--18134448
26
2.6
25
69
13
60
60
0
3
36
1.13
18134399--18134450
27
2.0
26
84
3
68
63
0
1
34
1.06
18145898--18145938
20
2.0
20
100
0
82
19
0
29
51
1.47
18160323--18160464
40
3.6
40
77
8
130
34
24
14
26
1.93
18160354--18160465
37
2.8
40
76
9
122
36
24
14
25
1.93
18161314--18161370
25
2.2
26
81
3
62
3
28
1
66
1.18
18164600--18164626
3
9.0
3
100
0
54
66
0
33
0
0.92
18168415--18168449
17
2.1
17
100
0
70
22
31
11
34
1.90
18169571--18169614
16
2.6
17
85
7
63
72
6
2
18
1.17
18171500--18171545
20
2.3
19
82
10
56
30
8
2
58
1.40
18171507--18171545
21
1.9
20
89
5
60
28
10
2
58
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18173680--18173729
24
2.1
24
96
0
91
50
6
12
32
1.64
18175316--18175364
18
2.7
18
93
0
89
18
44
24
12
1.84
18181325--18181353
4
7.2
4
100
0
58
0
24
0
75
0.80
18187709--18187818
47
2.4
46
79
13
136
36
21
15
26
1.93
18188581--18188688
4
25.8
4
71
15
76
6
25
3
64
1.34
18188619--18188677
27
2.2
27
96
3
111
10
25
3
61
1.44
18193153--18193195
21
2.0
22
81
4
52
30
4
2
62
1.28
18196628--18196817
96
2.0
96
88
4
285
37
18
32
12
1.88
18201042--18201113
38
1.9
37
88
8
110
12
16
8
62
1.53
18201042--18201133
37
2.4
38
85
5
116
14
16
7
61
1.54

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295