Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  64  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18487078--18487860
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17
23
27
1.97
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2.1
179
89
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5
610
31
18
22
27
1.97
18487753--18487869
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2.6
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110
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21
18
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19
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9
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0
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0
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0
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18514981--18515011
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0
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12
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1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18514917--18515040
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18514932--18515038
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5.5
19
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1.67
18515025--18515103
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0
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18520071--18520130
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18520071--18520128
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2.2
120
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0
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120
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37
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24
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18547046--18547114
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2.1
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120
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0
0
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9.3
23
78
8
151
31
16
23
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18550097--18550302
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1.96
18550081--18550302
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3.1
69
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5
250
31
16
23
28
1.96
18550305--18550428
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2.8
43
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22
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2.1
87
80
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196
23
15
21
39
1.91
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0
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2
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4.5
13
86
0
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34
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22
36
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18621531--18621597
27
2.5
27
85
0
80
35
23
22
17
1.95
18627732--18627766
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3.2
11
88
11
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65
0
0
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1.32
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22
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1
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30
1.22
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0
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1
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1.50
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0
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40
1.19
18665128--18665155
6
4.7
6
100
0
56
85
0
0
14
0.59
18680273--18680346
36
2.0
37
84
2
96
48
12
17
21
1.79
18686492--18686559
32
2.1
32
81
10
77
39
13
10
36
1.78
18688453--18688539
21
4.0
23
75
10
83
37
21
21
18
1.94
18691725--18691774
22
2.2
22
89
10
75
38
22
24
16
1.93
18696466--18696624
79
2.0
79
92
0
264
36
23
11
28
1.90
18702901--18703091
95
2.0
95
97
0
364
37
19
6
36
1.77
18703171--18703203
17
1.9
17
100
0
66
24
15
18
42
1.88
18703420--18703459
20
2.0
20
90
0
62
22
27
5
45
1.73
18707151--18707190
20
2.0
20
100
0
80
45
20
5
30
1.72
18713708--18713743
7
5.0
7
86
6
54
69
0
0
30
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18713713--18713865
19
7.7
19
65
25
52
64
3
3
28
1.27
18713714--18713802
17
5.5
17
76
20
84
65
1
3
30
1.16
18713716--18713819
33
3.2
31
75
23
106
64
1
3
29
1.22
18713777--18713819
21
2.0
21
90
0
68
60
2
2
34
1.22
18719788--18719830
14
3.1
14
90
3
70
34
2
11
51
1.51
18720546--18720698
43
3.6
43
82
0
189
21
17
28
32
1.96
18723219--18723258
15
2.6
16
80
11
57
75
0
10
15
1.05
18724849--18724881
13
2.6
13
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4
50
39
0
12
48
1.40
18731009--18731045
15
2.5
15
91
4
58
78
0
13
8
0.96
18731851--18731911
30
2.0
30
84
6
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24
34
27
13
1.93
18735061--18735085
5
5.0
5
100
0
50
40
0
0
60
0.97
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16
2.9
16
87
9
60
36
10
13
39
1.79
18743121--18743174
16
3.3
15
77
12
54
40
20
5
33
1.76
18744643--18744821
33
5.5
33
76
7
168
32
24
10
32
1.89
18744643--18744803
65
2.5
65
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1
286
32
23
10
32
1.89
18745983--18746007
13
1.9
13
100
0
50
48
8
0
44
1.32
18770083--18770134
25
2.1
25
100
0
104
36
17
7
38
1.78
18770501--18770605
25
4.2
25
75
6
88
36
20
21
21
1.95
18778396--18778509
33
3.5
33
80
7
124
33
22
10
33
1.88
18779689--18779713
13
1.9
13
100
0
50
48
8
0
44
1.32
18781535--18781598
29
2.1
31
83
11
80
35
0
3
60
1.12
18781576--18781600
8
3.1
8
100
0
50
24
0
0
76
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18786928--18786966
19
2.0
20
85
5
53
30
30
5
33
1.79
18797279--18797317
19
2.1
19
95
0
69
28
15
12
43
1.83
18797282--18797323
19
2.2
19
86
0
57
38
11
9
40
1.75
18811207--18811238
17
1.9
17
93
6
57
18
3
3
75
1.08
18817913--18818012
30
2.8
40
68
28
112
39
13
14
34
1.84
18818018--18818052
18
1.9
18
94
0
61
31
14
20
34
1.92
18818773--18818866
44
2.1
44
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7
136
35
25
5
34
1.79
18818848--18818899
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3.2
16
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0
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30
25
3
40
1.73
18820224--18820281
19
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21
75
17
59
62
0
6
31
1.22
18820224--18820261
11
3.5
11
85
10
51
63
0
10
26
1.27

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295