Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  282  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.3
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126
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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13
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4.0
352
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2537
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30
1.93
89672844--89674240
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2.0
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2519
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9
91
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2.1
16
88
11
50
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6
34
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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19
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353
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0
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0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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79
2
0
17
0.86
89698603--89698645
13
3.2
13
86
3
50
76
4
0
18
0.95
89698601--89698657
23
2.5
24
83
11
66
75
3
1
19
1.04
89698638--89698725
29
3.3
27
78
13
76
76
2
6
14
1.10
89698680--89698725
24
1.9
24
86
8
67
80
2
8
8
0.99
89702330--89702378
19
2.7
18
78
12
55
48
6
4
40
1.47
89704063--89704099
19
2.0
18
94
5
65
32
0
0
67
0.91
89703948--89704090
63
2.3
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12
168
25
4
5
64
1.34
89704071--89704101
14
2.2
14
94
0
53
32
0
0
67
0.91
89711113--89711164
17
2.9
18
77
11
54
26
5
3
63
1.34
89716090--89716135
20
2.4
19
82
7
65
32
28
13
26
1.93
89717084--89717121
19
2.1
19
85
9
53
73
0
15
10
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89719477--89719511
4
8.5
4
90
3
52
51
22
0
25
1.48
89721268--89721301
12
2.7
13
86
9
52
14
0
29
55
1.40
89721815--89722059
73
3.5
73
90
8
386
32
19
17
31
1.95
89721935--89722059
63
2.0
63
96
0
232
32
20
17
30
1.95
89721996--89722239
88
2.7
87
83
6
285
34
19
17
28
1.94
89722315--89722364
14
3.3
15
83
8
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66
4
16
14
1.40
89722796--89723815
73
13.7
73
72
15
630
32
20
17
30
1.95
89722355--89723815
231
6.3
230
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9
1305
32
20
17
29
1.95
89722995--89723819
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9
772
33
20
16
29
1.95
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1.9
125
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321
32
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1.91
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43
4.0
43
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15
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1.96
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29
2.1
29
100
0
120
26
3
25
45
1.69
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9
2.8
9
100
0
50
24
8
32
36
1.84
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15
4.9
14
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19
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26
7
1
64
1.27
89741857--89741927
29
2.5
28
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22
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26
7
1
64
1.27
89741924--89741991
17
3.9
17
73
21
59
26
10
1
61
1.36
89741942--89741982
21
2.0
21
100
0
82
19
9
2
68
1.29
89741944--89741992
21
2.3
21
86
6
64
22
10
2
65
1.34
89741887--89742005
15
9.0
13
70
23
56
26
9
0
63
1.29
89742107--89742278
3
57.7
3
74
15
126
29
5
1
62
1.28
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6
4.8
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0
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17
17
0
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1.27
89749886--89749930
13
3.8
12
82
11
58
13
11
0
75
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89761532--89761564
11
3.2
11
91
8
52
69
0
0
30
0.88
89766857--89766910
26
2.2
26
83
6
67
44
3
1
50
1.30
89766893--89766942
20
2.6
19
85
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38
0
2
60
1.09
89766900--89766943
20
2.2
20
92
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72
36
0
2
61
1.09
89769223--89769260
18
2.2
18
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4
60
31
0
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0
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58
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1.44
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14
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0
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0
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24
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1.92
89786279--89786354
38
2.0
38
100
0
152
23
23
18
34
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295