Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  74  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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0
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22
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22
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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36
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34
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16
19
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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22
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1.98
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2.2
45
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22
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1.98
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0
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22
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17
1
42
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21494286--21494349
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5.9
11
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42
17
1
39
1.59
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48
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11
130
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0
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0
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21523069--21523117
10
5.6
9
77
18
50
18
2
0
79
0.83
21523074--21523161
5
16.8
5
72
23
58
18
4
1
76
1.02
21523073--21523135
26
2.3
28
86
8
94
15
3
1
79
0.94
21523069--21523141
6
11.8
6
76
11
67
16
4
1
78
0.98
21523069--21523161
44
2.1
43
82
9
109
18
4
1
76
1.01
21526011--21526043
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
21529111--21529199
30
3.0
30
81
4
101
21
22
34
21
1.97
21535487--21535554
33
2.1
33
94
0
118
47
8
20
23
1.78
21535829--21536114
48
5.9
48
80
1
277
26
26
17
29
1.98
21535831--21536114
96
2.9
96
88
1
399
26
27
17
28
1.98
21535833--21536104
144
1.9
144
82
5
343
26
26
17
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21540890--21540931
20
2.1
20
95
0
75
33
14
11
40
1.82
21543656--21543777
42
2.9
42
78
1
127
18
25
18
37
1.93
21545166--21545256
27
3.4
27
78
0
101
36
23
23
17
1.95
21547838--21547894
30
1.9
30
85
0
78
14
22
35
28
1.93
21551585--21551633
25
2.0
25
100
0
98
26
16
8
48
1.73
21552982--21553021
21
1.9
21
84
0
53
37
2
22
37
1.68
21557483--21557659
39
4.5
39
92
1
291
28
28
23
19
1.98
21559066--21559096
3
10.0
3
93
6
53
32
3
0
64
1.09
21559215--21559256
21
2.0
21
86
9
59
73
0
11
14
1.09
21560187--21560279
40
2.4
38
82
8
109
16
22
29
32
1.95
21567433--21567547
57
2.0
57
98
0
221
30
20
14
33
1.93
21585237--21585284
21
2.2
22
82
14
64
47
0
16
35
1.47
21585968--21586208
33
7.6
33
74
11
126
36
12
21
28
1.91
21586119--21586203
34
2.5
34
80
1
100
36
15
24
23
1.93
21593614--21593861
33
7.6
33
81
3
205
36
12
21
28
1.91
21593621--21593861
65
3.7
65
74
6
209
36
12
21
29
1.90
21597624--21597666
22
2.0
22
90
0
68
23
11
6
58
1.57
21597696--21597758
30
2.1
30
93
0
108
28
3
11
57
1.49
21597867--21597900
12
2.8
12
90
0
50
67
0
0
32
0.91
21598669--21598733
9
6.7
9
74
17
51
30
3
1
64
1.18
21598752--21598833
20
4.2
20
86
7
114
40
0
2
57
1.12
21598770--21598830
10
5.7
11
71
25
51
44
0
1
54
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21598781--21598832
10
5.2
10
73
17
54
40
0
1
57
1.10
21602083--21602136
23
2.4
23
84
9
67
42
3
0
53
1.18
21602087--21602146
32
1.9
32
87
12
90
43
3
0
53
1.17
21602952--21603857
453
2.0
453
99
0
1794
31
21
18
28
1.97
21605291--21605329
3
12.7
3
94
5
69
33
0
0
66
0.92
21607815--21607907
18
5.2
18
93
0
159
27
23
16
32
1.96
21614397--21614473
31
2.5
31
89
0
109
22
15
16
45
1.85
21618081--21618138
25
2.4
25
80
8
66
51
0
1
46
1.11
21627753--21627794
16
2.8
16
89
7
61
40
4
0
54
1.21
21638054--21638150
18
5.4
18
82
4
115
30
21
14
32
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295