Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  17  of  295  ( 35342 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5329639--5329672
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0
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46
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363
39
13
20
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1.90
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200
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3.2
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48
4
6
40
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.1
11
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200
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131
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3.5
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3.3
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2.1
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2.1
29
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Entropy
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2.1
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26
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5558378--5558402
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2.2
23
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0
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0
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1.20
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2.0
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2.0
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0
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0
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0
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0
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3.1
52
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4
205
28
26
19
25
1.99
5587397--5587483
36
2.5
35
77
7
95
22
5
11
59
1.53
5593868--5593922
16
3.4
16
90
5
85
36
5
29
29
1.80
5593904--5593996
44
2.1
46
88
8
138
33
5
25
35
1.79
5594130--5594177
15
3.1
15
90
3
69
50
0
0
50
1.00
5594144--5594185
15
3.0
14
90
10
52
50
0
0
50
1.00
5594112--5594199
17
5.1
17
70
16
56
43
1
1
54
1.15
5595885--5595949
33
1.9
34
84
9
89
46
3
3
47
1.33
5596155--5596222
23
3.0
23
82
4
75
48
1
2
47
1.26
5596431--5596463
12
2.8
12
100
0
66
45
0
24
30
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5601208--5601354
42
3.3
42
83
8
170
28
27
14
29
1.95
5601274--5601444
47
3.6
48
81
6
179
30
27
14
27
1.95
5601466--5601668
31
6.8
31
87
6
287
26
28
19
26
1.99
5601647--5601772
50
2.5
51
89
6
197
23
23
17
35
1.95
5607757--5607815
27
2.2
27
81
3
66
30
3
1
64
1.20
5610394--5610422
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
5614293--5614330
8
4.8
8
83
9
51
57
0
2
39
1.12
5614292--5614338
24
2.0
24
83
8
60
59
0
4
36
1.17
5614349--5614425
15
4.9
15
67
17
50
67
3
27
1
1.16
5616181--5616215
15
2.3
15
90
9
54
65
2
0
31
1.07
5616211--5616312
30
3.4
30
86
2
134
29
21
3
45
1.70
5616700--5616771
3
24.0
3
76
16
53
70
0
29
0
0.87
5616707--5616731
10
2.5
10
100
0
50
64
0
36
0
0.94
5616700--5616772
13
5.5
13
77
15
62
71
0
28
0
0.87
5617036--5617091
22
2.6
21
81
15
62
76
0
23
0
0.78
5617052--5617091
11
3.6
11
90
9
64
75
0
25
0
0.81
5617231--5617268
16
2.3
17
86
4
51
23
0
2
73
0.95
5617431--5617484
16
3.2
16
75
14
56
35
14
9
40
1.78
5617477--5617650
73
2.4
74
82
4
192
36
12
8
41
1.74
5617420--5617935
17
29.8
17
69
12
232
33
12
11
43
1.77
5617832--5617886
16
3.4
16
78
14
67
36
9
12
41
1.75
5617823--5617935
33
3.4
32
82
4
127
30
10
14
44
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5617914--5617968
21
2.6
21
80
13
76
47
9
7
36
1.63
5642840--5642978
17
8.8
16
68
21
71
43
11
13
30
1.80
5642882--5642978
34
2.9
32
75
15
97
41
13
13
31
1.83
5642904--5642960
16
3.4
17
79
11
64
47
12
15
24
1.80
5643066--5643114
16
2.9
16
90
6
71
42
12
18
26
1.85
5643481--5643556
7
11.4
7
79
10
63
0
18
2
78
0.86
5643485--5643554
6
11.8
6
84
14
67
0
17
2
80
0.84
5643486--5643532
5
8.8
5
88
6
58
0
19
0
80
0.70
5643484--5643541
27
2.1
28
87
3
82
0
17
1
81
0.78
5643480--5643554
26
2.8
26
75
17
66
0
18
2
78
0.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295