Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A07
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  93829987

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   

This is table  88  of  295  ( 35342 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25980357--25980409
21
2.5
22
78
9
65
58
3
0
37
1.16
25984969--25985012
22
2.0
22
95
0
79
27
18
20
34
1.96
25987829--25987986
43
3.7
44
77
12
123
22
18
29
29
1.97
25989190--25989222
17
2.0
17
88
5
50
33
9
0
57
1.30
25989559--25989763
46
4.5
46
86
4
270
21
20
11
46
1.82
25989735--25989858
45
2.8
45
82
2
160
25
20
16
37
1.93
25991544--25991591
11
4.2
11
79
10
51
62
2
0
35
1.07
25991828--25991900
30
2.4
29
79
4
74
28
19
4
47
1.67
25993580--25993622
20
2.1
21
83
12
54
4
23
0
72
1.04
25995475--25995524
21
2.4
21
71
15
50
18
16
20
46
1.85
25999454--25999779
165
2.0
160
84
6
424
39
13
12
34
1.83
26013077--26013109
12
2.8
12
82
17
50
0
18
0
81
0.68
26014099--26014132
14
2.4
14
90
0
50
67
5
2
23
1.26
26015564--26015590
14
1.9
14
100
0
54
44
0
0
55
0.99
26015769--26015826
28
2.0
29
86
3
82
46
3
8
41
1.51
26015887--26015911
13
1.9
13
100
0
50
60
0
0
40
0.97
26020614--26020664
24
2.1
24
88
0
75
47
1
11
39
1.52
26024601--26024647
21
2.2
21
96
0
85
0
57
21
21
1.41
26030156--26030226
9
7.6
9
76
9
70
30
1
19
47
1.58
26030407--26031373
240
4.0
241
96
0
1803
32
14
17
34
1.91
26031496--26031545
23
2.2
23
96
0
91
34
14
16
36
1.88
26033068--26033096
6
5.0
6
91
8
51
82
0
0
17
0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26035084--26035173
42
2.2
40
82
9
103
21
16
20
42
1.89
26035348--26035401
21
2.6
21
91
5
83
44
38
0
16
1.48
26035348--26035408
21
2.9
21
87
4
70
45
37
0
16
1.47
26035347--26035470
28
4.4
28
75
12
94
46
37
0
14
1.50
26035515--26035590
7
10.9
7
72
10
57
46
34
1
18
1.58
26035694--26035743
7
7.1
7
81
0
55
54
30
2
14
1.51
26035686--26035759
21
3.5
20
76
7
76
50
32
1
16
1.54
26035705--26035759
7
7.9
7
81
0
56
50
34
0
14
1.43
26036122--26036185
14
4.5
13
78
9
56
46
32
0
20
1.51
26036158--26036192
15
2.3
15
90
0
52
42
37
0
20
1.52
26036110--26036194
28
3.0
29
76
10
77
48
30
1
20
1.57
26043018--26043210
47
4.0
48
79
10
180
23
16
28
31
1.96
26043022--26043229
93
2.1
97
79
10
221
25
16
28
29
1.97
26046014--26046065
10
5.1
10
83
2
59
23
5
1
69
1.20
26049754--26049859
5
20.6
5
74
12
81
22
3
0
72
1.06
26049785--26049858
27
2.6
30
85
8
100
22
2
1
72
1.04
26049759--26049887
57
2.2
57
82
6
136
24
4
2
68
1.21
26051812--26051845
10
3.4
10
91
0
50
26
5
0
67
1.13
26055046--26055119
36
2.1
36
97
0
139
43
20
10
25
1.84
26056350--26056417
9
7.4
9
73
14
50
66
1
4
27
1.20
26057062--26057142
31
2.6
31
88
0
117
28
16
14
40
1.88
26058755--26058800
11
3.9
12
77
13
51
23
8
0
67
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26058750--26058800
23
2.3
22
83
10
59
23
7
0
68
1.15
26058972--26059016
13
3.5
14
77
17
53
31
8
0
60
1.28
26063290--26063323
17
2.0
17
94
0
59
50
0
0
50
1.00
26064010--26064048
18
2.2
17
86
13
53
38
0
0
61
0.96
26067278--26067311
4
8.5
4
93
0
59
50
23
23
2
1.63
26070518--26070551
5
6.8
5
100
0
68
20
0
61
17
1.34
26071033--26071080
20
2.3
20
76
13
53
52
6
2
39
1.39
26071729--26071789
30
2.0
30
96
0
113
40
11
14
32
1.82
26074030--26074081
22
2.4
22
83
3
61
50
0
5
44
1.26
26074073--26074130
30
1.9
30
96
0
107
51
0
0
48
1.00
26074054--26074132
30
2.6
30
86
6
106
51
0
1
46
1.08
26074078--26074142
30
2.2
30
83
5
78
55
0
0
44
0.99
26075557--26075664
56
1.9
56
86
0
153
21
41
16
20
1.90
26077257--26077281
1
25.0
1
100
0
50
100
0
0
0
0.00
26078737--26078779
21
2.0
21
86
0
59
46
4
9
39
1.57
26079427--26079469
12
3.7
11
79
11
50
62
0
0
37
0.95
26083425--26083472
5
9.6
5
100
0
96
39
0
0
60
0.97
26083521--26083596
12
6.4
11
74
17
55
71
2
25
1
1.07
26084280--26084323
17
2.6
17
79
13
54
40
0
20
38
1.53
26093758--26093793
17
2.1
17
89
5
54
63
0
8
27
1.23
26101478--26101521
17
2.5
17
85
3
52
70
2
4
22
1.17
26101565--26101633
22
3.0
21
77
12
66
72
1
4
21
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26101643--26101803
3
55.0
3
66
11
57
59
1
8
30
1.38
26101653--26101693
16
2.5
17
88
4
57
60
2
7
29
1.36
26105166--26105218
18
2.7
21
82
14
76
32
1
7
58
1.37
26105166--26105218
19
2.7
20
85
14
74
32
1
7
58
1.37
26105166--26105217
20
2.6
19
88
11
70
32
1
7
57
1.38
26106761--26106842
41
2.1
40
86
10
125
63
3
10
21
1.42
26108984--26109047
29
2.1
31
83
11
80
35
0
3
60
1.12
26109025--26109049
8
3.1
8
100
0
50
24
0
0
76
0.80
26109065--26109098
2
17.0
2
100
0
68
0
0
50
50
1.00
26109308--26109380
36
2.0
36
100
0
146
50
8
27
13
1.70
26112870--26113036
46
3.6
45
75
13
169
26
19
29
23
1.98
26113056--26113186
49
2.7
49
80
2
138
31
20
25
22
1.98
26116394--26116450
30
1.9
30
82
7
71
43
7
14
35
1.72
26119616--26119655
21
2.0
20
90
5
62
12
37
30
20
1.89
26121864--26121920
5
11.8
5
75
14
57
77
1
1
19
0.95
26130135--26130165
16
1.9
16
93
0
53
51
22
6
19
1.69
26131506--26131561
29
1.9
29
82
7
69
28
14
26
30
1.95
26134163--26134204
18
2.2
20
83
12
52
19
28
35
16
1.93
26138779--26138823
8
5.6
8
81
0
54
44
20
24
11
1.83
26138773--26138823
24
2.1
24
92
0
84
47
17
23
11
1.81
26138779--26138823
16
2.8
16
86
0
63
44
20
24
11
1.83
26139049--26139133
29
2.9
29
82
0
107
29
16
25
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26154783--26155234
127
3.5
127
83
3
532
36
20
15
27
1.93
26157525--26157569
22
2.0
24
91
8
76
8
15
48
26
1.74
26160019--26160070
10
5.1
10
85
2
68
71
0
3
25
1.03
26170757--26170790
16
2.1
16
94
0
59
8
23
14
52
1.69
26178241--26178282
16
2.6
16
88
11
59
19
2
0
78
0.86
26178270--26178298
8
3.8
8
95
4
51
24
6
0
68
1.13
26178241--26178299
20
3.2
18
79
13
59
20
5
0
74
1.00
26180607--26180715
42
2.6
42
79
2
121
30
17
23
28
1.97
26183380--26183494
49
2.3
49
85
2
151
29
21
26
21
1.99
26206020--26206246
117
1.9
117
82
9
286
27
24
22
24
2.00
26207239--26207297
18
3.3
18
75
15
59
18
5
1
74
1.09
26207231--26207309
29
2.8
28
77
11
81
21
3
2
72
1.13
26207463--26207532
22
3.2
22
69
18
74
21
11
12
54
1.69
26207444--26207532
43
2.1
43
100
0
178
22
12
13
51
1.74
26207444--26207511
21
3.2
21
69
19
68
22
13
14
50
1.77
26209840--26209880
6
7.2
6
78
10
50
12
2
2
82
0.86
26209840--26209880
11
3.6
11
87
6
55
12
2
2
82
0.86
26213107--26213171
6
11.8
5
78
15
51
16
1
7
73
1.13
26213107--26213166
18
3.5
17
82
6
68
16
1
8
73
1.16
26213107--26213170
24
2.8
22
84
13
85
15
1
7
75
1.11
26213107--26213170
12
5.7
12
75
13
57
15
1
7
75
1.11
26217071--26217104
17
1.9
18
88
5
52
73
0
0
26
0.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26217155--26217428
148
1.8
151
82
7
362
56
10
1
30
1.42
26220373--26221435
354
3.0
355
98
0
2049
33
20
17
27
1.95
26229180--26229208
14
2.1
14
100
0
58
27
13
13
44
1.82
26234059--26234133
9
8.6
9
72
11
66
66
1
4
28
1.17
26234059--26234133
19
4.3
18
83
6
84
66
1
4
28
1.17
26234416--26234492
20
4.0
19
73
14
59
35
0
2
62
1.09
26243835--26244013
92
1.9
94
89
4
283
25
1
16
56
1.47
26243921--26244350
110
4.0
109
82
7
484
26
1
14
58
1.44
26243751--26244331
203
2.8
207
84
7
704
25
1
14
58
1.44
26244014--26244331
101
3.0
101
81
9
370
26
1
13
58
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295